187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05816 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05816  hypothetical protein  100 
 
 
382 aa  772    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000182  Zn-dependent protease  84.17 
 
 
360 aa  553  1e-156  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.273834  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1762  putative peptidase  71.11 
 
 
360 aa  535  1e-151  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.0051203  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0483  hypothetical protein  66.94 
 
 
360 aa  466  9.999999999999999e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000119997  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0595  peptidase M50  63.9 
 
 
374 aa  441  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4142  peptidase M50  64.29 
 
 
380 aa  436  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.452732 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3980  peptidase M50  63.59 
 
 
390 aa  435  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0828  peptidase M50  64.02 
 
 
380 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000017367 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3453  peptidase M50  64.52 
 
 
374 aa  432  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.444039  hitchhiker  0.00898971 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3533  peptidase M50  64.02 
 
 
380 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0103941  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3232  peptidase M50  63.61 
 
 
392 aa  432  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3167  peptidase M50  64.89 
 
 
378 aa  434  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0803  peptidase M50  64.02 
 
 
380 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0835  peptidase M50  64.02 
 
 
380 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0823  hypothetical protein  65.05 
 
 
374 aa  429  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3275  peptidase M50  64.52 
 
 
374 aa  431  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.01208 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0672  peptidase M50  62.63 
 
 
389 aa  430  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0458569 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0537  peptidase M50  61.11 
 
 
378 aa  421  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2980  peptidase M50  61.32 
 
 
393 aa  420  1e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0270746  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0566  hypothetical protein  61.35 
 
 
370 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0686  peptidase M50  59.84 
 
 
390 aa  409  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.393797  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0786  M50 family peptidase  60.87 
 
 
344 aa  401  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0883958  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3312  gamma-glutamyl phosphate reductase GPR  44.6 
 
 
364 aa  214  1.9999999999999998e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700873 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3701  peptidase M50  36.6 
 
 
484 aa  142  9e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3580  peptidase M50  36.2 
 
 
489 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3720  peptidase M50  36.63 
 
 
485 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.115369  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3646  peptidase M50  36.27 
 
 
485 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.415625  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2946  peptidase M50  27.68 
 
 
313 aa  90.5  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000715843  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1570  hypothetical protein  34.73 
 
 
365 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0569959  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1355  hypothetical protein  34.73 
 
 
365 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1329  membrane metalloprotease  34.73 
 
 
365 aa  88.2  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1538  hypothetical protein  34.73 
 
 
365 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000573699 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1465  hypothetical protein  34.73 
 
 
365 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1608  hypothetical protein  34.73 
 
 
365 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000145815  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3843  hypothetical protein  34.73 
 
 
365 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0912094  hitchhiker  0.00000000235959 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1166  peptidase M50  34.62 
 
 
366 aa  87  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.59725  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1502  hypothetical protein  34.73 
 
 
365 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1370  peptidase M50  34.73 
 
 
365 aa  86.7  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00911747  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1328  membrane metalloprotease  34.13 
 
 
365 aa  86.3  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.826194  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1818  peptidase M50  28.36 
 
 
293 aa  82  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000422753  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4923  peptidase M50  32.47 
 
 
373 aa  80.9  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.465017 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2201  peptidase M50  32.72 
 
 
375 aa  79.7  0.00000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4579  peptidase M50  27.49 
 
 
305 aa  76.6  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2535  peptidase M50  42.73 
 
 
373 aa  76.3  0.0000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.180251  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3626  peptidase M50  29.41 
 
 
368 aa  73.2  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.721542 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0558  peptidase M50  35.65 
 
 
372 aa  72.8  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.463996  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3191  peptidase M50  37.98 
 
 
375 aa  70.1  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00586872 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2637  peptidase M50  31.79 
 
 
378 aa  70.1  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.599853  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0540  peptidase M50  31.01 
 
 
364 aa  69.7  0.00000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1988  peptidase M50  33.33 
 
 
373 aa  68.9  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.319732 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3165  peptidase M50  32.39 
 
