90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0781 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1169  peptidase M50  93.07 
 
 
375 aa  702    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1506  peptidase M50  94.13 
 
 
375 aa  710    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0781  peptidase M50  100 
 
 
375 aa  748    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1174  peptidase M50  77.6 
 
 
375 aa  585  1e-166  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1380  peptidase M50  56.41 
 
 
388 aa  413  1e-114  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.338907  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0845  peptidase M50  29.26 
 
 
418 aa  99.4  1e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.450162  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0864  peptidase M50  26.45 
 
 
380 aa  93.6  6e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1066  peptidase M50  30.33 
 
 
364 aa  78.6  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.754644  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0964  peptidase M50  27 
 
 
459 aa  72.4  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0503  peptidase M50  34.36 
 
 
443 aa  69.7  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0314  peptidase M50  27.23 
 
 
512 aa  68.2  0.0000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1487  hypothetical protein  25.49 
 
 
441 aa  67  0.0000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000349158  normal  0.0156065 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3114  sterol-regulatory element-binding protein intramembrane protease  25.91 
 
 
598 aa  66.6  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.896096  normal  0.810156 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0248  peptidase M50  24.4 
 
 
584 aa  62.8  0.000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000540477  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0596  membrane-associated zinc metalloprotease  23.76 
 
 
337 aa  61.6  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0107  peptidase M50  26.14 
 
 
398 aa  61.2  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000498394 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1405  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  22.71 
 
 
345 aa  58.5  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0172  peptidase M50  30 
 
 
518 aa  58.5  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1942  peptidase M50  27.67 
 
 
432 aa  55.5  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.718786 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3477  peptidase M50  25.57 
 
 
607 aa  54.7  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2749  membrane-associated zinc metalloprotease  31.51 
 
 
354 aa  54.7  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3701  membrane-associated zinc metalloprotease  32.18 
 
 
354 aa  54.3  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000133266  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1492  membrane-associated zinc metalloprotease  30.82 
 
 
354 aa  53.5  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685355 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1215  peptidase M50  21.36 
 
 
430 aa  53.5  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.285104  normal  0.0156035 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1973  peptidase M50  29.14 
 
 
603 aa  52  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.246801  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1683  peptidase M50  28.12 
 
 
623 aa  50.8  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.200321  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0450  membrane-associated zinc metalloprotease  26.86 
 
 
428 aa  50.1  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000160258  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0260  peptidase M50  30.57 
 
 
496 aa  50.1  0.00007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.650665  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0796  membrane-associated zinc metalloprotease  26.8 
 
 
348 aa  48.5  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.270174  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2117  putative membrane-associated zinc metalloprotease  24.74 
 
 
354 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1326  RIP metalloprotease RasP  27.33 
 
 
418 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000504967 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0618  peptidase M50  32.17 
 
 
502 aa  47.8  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2042  membrane-associated zinc metalloprotease  28.86 
 
 
386 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.101077 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3726  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.44 
 
 
355 aa  47.4  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01122  membrane-associated Zn-dependent protease  26.9 
 
 
448 aa  47.4  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.496446  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3643  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.33 
 
 
418 aa  47.4  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0515  membrane-associated zinc metalloprotease  27.62 
 
 
396 aa  46.6  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0792  peptidase S16 lon domain protein  31.43 
 
 
353 aa  46.6  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.746273  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2136  peptidase M50  29.61 
 
 
415 aa  46.6  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.821665  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1351  peptidase M50  21.93 
 
 
416 aa  46.6  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.365692  normal  0.842339 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0083  peptidase M50  28.67 
 
 
616 aa  46.6  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2911  cyclic nucleotide-binding protein  31.43 
 
 
1124 aa  46.2  0.0009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.965385  normal  0.0176228 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1705  membrane-associated zinc metalloprotease  28.02 
 
 
353 aa  46.2  0.0009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16631  membrane-associated Zn-dependent proteases 1  27.88 
 
 
361 aa  46.2  0.0009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.24545  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19080  predicted secreted protein containing a PDZ domain  25.81 
 
 
374 aa  46.2  0.0009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0257465  normal  0.465103 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0808  hypothetical protein  28.89 
 
 
361 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.52114  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0719  putative membrane-associated zinc metalloprotease  24.26 
 
 
366 aa  45.8  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3867  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.67 
 
 
418 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.18687  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3579  membrane-associated zinc metalloprotease  26.67 
 
 
420 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3918  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.67 
 
 
418 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.419375  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3561  membrane-associated zinc metalloprotease  26.67 
 
 
420 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3671  membrane-associated zinc metalloprotease  26.67 
 
 
420 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3832  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.67 
 
 
418 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.5484300000000005e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3861  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  26.67 
 
 
420 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3958  membrane-associated zinc metalloprotease  26.67 
 
 
420 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0717  peptidase M50  37.89 
 
 
497 aa  46.2  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2624  cyclic nucleotide-binding protein  27.34 
 
 
1177 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2454  peptidase RseP  28.26 
 
 
443 aa  46.2  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000129388 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1696  peptidase M50  38.1 
 
 
509 aa  45.8  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.156328 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0943  peptidase S16 lon domain-containing protein  27.54 
 
 
348 aa  45.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.652733 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1032  peptidase M50  32.03 
 
 
395 aa  45.8  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0615226 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1257  peptidase RseP  27.06 
 
 
355 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000258691  hitchhiker  0.00178972 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4510  putative Zinc metalloprotease  26.55 
 
 
383 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1914  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  28.72 
 
 
355 aa  44.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1948  membrane-associated zinc metalloprotease  24.38 
 
 
356 aa  45.1  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1786  membrane-associated zinc metalloprotease  26.94 
 
 
337 aa  44.7  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.250325  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4430  PDZ/DHR/GLGF domain protein  35.19 
 
 
338 aa  44.3  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2953  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  29.27 
 
 
348 aa  44.7  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0330402  normal  0.278749 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0890  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  27.37 
 
 
343 aa  44.7  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000919526  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3074  peptidase M50  36.51 
 
 
696 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.688769  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2148  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.73 
 
 
444 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0607  RIP metalloprotease RseP  23.93 
 
 
370 aa  44.3  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1279  putative membrane-associated zinc metallopeptidase  26.8 
 
 
456 aa  44.3  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.253686  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1797  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.4 
 
 
479 aa  44.3  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.88903  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1508  peptidase M50  51.43 
 
 
612 aa  44.3  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1953  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  24.73 
 
 
361 aa  43.9  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.667099  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0351  membrane-associated zinc metalloprotease  28.33 
 
 
549 aa  44.3  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4575  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.85 
 
 
375 aa  44.3  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2082  membrane-associated zinc metalloprotease  27.86 
 
 
386 aa  43.9  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366496  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2356  membrane-associated zinc metalloprotease  27.86 
 
 
386 aa  43.9  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.65169  normal  0.251617 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1552  CBS domain-containing protein  30.72 
 
 
378 aa  43.5  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1444  PDZ/DHR/GLGF domain protein  29.2 
 
 
379 aa  43.9  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1001  membrane-associated zinc metalloprotease  29.05 
 
 
438 aa  43.9  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0370  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  25.86 
 
 
345 aa  43.5  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  28.06 
 
 
478 aa  43.5  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1785  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.71 
 
 
367 aa  43.5  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0932  membrane-associated zinc metalloprotease  26.29 
 
 
342 aa  43.5  0.006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.115167  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  35.62 
 
 
474 aa  43.5  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2238  peptidase M50  34.26 
 
 
502 aa  43.5  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.577346  normal  0.574396 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3579  hypothetical protein  30.7 
 
 
350 aa  42.7  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00448549  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>