More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0370 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0370  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  100 
 
 
345 aa  680    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_314  membrane-associated zinc metalloprotease  94.77 
 
 
345 aa  651    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0352  peptidase M50  92.13 
 
 
345 aa  637    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1705  membrane-associated zinc metalloprotease  39.88 
 
 
353 aa  224  2e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0890  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  36.65 
 
 
343 aa  204  1e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000919526  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07740  putative membrane-associated zinc metalloprotease  34.79 
 
 
357 aa  204  2e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1042  peptidase RseP  39.03 
 
 
336 aa  202  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  0.000000013997 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1436  membrane-associated zinc metalloprotease  36.89 
 
 
338 aa  195  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.23212  normal  0.10285 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1665  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  38 
 
 
335 aa  191  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0534  peptidase M50  37.13 
 
 
388 aa  190  4e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000573099  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0481  putative membrane-associated zinc metalloprotease  34.54 
 
 
355 aa  188  9e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1947  putative membrane-associated zinc metalloprotease  38 
 
 
335 aa  187  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2601  peptidase M50  37.57 
 
 
392 aa  186  8e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0673098  normal  0.583833 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3701  membrane-associated zinc metalloprotease  33.24 
 
 
354 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000133266  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0587  membrane-associated zinc metalloprotease  33.81 
 
 
347 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2749  membrane-associated zinc metalloprotease  34.37 
 
 
354 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1818  peptidase M50  38.16 
 
 
371 aa  179  8e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0171111  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1492  membrane-associated zinc metalloprotease  33.52 
 
 
354 aa  178  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685355 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0796  membrane-associated zinc metalloprotease  33.88 
 
 
348 aa  175  9.999999999999999e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.270174  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0616  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.95 
 
 
339 aa  172  5.999999999999999e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.71 
 
 
347 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1653  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.61 
 
 
332 aa  170  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1257  peptidase RseP  32.68 
 
 
355 aa  168  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000258691  hitchhiker  0.00178972 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1914  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  32.42 
 
 
355 aa  166  4e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3726  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.49 
 
 
355 aa  166  5e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0932  membrane-associated zinc metalloprotease  33.43 
 
 
342 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.115167  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2715  membrane-associated zinc metalloprotease  32.46 
 
 
376 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3261  membrane-associated zinc metalloprotease  33.33 
 
 
383 aa  159  7e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1785  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.3 
 
 
367 aa  159  7e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4432  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.79 
 
 
385 aa  158  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1786  membrane-associated zinc metalloprotease  33.43 
 
 
337 aa  157  3e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.250325  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2836  putative membrane-associated zinc metalloprotease  34.49 
 
 
365 aa  155  7e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000950908  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3203  membrane-associated zinc metalloprotease  32.28 
 
 
341 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000432825  hitchhiker  0.00000345421 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3315  membrane-associated zinc metalloprotease  32.86 
 
 
342 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000939157  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2821  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  31.97 
 
 
383 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.370481  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2850  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  32.79 
 
 
383 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2051  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.43 
 
 
372 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00103431  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1161  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.07 
 
 
347 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.472937  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0596  membrane-associated zinc metalloprotease  29.39 
 
 
337 aa  149  6e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1948  membrane-associated zinc metalloprotease  29.33 
 
 
356 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0124  RIP metalloprotease RseP  31.25 
 
 
369 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195858  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1852  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  30.54 
 
 
383 aa  145  1e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0681454 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0515  membrane-associated zinc metalloprotease  31.81 
 
 
396 aa  144  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1070  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.35 
 
 
380 aa  143  4e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2443  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  31.35 
 
 
383 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.267885  normal  0.20072 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1135  RIP metalloprotease RseP  30.85 
 
 
370 aa  142  9.999999999999999e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0655  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.42 
 
 
368 aa  140  3e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0719  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.37 
 
 
366 aa  140  3e-32  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12605  predicted protein  29.7 
 
 
370 aa  140  3e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0627411  normal  0.0535145 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1701  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  30.35 
 
 
383 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.581219  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2914  membrane-associated zinc metalloprotease  29.94 
 
