33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2238 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0717  peptidase M50  70.56 
 
 
497 aa  707    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2238  peptidase M50  100 
 
 
502 aa  1002    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.577346  normal  0.574396 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0618  peptidase M50  65.34 
 
 
502 aa  682    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1696  peptidase M50  66.14 
 
 
509 aa  696    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.156328 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1066  peptidase M50  38.58 
 
 
364 aa  97.1  6e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.754644  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0845  peptidase M50  31.28 
 
 
418 aa  95.1  3e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.450162  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2160  peptidase M50  42.86 
 
 
362 aa  85.9  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000514306 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0864  peptidase M50  33.56 
 
 
380 aa  77.8  0.0000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1683  peptidase M50  32.49 
 
 
623 aa  72.4  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.200321  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3477  peptidase M50  32.28 
 
 
607 aa  65.5  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1508  peptidase M50  35.29 
 
 
612 aa  63.5  0.000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1973  peptidase M50  26.75 
 
 
603 aa  61.2  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.246801  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0107  peptidase M50  36.96 
 
 
398 aa  60.1  0.00000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000498394 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0314  peptidase M50  22.75 
 
 
512 aa  58.9  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0172  peptidase M50  41.67 
 
 
518 aa  58.5  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1380  peptidase M50  28.29 
 
 
388 aa  57.4  0.0000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.338907  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02350  expressed protein  29.73 
 
 
594 aa  55.8  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0083  peptidase M50  37.5 
 
 
616 aa  54.3  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1506  peptidase M50  37.04 
 
 
375 aa  53.9  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1487  hypothetical protein  42.86 
 
 
441 aa  53.9  0.000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000349158  normal  0.0156065 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0964  peptidase M50  25.63 
 
 
459 aa  53.5  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1169  peptidase M50  30.23 
 
 
375 aa  52.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0781  peptidase M50  36.11 
 
 
375 aa  50.4  0.00007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1174  peptidase M50  38.27 
 
 
375 aa  49.7  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3648  peptidase M50  37.36 
 
 
381 aa  48.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0203123 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0372  hypothetical protein  34.57 
 
 
474 aa  47.8  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.707522  normal  0.611726 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3400  peptidase M50  38.04 
 
 
381 aa  47.4  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0932  membrane-associated zinc metalloprotease  31.98 
 
 
342 aa  47.4  0.0007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.115167  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0248  peptidase M50  22.11 
 
 
584 aa  45.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000540477  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3626  peptidase M50  35 
 
 
368 aa  45.1  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.721542 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1942  peptidase M50  29.75 
 
 
432 aa  44.3  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.718786 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1291  peptidase M50  34.78 
 
 
366 aa  43.9  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0472  peptidase M50  30.93 
 
 
702 aa  43.5  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>