135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3477 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3477  peptidase M50  100 
 
 
607 aa  1201    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1508  peptidase M50  68.1 
 
 
612 aa  781    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1973  peptidase M50  50.51 
 
 
603 aa  520  1e-146  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.246801  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1683  peptidase M50  47.34 
 
 
623 aa  520  1e-146  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.200321  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1292  peptidase M50  46.87 
 
 
587 aa  451  1e-125  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.894825  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0083  peptidase M50  41.87 
 
 
616 aa  347  5e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0248  peptidase M50  28.22 
 
 
584 aa  241  4e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000540477  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3114  sterol-regulatory element-binding protein intramembrane protease  29.12 
 
 
598 aa  220  5e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.896096  normal  0.810156 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1942  peptidase M50  33.73 
 
 
432 aa  141  3.9999999999999997e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.718786 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1487  hypothetical protein  36.92 
 
 
441 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000349158  normal  0.0156065 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1215  peptidase M50  31.67 
 
 
430 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.285104  normal  0.0156035 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0503  peptidase M50  38.65 
 
 
443 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0964  peptidase M50  32.84 
 
 
459 aa  124  6e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0172  peptidase M50  35.15 
 
 
518 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0314  peptidase M50  26.06 
 
 
512 aa  99.8  1e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1066  peptidase M50  25.67 
 
 
364 aa  84.7  0.000000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.754644  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2160  peptidase M50  27.9 
 
 
362 aa  81.3  0.00000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000514306 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0864  peptidase M50  29.87 
 
 
380 aa  72.4  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0570  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  25.55 
 
 
451 aa  67  0.0000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114456  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1166  membrane-associated zinc metalloprotease  24.61 
 
 
454 aa  63.9  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351032  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1749  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  29.02 
 
 
455 aa  63.5  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.853109  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0892  membrane-associated zinc metalloprotease  22.75 
 
 
439 aa  63.2  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0845  peptidase M50  28.73 
 
 
418 aa  62.4  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.450162  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0107  peptidase M50  26.84 
 
 
398 aa  62.8  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000498394 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1696  peptidase M50  31.65 
 
 
509 aa  62.4  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.156328 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3998  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.39 
 
 
441 aa  59.3  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.434108 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2238  peptidase M50  32.28 
 
 
502 aa  59.3  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.577346  normal  0.574396 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1948  membrane-associated zinc metalloprotease  27.78 
 
 
356 aa  58.9  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1705  membrane-associated zinc metalloprotease  28.65 
 
 
353 aa  58.5  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1001  membrane-associated zinc metalloprotease  25.76 
 
 
438 aa  58.2  0.0000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1506  peptidase M50  25.33 
 
 
375 aa  57.4  0.0000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1947  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.11 
 
 
335 aa  57  0.0000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2701  peptidase RseP  22.9 
 
 
456 aa  55.8  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000971838  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2808  peptidase RseP  22.9 
 
 
456 aa  55.8  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000246609  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0618  peptidase M50  30.05 
 
 
502 aa  56.2  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1436  membrane-associated zinc metalloprotease  25.71 
 
 
338 aa  55.8  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.23212  normal  0.10285 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1665  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  25.3 
 
 
335 aa  55.1  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2914  membrane-associated zinc metalloprotease  27.71 
 
 
354 aa  55.1  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.123834 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2634  peptidase RseP  22.9 
 
 
456 aa  54.7  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113842  normal  0.0898661 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0781  peptidase M50  25.57 
 
 
375 aa  54.7  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1169  peptidase M50  25.1 
 
 
375 aa  53.9  0.000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1530  peptidase RseP  22.75 
 
 
457 aa  53.5  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00980857 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0180  zinc metallopeptidase RseP  25.89 
 
 
450 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000271457  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3154  putative membrane-associated zinc metalloprotease  22.45 
 
 
461 aa  53.5  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000101225  hitchhiker  0.00850689 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0717  peptidase M50  34.51 
 
 
497 aa  53.5  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1560  membrane-associated zinc metalloprotease EcfE  24.48 
 
 
452 aa  52.8  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.294155  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1161  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.25 
 
 
347 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.472937  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07740  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.21 
 
 
357 aa  52.4  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0664  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  23.54 
 
 
455 aa  52  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.399038  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0467  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.18 
 
