More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_314 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0370  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  94.77 
 
 
345 aa  651    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_314  membrane-associated zinc metalloprotease  100 
 
 
345 aa  680    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0352  peptidase M50  92.46 
 
 
345 aa  644    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1705  membrane-associated zinc metalloprotease  38.64 
 
 
353 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0890  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  37.93 
 
 
343 aa  206  5e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000919526  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07740  putative membrane-associated zinc metalloprotease  34.43 
 
 
357 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1042  peptidase RseP  38.53 
 
 
336 aa  199  5e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  0.000000013997 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1665  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  38.29 
 
 
335 aa  196  4.0000000000000005e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1947  putative membrane-associated zinc metalloprotease  38.29 
 
 
335 aa  193  4e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1436  membrane-associated zinc metalloprotease  35.55 
 
 
338 aa  188  1e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.23212  normal  0.10285 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2601  peptidase M50  38.16 
 
 
392 aa  186  5e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0673098  normal  0.583833 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0481  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.77 
 
 
355 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0534  peptidase M50  37.36 
 
 
388 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000573099  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3701  membrane-associated zinc metalloprotease  32.96 
 
 
354 aa  181  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000133266  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1818  peptidase M50  38.16 
 
 
371 aa  180  4e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0171111  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0587  membrane-associated zinc metalloprotease  33.71 
 
 
347 aa  179  8e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2749  membrane-associated zinc metalloprotease  33.24 
 
 
354 aa  177  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1492  membrane-associated zinc metalloprotease  32.96 
 
 
354 aa  176  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685355 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3726  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.61 
 
 
355 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1257  peptidase RseP  32.68 
 
 
355 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000258691  hitchhiker  0.00178972 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0616  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.86 
 
 
339 aa  172  7.999999999999999e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0796  membrane-associated zinc metalloprotease  34.35 
 
 
348 aa  172  1e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.270174  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.24 
 
 
347 aa  170  3e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1914  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  31.84 
 
 
355 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1653  putative membrane-associated zinc metalloprotease  34.84 
 
 
332 aa  166  5e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2715  membrane-associated zinc metalloprotease  32.46 
 
 
376 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0932  membrane-associated zinc metalloprotease  32.58 
 
 
342 aa  159  5e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.115167  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3315  membrane-associated zinc metalloprotease  33.71 
 
 
342 aa  159  6e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000939157  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3261  membrane-associated zinc metalloprotease  33.51 
 
 
383 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1785  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.86 
 
 
367 aa  158  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2836  putative membrane-associated zinc metalloprotease  34.88 
 
 
365 aa  157  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000950908  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2051  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.33 
 
 
372 aa  157  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00103431  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2850  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  33.24 
 
 
383 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1786  membrane-associated zinc metalloprotease  33.43 
 
 
337 aa  153  4e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.250325  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2821  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  32.15 
 
 
383 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.370481  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4432  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.06 
 
 
385 aa  150  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3203  membrane-associated zinc metalloprotease  32.28 
 
 
341 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000432825  hitchhiker  0.00000345421 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1948  membrane-associated zinc metalloprotease  29.61 
 
 
356 aa  149  7e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1161  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.78 
 
 
347 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.472937  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1070  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.44 
 
 
380 aa  144  2e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0596  membrane-associated zinc metalloprotease  28.24 
 
 
337 aa  144  3e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1847  peptidase RseP  30.66 
 
 
369 aa  144  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000683327  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2443  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  30.91 
 
 
383 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.267885  normal  0.20072 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0124  RIP metalloprotease RseP  32.13 
 
 
369 aa  142  9e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195858  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0862  peptidase RseP  30.54 
 
 
380 aa  141  9.999999999999999e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1809  membrane-associated zinc metalloprotease  31.18 
 
 
349 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.489906  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1086  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  32.21 
 
 
372 aa  139  4.999999999999999e-32  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.147315  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12605  predicted protein  31.07 
 
 
370 aa  140  4.999999999999999e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0627411  normal  0.0535145 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1852  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  29.97 
 
 
383 aa  139  8.999999999999999e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0681454 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1135  RIP metalloprotease RseP  30.75 
 
 
370 aa  139  8.999999999999999e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2914  membrane-associated zinc metalloprotease  30.21 
 
