184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0964 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0964  peptidase M50  100 
 
 
459 aa  927    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1942  peptidase M50  51.52 
 
 
432 aa  492  9.999999999999999e-139  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.718786 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0503  peptidase M50  53.2 
 
 
443 aa  424  1e-117  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1215  peptidase M50  49 
 
 
430 aa  404  1e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.285104  normal  0.0156035 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1487  hypothetical protein  41.3 
 
 
441 aa  299  8e-80  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000349158  normal  0.0156065 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0172  peptidase M50  28.86 
 
 
518 aa  147  5e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3114  sterol-regulatory element-binding protein intramembrane protease  30.42 
 
 
598 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.896096  normal  0.810156 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0248  peptidase M50  29.8 
 
 
584 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000540477  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3477  peptidase M50  32.84 
 
 
607 aa  124  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0083  peptidase M50  32.23 
 
 
616 aa  118  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1973  peptidase M50  33.33 
 
 
603 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.246801  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1508  peptidase M50  32.51 
 
 
612 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1683  peptidase M50  31.84 
 
 
623 aa  109  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.200321  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1292  peptidase M50  33.07 
 
 
587 aa  103  7e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.894825  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0864  peptidase M50  26.6 
 
 
380 aa  102  2e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0845  peptidase M50  33.51 
 
 
418 aa  93.2  8e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.450162  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0107  peptidase M50  25.74 
 
 
398 aa  89  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000498394 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0314  peptidase M50  26.87 
 
 
512 aa  85.1  0.000000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1066  peptidase M50  32.02 
 
 
364 aa  82.4  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.754644  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0616  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.8 
 
 
339 aa  76.3  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1436  membrane-associated zinc metalloprotease  25.48 
 
 
338 aa  73.9  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.23212  normal  0.10285 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0781  peptidase M50  27 
 
 
375 aa  72.8  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0796  membrane-associated zinc metalloprotease  25.72 
 
 
348 aa  72.4  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.270174  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1506  peptidase M50  25.67 
 
 
375 aa  69.7  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1169  peptidase M50  25.9 
 
 
375 aa  67  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2160  peptidase M50  29.56 
 
 
362 aa  67  0.0000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000514306 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3701  membrane-associated zinc metalloprotease  24.44 
 
 
354 aa  66.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000133266  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0587  membrane-associated zinc metalloprotease  24.14 
 
 
347 aa  66.2  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1914  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  24.08 
 
 
355 aa  64.3  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1174  peptidase M50  24.84 
 
 
375 aa  63.9  0.000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1070  putative membrane-associated zinc metalloprotease  23.62 
 
 
380 aa  63.5  0.000000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1061  membrane-associated zinc metalloprotease  22.83 
 
 
352 aa  63.2  0.000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1234  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  24.53 
 
 
350 aa  63.2  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0596  membrane-associated zinc metalloprotease  25.77 
 
 
337 aa  62.4  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2051  putative membrane-associated zinc metalloprotease  23.78 
 
 
372 aa  62.4  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00103431  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3726  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.45 
 
 
355 aa  61.2  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1380  peptidase M50  24.55 
 
 
388 aa  60.8  0.00000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.338907  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1257  peptidase RseP  22.83 
 
 
355 aa  60.5  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000258691  hitchhiker  0.00178972 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1387  peptidase RseP  27.27 
 
 
379 aa  59.7  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0493232  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1948  membrane-associated zinc metalloprotease  25.63 
 
 
356 aa  58.5  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1947  putative membrane-associated zinc metalloprotease  24.5 
 
 
335 aa  57.8  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0862  peptidase RseP  23.24 
 
 
380 aa  57.4  0.0000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3643  putative membrane-associated zinc metalloprotease  24.22 
 
 
418 aa  57.4  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12885  transmembrane protein  24.1 
 
 
404 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.769587 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1148  membrane-associated zinc metalloprotease  26.01 
 
 
419 aa  56.2  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0330483  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1782  membrane-associated zinc metalloprotease  22.1 
 
 
377 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0892  membrane-associated zinc metalloprotease  27.35 
 
 
439 aa  55.1  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3629  peptidase M50  25.41 
 
 
325 aa  55.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1665  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  24.17 
 
 
335 aa  55.1  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2040  membrane-associated zinc metalloprotease  25.79 
 
 
417 aa  54.3  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1696  peptidase M50  23.51 
 
