203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3114 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3114  sterol-regulatory element-binding protein intramembrane protease  100 
 
 		 598 aa  1214    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.896096  normal  0.810156 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0248  peptidase M50  55.61 
 
 		 584 aa  650    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000540477  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0172  peptidase M50  36.67 
 
 		 518 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3477  peptidase M50  29.17 
 
 		 607 aa  231  3e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1973  peptidase M50  28.46 
 
 		 603 aa  217  5e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.246801  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1683  peptidase M50  27.57 
 
 		 623 aa  203  8e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.200321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1508  peptidase M50  30.06 
 
 		 612 aa  196  1e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1292  peptidase M50  26.24 
 
 		 587 aa  162  2e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.894825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1942  peptidase M50  28.78 
 
 		 432 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.718786 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0314  peptidase M50  29.08 
 
 		 512 aa  146  1e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0964  peptidase M50  29.91 
 
 		 459 aa  139  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1215  peptidase M50  30.67 
 
 		 430 aa  134  5e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.285104  normal  0.0156035 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0503  peptidase M50  31.46 
 
 		 443 aa  134  6e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1487  hypothetical protein  30.5 
 
 		 441 aa  125  2e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000349158  normal  0.0156065 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0083  peptidase M50  27.37 
 
 		 616 aa  107  8e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0864  peptidase M50  27.35 
 
 		 380 aa  80.1  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1174  peptidase M50  26.95 
 
 		 375 aa  71.6  0.00000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0107  peptidase M50  24.28 
 
 		 398 aa  70.9  0.00000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000498394 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0892  membrane-associated zinc metalloprotease  23.97 
 
 		 439 aa  70.5  0.00000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000122441  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1066  peptidase M50  26.44 
 
 		 364 aa  68.6  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.754644  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1001  membrane-associated zinc metalloprotease  22.99 
 
 		 438 aa  68.6  0.0000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1749  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  23.32 
 
 		 455 aa  68.2  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.853109  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0568  hypothetical protein  25.05 
 
 		 450 aa  66.2  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0664  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  21.74 
 
 		 455 aa  65.9  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.399038  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0781  peptidase M50  25.91 
 
 		 375 aa  65.9  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0544  hypothetical protein  24.38 
 
 		 475 aa  64.3  0.000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.82 
 
 		 458 aa  63.2  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.3628  normal  0.340979 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1169  peptidase M50  24.07 
 
 		 375 aa  62.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0862  peptidase RseP  26.01 
 
 		 380 aa  62.4  0.00000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1506  peptidase M50  24.15 
 
 		 375 aa  62.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3274  membrane-associated zinc metalloprotease  23.15 
 
 		 461 aa  62.4  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000455239  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0845  peptidase M50  25.97 
 
 		 418 aa  62  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.450162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1331  membrane-associated zinc metalloprotease  24.02 
 
 		 462 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1436  membrane-associated zinc metalloprotease  30.59 
 
 		 338 aa  61.6  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.23212  normal  0.10285 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2045  putative membrane-associated zinc metalloprotease  23.82 
 
 		 462 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1914  membrane-associated zinc metalloprotease  23.61 
 
 		 462 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0981  peptidase RseP  24.08 
 
 		 443 aa  57.8  0.0000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.238067  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1852  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  25.54 
 
 		 383 aa  57.8  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0681454 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1490  membrane-associated zinc metalloprotease  22.65 
 
 		 453 aa  57.8  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0719  putative membrane-associated zinc metalloprotease  23.47 
 
 		 366 aa  57.4  0.0000007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1961  membrane-associated zinc metalloprotease  24.08 
 
 		 469 aa  55.5  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2171  membrane-associated zinc metalloprotease  22.91 
 
 		 454 aa  55.5  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661507  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5322  peptidase RseP  22.61 
 
 		 456 aa  55.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430006  normal  0.522456 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2448  membrane-associated zinc metalloprotease  22.47 
 
 		 461 aa  55.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.699947  hitchhiker  0.00215564 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1689  peptidase RseP  23.08 
 
 		 461 aa  55.1  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.439361  normal  0.213094 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1874  peptidase RseP  24.32 
 
 		 463 aa  54.7  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1256  putative membrane-associated zinc metalloprotease  23.82 
 
 		 450 aa  54.7  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000401781  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1070  putative membrane-associated zinc metalloprotease  23.17 
 
 		 380 aa  54.3  0.000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2715  membrane-associated zinc metalloprotease  25.83 
 
 		 376 aa  53.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0118  RIP metalloprotease RseP  20.35 
 
