179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0107 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0107  peptidase M50  100 
 
 
398 aa  791    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000498394 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0864  peptidase M50  27.95 
 
 
380 aa  137  2e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2160  peptidase M50  29.09 
 
 
362 aa  114  3e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000514306 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0845  peptidase M50  28.7 
 
 
418 aa  107  3e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.450162  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1066  peptidase M50  26.6 
 
 
364 aa  107  5e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.754644  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0503  peptidase M50  24.3 
 
 
443 aa  90.1  6e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1942  peptidase M50  25 
 
 
432 aa  89.4  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.718786 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0964  peptidase M50  25.15 
 
 
459 aa  88.6  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0248  peptidase M50  24.32 
 
 
584 aa  77.4  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000540477  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1487  hypothetical protein  23.51 
 
 
441 aa  75.5  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000349158  normal  0.0156065 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1973  peptidase M50  28.8 
 
 
603 aa  73.9  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.246801  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1215  peptidase M50  27.88 
 
 
430 aa  72  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.285104  normal  0.0156035 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3114  sterol-regulatory element-binding protein intramembrane protease  24.09 
 
 
598 aa  68.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.896096  normal  0.810156 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1508  peptidase M50  35.06 
 
 
612 aa  68.6  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1436  membrane-associated zinc metalloprotease  25.4 
 
 
338 aa  64.7  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.23212  normal  0.10285 
 
 
-
 
NC_002978  WD1086  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  24.62 
 
 
372 aa  62.4  0.00000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.147315  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3477  peptidase M50  26.84 
 
 
607 aa  62.8  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1169  peptidase M50  27.78 
 
 
375 aa  62.8  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0172  peptidase M50  20.76 
 
 
518 aa  61.6  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1696  peptidase M50  37.62 
 
 
509 aa  61.6  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.156328 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0314  peptidase M50  42.86 
 
 
512 aa  61.6  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1683  peptidase M50  23.43 
 
 
623 aa  61.6  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.200321  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0781  peptidase M50  26.14 
 
 
375 aa  61.2  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1506  peptidase M50  25.76 
 
 
375 aa  58.9  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1380  peptidase M50  28.69 
 
 
388 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.338907  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1174  peptidase M50  29.49 
 
 
375 aa  57.8  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3643  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.38 
 
 
418 aa  56.2  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3861  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  25 
 
 
420 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3832  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25 
 
 
418 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.5484300000000005e-61 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3671  membrane-associated zinc metalloprotease  25 
 
 
420 aa  54.3  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3561  membrane-associated zinc metalloprotease  25 
 
 
420 aa  54.3  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3579  membrane-associated zinc metalloprotease  25 
 
 
420 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3958  membrane-associated zinc metalloprotease  25 
 
 
420 aa  54.3  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3867  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25 
 
 
418 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.18687  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  36.25 
 
 
474 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  36.25 
 
 
474 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0717  peptidase M50  37.36 
 
 
497 aa  53.9  0.000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2041  protease Do  35.8 
 
 
480 aa  53.9  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0618  peptidase M50  34 
 
 
502 aa  53.5  0.000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2161  protease Do  32.47 
 
 
524 aa  53.1  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  35.53 
 
 
478 aa  53.1  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1771  peptidase S1C, Do  32.47 
 
 
524 aa  53.1  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0217208  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2238  peptidase M50  36.96 
 
 
502 aa  53.1  0.000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.577346  normal  0.574396 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10940  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  34.68 
 
 
539 aa  52.8  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000345024  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1285  periplasmic serine protease Do; heat shock protein HtrA  31.97 
 
 
466 aa  52.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1284  periplasmic serine protease Do; heat shock protein HtrA  31.97 
 
 
466 aa  52.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2069  protease Do  32.47 
 
 
523 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719287  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3918  putative membrane-associated zinc metalloprotease  24.05 
 
 
418 aa  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.419375  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0083  peptidase M50  26.09 
 
 
616 aa  51.6  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1326  RIP metalloprotease RasP  24.05 
 
 
418 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000504967 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  33.33 
 
 
474 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  33.33 
 
 
504 aa  50.8  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  33.33 
 
 
492 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  33.33 
 
 
477 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0128  protease Do  39.47 
 
 
474 aa  50.4  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.445461  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0951  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.09 
 
 
495 aa  50.1  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000274042  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  33.33 
 
 
477 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0616  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.67 
 
 
339 aa  50.1  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1363  protease DO  34.57 
 
 
472 aa  48.9  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0352  peptidase M50  28.34 
 
 
345 aa  49.3  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0100  protease DO  35.58 
 
 
456 aa  49.7  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000901293  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1705  membrane-associated zinc metalloprotease  28.04 
 
 
353 aa  49.3  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0497  protease DO  33.33 
 
 
472 aa  49.3  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0231688  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1292  peptidase M50  29.6 
 
 
587 aa  48.5  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.894825  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1405  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  22.65 
 
 
345 aa  48.5  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5038  serine protease  32.95 
 
 
464 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.431803  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0796  membrane-associated zinc metalloprotease  22.61 
 
 
348 aa  48.9  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.270174  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1158  HtrA2 peptidase  36.84 
 
 
408 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.201406  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0977  protease do  37.97 
 
 
471 aa  48.1  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1398  protease Do  36.36 
 
 
496 aa  48.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4494  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.59 
 
 
496 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.18457  normal  0.102663 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2979  protease Do  34.12 
 
 
511 aa  48.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.037466  normal  0.016499 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  32.94 
 
 
513 aa  48.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2356  membrane-associated zinc metalloprotease  25 
 
 
361 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13730  HtrA serine protease  30.77 
 
 
473 aa  47.8  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2406  membrane-associated zinc metalloprotease  25 
 
 
361 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.738258  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2993  protease Do  28.43 
 
 
476 aa  47.8  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.700896 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0180  zinc metallopeptidase RseP  25 
 
 
450 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000271457  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1742  serine protease  34.57 
 
 
461 aa  47.4  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.378867  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0388  protease Do  34.57 
 
 
461 aa  47.4  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1874  peptidase RseP  21.46 
 
 
463 aa  47  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2386  protease Do  30.38 
 
 
491 aa  47  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1242  protease DO  33.33 
 
 
472 aa  47  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000225025  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23570  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  40.38 
 
 
356 aa  46.6  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.127654  normal  0.0171922 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0807  membrane-associated Zn-dependent protease 1  24.79 
 
 
418 aa  46.6  0.0007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000234706  hitchhiker  0.000000563759 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  30.77 
 
 
404 aa  46.6  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  30.77 
 
 
404 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1391  peptidase S1C, Do  32.95 
 
 
496 aa  46.2  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  35.29 
 
 
500 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4242  peptidase S1C, Do  34.25 
 
 
500 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3784  protease Do  34.67 
 
 
492 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2323  peptidase S1C, Do  32.95 
 
 
463 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.052989  normal  0.164438 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2247  ATPase  32.91 
 
 
464 aa  45.8  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000505452  normal  0.0343548 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3676  peptidase S1C, Do  28.12 
 
 
503 aa  46.2  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.769411  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4861  protease Do  34.67 
 
 
492 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.837631 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2728  membrane-associated zinc metalloprotease  24.11 
 
 
362 aa  45.8  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1127  2-alkenal reductase  37.68 
 
 
408 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  32.91 
 
 
479 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2507  protease Do  29.03 
 
 
461 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0254484  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2046  protease Do  30.68 
 
 
525 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.858833  normal  0.0343309 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>