 
377 aa  52  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1636  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  22.69 
 
 
456 aa  51.6  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1856  peptidase RseP  24.73 
 
 
454 aa  51.2  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0169  zinc metallopeptidase RseP  25.53 
 
 
450 aa  51.2  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000438283  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3176  membrane-associated zinc metalloprotease  22.81 
 
 
444 aa  51.6  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.836726 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3582  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  27.45 
 
 
561 aa  50.8  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.864637  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0178  zinc metallopeptidase RseP  25.53 
 
 
450 aa  50.4  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111428  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2710  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.55 
 
 
444 aa  50.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0608503  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0222  peptidase M50  36.78 
 
 
394 aa  50.1  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2148  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.79 
 
 
444 aa  50.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1488  putative membrane-associated zinc metalloprotease  23.53 
 
 
456 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000665578  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0187  zinc metallopeptidase RseP  25.89 
 
 
450 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000756829  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00174  zinc metallopeptidase  25.18 
 
 
450 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0881068  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3427  membrane-associated zinc metalloprotease  25.18 
 
 
450 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000034207  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3722  membrane-associated zinc metalloprotease  26.24 
 
 
561 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632001  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1121  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  29.9 
 
 
351 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0347872  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1387  peptidase RseP  25.85 
 
 
379 aa  48.9  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0493232  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00173  hypothetical protein  25.18 
 
 
450 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.131717  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1785  putative membrane-associated zinc metalloprotease  24.85 
 
 
367 aa  49.3  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1355  putative membrane-associated zinc metalloprotease  22.69 
 
 
456 aa  49.3  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000225455  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1380  peptidase M50  25.91 
 
 
388 aa  49.3  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.338907  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2878  putative membrane-associated zinc metalloprotease  22.61 
 
 
456 aa  49.7  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000126252  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3484  zinc metallopeptidase RseP  25.18 
 
 
450 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00175231  normal  0.0731606 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3274  membrane-associated zinc metalloprotease  23.27 
 
 
461 aa  48.9  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000455239  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1589  membrane-associated zinc metalloprotease  28.27 
 
 
375 aa  49.3  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3648  membrane-associated zinc metalloprotease  26.24 
 
 
561 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0186  zinc metallopeptidase RseP  25.18 
 
 
450 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000411751  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1709  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  22.36 
 
 
457 aa  48.5  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.550772  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1387  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.87 
 
 
480 aa  48.9  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.204632  normal  0.0100882 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1174  peptidase M50  51.16 
 
 
375 aa  48.9  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1367  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.17 
 
 
444 aa  48.5  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0141782 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1137  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.29 
 
 
374 aa  48.1  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.615392  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1405  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  25.93 
 
 
345 aa  48.1  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0981  peptidase RseP  21.58 
 
 
443 aa  48.1  0.0005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.238067  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1782  membrane-associated zinc metalloprotease  29.59 
 
 
377 aa  48.1  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0587  membrane-associated zinc metalloprotease  26.37 
 
 
347 aa  48.1  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2518  zinc metallopeptidase  27.06 
 
 
373 aa  48.1  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.436086  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2895  membrane-associated zinc metalloprotease  23.11 
 
 
456 aa  47.8  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000920242  normal  0.27342 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1786  membrane-associated zinc metalloprotease  28.49 
 
 
337 aa  47.8  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.250325  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1011  peptidase M50  57.58 
 
 
404 aa  47.4  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0318  CBS domain-containing protein  36.17 
 
 
370 aa  47.4  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0616  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.61 
 
 
339 aa  47.4  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1122  peptidase RseP  31.43 
 
 
360 aa  47  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0534  peptidase M50  28.1 
 
 
388 aa  46.6  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000573099  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1532  membrane-associated zinc metalloprotease  28.43 
 
 
386 aa  47  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3134  peptidase M50  46.15 
 
 
386 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3158  zinc metallopeptidase RseP  24.3 
 
 
451 aa  46.6  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00293978  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0815  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  24.37 
 
 
454 aa  45.8  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.225956  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2117  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.52 
 
 
354 aa  45.8  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0689  peptidase M50  24.73 
 
 
376 aa  45.8  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000148024  hitchhiker  3.25567e-17 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1181  membrane-associated zinc metalloprotease  29.47 
 
 
351 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>