 		 433 aa  53.5  0.00001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1160  protease Do  26.42 
 
 		 498 aa  53.5  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000336016  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2013  protease Do  26.26 
 
 		 524 aa  53.1  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4075  membrane-associated zinc metalloprotease  23.47 
 
 		 450 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.274449 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0977  protease do  24.53 
 
 		 471 aa  52.8  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12761  membrane-associated Zn-dependent protease 1  25.1 
 
 		 365 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0131503 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2621  membrane-associated zinc metalloprotease  25 
 
 		 430 aa  52.8  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0313354  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1665  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  24.53 
 
 		 335 aa  52.4  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1904  HtrA2 peptidase  36.78 
 
 		 423 aa  52.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  0.334422 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0616  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.36 
 
 		 339 aa  52.8  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4633  membrane-associated zinc metalloprotease  21.52 
 
 		 488 aa  52.8  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1285  periplasmic serine protease Do; heat shock protein HtrA  35.62 
 
 		 466 aa  52  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1284  periplasmic serine protease Do; heat shock protein HtrA  35.62 
 
 		 466 aa  52  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1277  putative membrane-associated zinc metalloprotease  23.39 
 
 		 456 aa  52  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.358202  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2808  peptidase RseP  23.64 
 
 		 456 aa  52.4  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000246609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07740  putative membrane-associated zinc metalloprotease  24.29 
 
 		 357 aa  52  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1541  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  23.96 
 
 		 450 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.521262  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0815  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  23.78 
 
 		 454 aa  51.6  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.225956  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3261  membrane-associated zinc metalloprotease  24.35 
 
 		 383 aa  52  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1264  membrane-associated zinc metalloprotease  24.34 
 
 		 456 aa  51.6  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3676  peptidase S1C, Do  24.84 
 
 		 503 aa  50.8  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.769411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1705  membrane-associated zinc metalloprotease  26.32 
 
 		 353 aa  50.8  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1782  membrane-associated zinc metalloprotease  24.48 
 
 		 377 aa  50.8  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17140  putative membrane-associated zinc metalloprotease  23.59 
 
 		 450 aa  50.8  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1447  membrane-associated zinc metalloprotease  21.68 
 
 		 469 aa  50.1  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.843225  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2149  2-alkenal reductase  28.32 
 
 		 412 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0134489  hitchhiker  0.00552688 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1636  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  23.44 
 
 		 456 aa  50.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  26 
 
 		 478 aa  50.4  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1589  membrane-associated zinc metalloprotease  23.33 
 
 		 375 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2518  zinc metallopeptidase  26.52 
 
 		 373 aa  50.1  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.436086  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3154  putative membrane-associated zinc metalloprotease  24.36 
 
 		 461 aa  49.7  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000101225  hitchhiker  0.00850689 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1380  peptidase M50  24.31 
 
 		 388 aa  49.7  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.338907  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1166  membrane-associated zinc metalloprotease  21 
 
 		 454 aa  49.7  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351032  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0988  protease Do  27.06 
 
 		 503 aa  49.3  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0294533 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1279  putative membrane-associated zinc metalloprotease  21.74 
 
 		 448 aa  49.3  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.196606  normal  0.702874 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1490  RIP metalloprotease RseP  23.43 
 
 		 450 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0410  protease Do  27.27 
 
 		 474 aa  49.3  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.134213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0601  PDZ/DHR/GLGF  40 
 
 		 361 aa  49.3  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.367147  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1947  putative membrane-associated zinc metalloprotease  24.53 
 
 		 335 aa  49.7  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2701  peptidase RseP  22.7 
 
 		 456 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000971838  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  33.87 
 
 		 459 aa  49.3  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4510  putative Zinc metalloprotease  25.12 
 
 		 383 aa  49.3  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7809  serine protease do-like precursor  25.47 
 
 		 473 aa  49.3  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0707872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  33.87 
 
 		 459 aa  49.3  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1560  membrane-associated zinc metalloprotease EcfE  25.83 
 
 		 452 aa  48.5  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.294155  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1701  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  23.73 
 
 		 383 aa  48.9  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.581219  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0052  serine protease  26.45 
 
 		 483 aa  48.9  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292411 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2634  peptidase RseP  23.12 
 
 		 456 aa  48.9  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113842  normal  0.0898661 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2259  protease Do  22.75 
 
 		 492 aa  48.9  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.661037  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2995  peptidase RseP  24.21 
 
 		 430 aa  48.1  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.207005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  30.26 
 
 		 504 aa  48.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>