 
354 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.123834 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1593  peptidase RseP  30.98 
 
 
367 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1847  peptidase RseP  30.22 
 
 
369 aa  139  6e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000683327  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1211  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  30.87 
 
 
368 aa  138  1e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4510  putative Zinc metalloprotease  30 
 
 
383 aa  138  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1809  membrane-associated zinc metalloprotease  30.42 
 
 
349 aa  137  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.489906  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2117  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.23 
 
 
354 aa  137  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0862  peptidase RseP  29.27 
 
 
380 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1086  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  31.65 
 
 
372 aa  137  4e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.147315  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1121  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  29.94 
 
 
351 aa  137  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0347872  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1532  membrane-associated zinc metalloprotease  31.13 
 
 
386 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1960  membrane-associated zinc metalloprotease  32.87 
 
 
348 aa  135  8e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.346364  normal  0.305152 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3189  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.2 
 
 
392 aa  135  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0637  membrane-associated zinc metalloprotease  29.41 
 
 
386 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1234  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  31.49 
 
 
350 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1086  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  31.34 
 
 
368 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1249  membrane-associated zinc metalloprotease  29.65 
 
 
351 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0540521  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0366  membrane-associated zinc metalloprotease  30.85 
 
 
367 aa  133  3.9999999999999996e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.129144 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1181  membrane-associated zinc metalloprotease  29.65 
 
 
351 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1061  membrane-associated zinc metalloprotease  31.09 
 
 
352 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2383  membrane-associated zinc metalloprotease  29.75 
 
 
355 aa  130  3e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13821  membrane-associated Zn-dependent proteases 1  29.63 
 
 
359 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1589  membrane-associated zinc metalloprotease  25.82 
 
 
375 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1405  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  29.71 
 
 
345 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1782  membrane-associated zinc metalloprotease  26.16 
 
 
377 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2518  zinc metallopeptidase  26.03 
 
 
373 aa  127  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.436086  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13901  membrane-associated Zn-dependent proteases 1  29.34 
 
 
359 aa  127  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2082  membrane-associated zinc metalloprotease  29.26 
 
 
386 aa  126  5e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366496  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3836  membrane-associated zinc metalloprotease  29.43 
 
 
381 aa  126  5e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0101084 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2356  membrane-associated zinc metalloprotease  28.99 
 
 
386 aa  126  5e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.65169  normal  0.251617 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1290  hypothetical protein  29.09 
 
 
359 aa  126  7e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.62255  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3268  hypothetical protein  28.96 
 
 
364 aa  125  7e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.620699  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1730  hypothetical protein  29.31 
 
 
364 aa  125  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1953  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  30.59 
 
 
361 aa  125  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.667099  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1122  peptidase RseP  30.45 
 
 
360 aa  124  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2042  membrane-associated zinc metalloprotease  29.26 
 
 
386 aa  124  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.101077 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12761  membrane-associated Zn-dependent protease 1  27.82 
 
 
365 aa  124  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0131503 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16631  membrane-associated Zn-dependent proteases 1  29.3 
 
 
361 aa  123  5e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.24545  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0607  RIP metalloprotease RseP  28.61 
 
 
370 aa  123  5e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3629  peptidase M50  31.85 
 
 
325 aa  123  5e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2356  membrane-associated zinc metalloprotease  32.31 
 
 
361 aa  122  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2406  membrane-associated zinc metalloprotease  32.31 
 
 
361 aa  122  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.738258  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0514  membrane-associated zinc metalloprotease  28.68 
 
 
377 aa  122  9e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.30248 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2728  membrane-associated zinc metalloprotease  29.34 
 
 
362 aa  122  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13611  membrane-associated Zn-dependent proteases 1  28.77 
 
 
359 aa  122  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0808  hypothetical protein  29.3 
 
 
361 aa  120  3e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.52114  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0448  hypothetical protein  31.06 
 
 
364 aa  119  7e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5193  membrane-associated zinc metalloprotease  29.94 
 
 
363 aa  119  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000035702 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1363  membrane-associated zinc metalloprotease  28.88 
 
 
369 aa  119  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2558  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.21 
 
 
353 aa  119  9e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>