 
376 aa  68.6  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49052  predicted protein  26.9 
 
 
386 aa  68.6  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.735615  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0613  peptidase M50  31.71 
 
 
361 aa  68.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190222  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3750  peptidase M50  29.45 
 
 
372 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69281  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2136  peptidase M50  33.33 
 
 
415 aa  67.8  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.821665  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2237  peptidase M50  32.8 
 
 
359 aa  66.6  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.949585  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5036  peptidase M50  34.35 
 
 
413 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.206475 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0318  CBS domain-containing protein  30.95 
 
 
370 aa  66.6  0.0000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1497  peptidase M50  31.88 
 
 
372 aa  66.6  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120961  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2305  peptidase M50  30.34 
 
 
362 aa  65.1  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00177185  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2396  peptidase M50  32.23 
 
 
239 aa  63.9  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311276  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1032  peptidase M50  29.55 
 
 
395 aa  63.9  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0615226 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1797  peptidase M50  33.6 
 
 
397 aa  63.9  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1872  peptidase M50  34.78 
 
 
373 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1337  peptidase M50  34.96 
 
 
412 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13940  Zn-dependent protease  28.18 
 
 
379 aa  63.5  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.909069 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2627  peptidase M50  31.52 
 
 
405 aa  63.5  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1479  peptidase M50  32.56 
 
 
384 aa  63.5  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0658829  normal  0.564629 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1449  peptidase M50  34.01 
 
 
337 aa  63.5  0.000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0709676 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1181  peptidase M50  27.98 
 
 
379 aa  63.2  0.000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.22871  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1457  peptidase M50  31.1 
 
 
417 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0694  peptidase M50  32.03 
 
 
366 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1483  peptidase M50  31.1 
 
 
417 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.511598  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2124  peptidase M50  32.69 
 
 
284 aa  62.8  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000917211  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0769  protease family protein  31.9 
 
 
380 aa  61.6  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000172815  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2524  hypothetical protein  31.15 
 
 
241 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0445127  hitchhiker  0.00571488 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2595  peptidase M50  27.32 
 
 
337 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0459  peptidase M50  37.17 
 
 
342 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0769405  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0613  peptidase M50  37.84 
 
 
380 aa  61.2  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.750705  normal  0.0786713 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0155  peptidase M50  37.04 
 
 
392 aa  61.2  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0700  peptidase M50  35.48 
 
 
370 aa  60.8  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1434  CBS domain-containing protein  30.13 
 
 
336 aa  61.2  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1856  peptidase M50  32.89 
 
 
377 aa  61.2  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2354  peptidase M50  30.83 
 
 
386 aa  60.8  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.176917 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_675  protease  31.9 
 
 
380 aa  60.1  0.00000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159772  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0170  CBS domain-containing protein  34.17 
 
 
343 aa  60.1  0.00000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.356486  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0774  M50 family metallopeptidase  33.33 
 
 
370 aa  59.3  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0669  stage IV sporulation protein FB  27.6 
 
 
286 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000475668  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2181  hypothetical protein  31.76 
 
 
403 aa  59.3  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.392153 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1185  peptidase M50  31.97 
 
 
338 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3297  peptidase M50  31.97 
 
 
258 aa  58.9  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.153314  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4292  peptidase M50  29.53 
 
 
286 aa  59.3  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0832  peptidase M50  30.61 
 
 
370 aa  58.9  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4785  peptidase M50  39.17 
 
 
373 aa  58.9  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.384856  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3043  peptidase M50  28.57 
 
 
241 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.216443  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5323  peptidase M50  28.57 
 
 
241 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4945  peptidase M50  29.75 
 
 
241 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.365281  normal  0.0922667 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4342  peptidase M50  32.03 
 
 
291 aa  57.8  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_680  metallopeptidase, M50 family  34.15 
 
 
371 aa  57.8  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0373838  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0222  peptidase M50  29.87 
 
 
394 aa  57.8  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>