 
509 aa  54.3  0.000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.156328 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3203  membrane-associated zinc metalloprotease  23.81 
 
 
341 aa  54.3  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000432825  hitchhiker  0.00000345421 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4510  putative Zinc metalloprotease  22.12 
 
 
383 aa  54.3  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2728  membrane-associated zinc metalloprotease  22.6 
 
 
362 aa  54.3  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0714  zinc metallopeptidase RseP  27.63 
 
 
450 aa  53.9  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000864253  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2601  peptidase M50  26.26 
 
 
392 aa  54.3  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0673098  normal  0.583833 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1705  membrane-associated zinc metalloprotease  23.15 
 
 
353 aa  53.9  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0890  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  22.51 
 
 
343 aa  53.9  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000919526  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3671  membrane-associated zinc metalloprotease  23.92 
 
 
420 aa  53.5  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3958  membrane-associated zinc metalloprotease  23.92 
 
 
420 aa  53.5  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09990  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  25.71 
 
 
402 aa  53.1  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.417947  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1037  serine protease  36.23 
 
 
373 aa  53.1  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0643787  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0245  zinc metallopeptidase RseP  25.24 
 
 
450 aa  53.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00582579  normal  0.54526 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1405  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  22.62 
 
 
345 aa  52.8  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_907  serine protease, DegP/HtrA family  36.23 
 
 
377 aa  52.8  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000696598  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4075  membrane-associated zinc metalloprotease  25.21 
 
 
450 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.274449 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3315  membrane-associated zinc metalloprotease  22.4 
 
 
342 aa  52.8  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000939157  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3832  putative membrane-associated zinc metalloprotease  23.14 
 
 
418 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.5484300000000005e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3861  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  23.14 
 
 
420 aa  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3561  membrane-associated zinc metalloprotease  23.14 
 
 
420 aa  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3579  membrane-associated zinc metalloprotease  23.14 
 
 
420 aa  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0248  zinc metallopeptidase RseP  25.24 
 
 
450 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3867  putative membrane-associated zinc metalloprotease  23.14 
 
 
418 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.18687  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0261  zinc metallopeptidase RseP  25.24 
 
 
450 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.522145 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07740  putative membrane-associated zinc metalloprotease  23.22 
 
 
357 aa  52  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2433  membrane-associated Zn-dependent protease 1  26.29 
 
 
428 aa  52  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2261  peptidase M50  24.35 
 
 
412 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.240439  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3918  putative membrane-associated zinc metalloprotease  22.44 
 
 
418 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.419375  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0263  zinc metallopeptidase RseP  25.24 
 
 
450 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0154737  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1653  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25 
 
 
332 aa  52  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2836  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.51 
 
 
365 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000950908  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0245  zinc metallopeptidase RseP  25.24 
 
 
450 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.249878 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1211  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  23.96 
 
 
368 aa  51.6  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2715  membrane-associated zinc metalloprotease  26.3 
 
 
376 aa  51.2  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1108  peptidase RseP  27.43 
 
 
450 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.200515  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1153  membrane-associated zinc metalloprotease  24.79 
 
 
450 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386407  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1785  putative membrane-associated zinc metalloprotease  24.19 
 
 
367 aa  51.6  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1326  RIP metalloprotease RasP  22.44 
 
 
418 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000504967 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  22.8 
 
 
347 aa  51.2  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1589  membrane-associated zinc metalloprotease  22.54 
 
 
375 aa  51.6  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2118  peptidase M50  24.58 
 
 
408 aa  50.8  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.435784  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1541  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  26.29 
 
 
450 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.521262  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1786  membrane-associated zinc metalloprotease  23.7 
 
 
337 aa  50.4  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.250325  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0655  putative membrane-associated zinc metalloprotease  23.36 
 
 
368 aa  50.8  0.00006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0246  membrane-associated Zn-dependent protease 1  24.1 
 
 
420 aa  50.4  0.00007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0481  putative membrane-associated zinc metalloprotease  23.85 
 
 
355 aa  50.4  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7315  membrane-associated Zn-dependent protease 1- like protein  24.54 
 
 
431 aa  50.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3046  putative membrane-associated zinc metalloprotease  23.53 
 
 
450 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1560  membrane-associated zinc metalloprotease EcfE  24.57 
 
 
452 aa  50.1  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.294155  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0618  peptidase M50  22.97 
 
 
502 aa  50.1  0.00009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>