 
354 aa  138  1e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.123834 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0637  membrane-associated zinc metalloprotease  29.79 
 
 
386 aa  138  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1532  membrane-associated zinc metalloprotease  30.85 
 
 
386 aa  138  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1121  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  29.8 
 
 
351 aa  137  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0347872  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4510  putative Zinc metalloprotease  29.57 
 
 
383 aa  136  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0515  membrane-associated zinc metalloprotease  30.25 
 
 
396 aa  136  5e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3189  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.75 
 
 
392 aa  136  6.0000000000000005e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0655  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.02 
 
 
368 aa  135  8e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0719  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.02 
 
 
366 aa  135  9.999999999999999e-31  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1701  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  29.38 
 
 
383 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.581219  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2117  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.38 
 
 
354 aa  133  5e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1960  membrane-associated zinc metalloprotease  33.33 
 
 
348 aa  133  5e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.346364  normal  0.305152 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2383  membrane-associated zinc metalloprotease  30.03 
 
 
355 aa  133  6e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1181  membrane-associated zinc metalloprotease  29.48 
 
 
351 aa  132  6e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1249  membrane-associated zinc metalloprotease  29.48 
 
 
351 aa  132  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0540521  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1234  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  30.66 
 
 
350 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1211  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  29.78 
 
 
368 aa  131  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1593  peptidase RseP  30.16 
 
 
367 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0366  membrane-associated zinc metalloprotease  30.3 
 
 
367 aa  131  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.129144 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1589  membrane-associated zinc metalloprotease  26.45 
 
 
375 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1782  membrane-associated zinc metalloprotease  26.17 
 
 
377 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1086  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  30.94 
 
 
368 aa  129  7.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2518  zinc metallopeptidase  26.3 
 
 
373 aa  129  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.436086  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1061  membrane-associated zinc metalloprotease  30.88 
 
 
352 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3836  membrane-associated zinc metalloprotease  29.46 
 
 
381 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0101084 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2728  membrane-associated zinc metalloprotease  30.7 
 
 
362 aa  127  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2082  membrane-associated zinc metalloprotease  28.76 
 
 
386 aa  126  6e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366496  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2356  membrane-associated zinc metalloprotease  28.76 
 
 
386 aa  125  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.65169  normal  0.251617 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13821  membrane-associated Zn-dependent proteases 1  29.34 
 
 
359 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0607  RIP metalloprotease RseP  29.17 
 
 
370 aa  125  1e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13611  membrane-associated Zn-dependent proteases 1  29.23 
 
 
359 aa  124  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3268  hypothetical protein  28.96 
 
 
364 aa  124  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.620699  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13901  membrane-associated Zn-dependent proteases 1  29.06 
 
 
359 aa  123  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1953  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  30.88 
 
 
361 aa  123  4e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.667099  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12761  membrane-associated Zn-dependent protease 1  28.37 
 
 
365 aa  123  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0131503 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1405  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  28.57 
 
 
345 aa  123  5e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2042  membrane-associated zinc metalloprotease  28.76 
 
 
386 aa  123  6e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.101077 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1122  peptidase RseP  29.61 
 
 
360 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0514  membrane-associated zinc metalloprotease  27.68 
 
 
377 aa  120  3e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.30248 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16631  membrane-associated Zn-dependent proteases 1  29.3 
 
 
361 aa  120  3e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.24545  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1444  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.95 
 
 
377 aa  120  3e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0296  membrane-associated zinc metalloprotease  29.65 
 
 
381 aa  120  4.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0791125 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1730  hypothetical protein  28.35 
 
 
364 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0448  hypothetical protein  31.11 
 
 
364 aa  120  4.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5193  membrane-associated zinc metalloprotease  29.94 
 
 
363 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000035702 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0623  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  30.41 
 
 
368 aa  119  6e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2356  membrane-associated zinc metalloprotease  32.36 
 
 
361 aa  119  9e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2406  membrane-associated zinc metalloprotease  32.36 
 
 
361 aa  119  9e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.738258  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0808  hypothetical protein  29.86 
 
 
361 aa  118  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.52114  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1290  hypothetical protein  28.53 
 
 
359 aa  119  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.62255  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>