More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4730 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_4730  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 286 aa  583  1.0000000000000001e-165  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.813554  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1130  cyclic nucleotide-binding protein  42.97 
 
 		 276 aa  202  7e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000651756  unclonable  0.00000750922 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2938  hypothetical protein  51.3 
 
 		 178 aa  157  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.237457  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0445  hypothetical protein  56.1 
 
 		 196 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.866807 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0454  protein of unknown function DUF1003  62.93 
 
 		 217 aa  151  2e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3206  protein of unknown function DUF1003  58.4 
 
 		 286 aa  150  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3017  hypothetical protein  58.4 
 
 		 301 aa  150  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0593713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1664  hypothetical protein  61.21 
 
 		 237 aa  149  6e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2506  hypothetical protein  49.68 
 
 		 233 aa  145  5e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.56137  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4796  hypothetical protein  57.38 
 
 		 174 aa  144  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.513375  normal  0.208453 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1225  protein of unknown function DUF1003  59.82 
 
 		 248 aa  143  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000330099  normal  0.0160942 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2222  protein of unknown function DUF1003  48 
 
 		 176 aa  142  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0189655  normal  0.365031 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3902  hypothetical protein  58.97 
 
 		 183 aa  142  9e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.788531 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2004  protein of unknown function DUF1003  52.1 
 
 		 176 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0020  hypothetical protein  46.07 
 
 		 235 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1649  hypothetical protein  46.07 
 
 		 235 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.555463 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6262  hypothetical protein  51.94 
 
 		 263 aa  138  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2047  hypothetical protein  46.54 
 
 		 235 aa  137  2e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1621  hypothetical protein  56.35 
 
 		 232 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0139692  normal  0.0181872 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0489  hypothetical protein  55.46 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.705019  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4320  hypothetical protein  57.66 
 
 		 191 aa  132  5e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2763  hypothetical protein  57.8 
 
 		 158 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0516  hypothetical protein  58.62 
 
 		 240 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.388722  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3811  protein of unknown function DUF1003  58.68 
 
 		 236 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1489  protein of unknown function DUF1003  48.72 
 
 		 163 aa  124  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00129777  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0874  hypothetical protein  52.63 
 
 		 256 aa  124  2e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0511  hypothetical protein  57.01 
 
 		 293 aa  122  5e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1203  hypothetical protein  52.29 
 
 		 154 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438475  normal  0.0901975 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4500  protein of unknown function DUF1003  54.72 
 
 		 182 aa  120  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2194  protein of unknown function DUF1003  54.81 
 
 		 219 aa  118  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5958  hypothetical protein  50.72 
 
 		 202 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.217492  normal  0.549571 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1546  hypothetical protein  54.55 
 
 		 177 aa  93.6  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2706  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 228 aa  91.7  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2867  protein of unknown function DUF1003  41.51 
 
 		 222 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000997014  normal  0.550165 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4596  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.06 
 
 		 230 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 226 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1005  cyclic nucleotide-binding  33.09 
 
 		 226 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 226 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3032  Crp family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 224 aa  90.5  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0461942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  38.28 
 
 		 225 aa  90.5  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.31 
 
 		 225 aa  89.7  5e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.81 
 
 		 228 aa  89.4  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0723  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 228 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.25 
 
 		 226 aa  87.8  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  33.79 
 
 		 225 aa  86.7  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 225 aa  86.7  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.82 
 
 		 225 aa  85.9  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.58 
 
 		 225 aa  85.9  7e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  35.56 
 
 		 228 aa  85.5  8e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1951  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 222 aa  85.5  9e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.861655  normal  0.0267012 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  34.97 
 
 		 220 aa  85.1  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 226 aa  84  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  30.28 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.13 
 
 		 226 aa  83.2  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.8 
 
 		 225 aa  82.4  0.000000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8409  membrane protein-like protein  36.11 
 
 		 166 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.381654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0801  protein of unknown function DUF1003  36.54 
 
 		 196 aa  81.6  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.765445  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.1 
 
 		 251 aa  81.6  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.91 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  33.1 
 
 		 224 aa  80.9  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1680  protein of unknown function DUF1003  42.7 
 
 		 188 aa  81.3  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000539657  normal  0.503205 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3010  hypothetical protein  33.64 
 
 		 156 aa  80.5  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.272715  normal  0.532145 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0303  cyclic nucleotide-binding domain protein  31.43 
 
 		 236 aa  80.5  0.00000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.232206 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.28 
 
 		 243 aa  80.5  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.33 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  29.76 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.07 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  27.88 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.69 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0593  hypothetical protein  30.4 
 
 		 183 aa  78.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1194  protein of unknown function DUF1003  45.45 
 
 		 175 aa  78.6  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.753694  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2207  hypothetical protein  30.5 
 
 		 181 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.467926 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3988  hypothetical protein  34.58 
 
 		 171 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4062  hypothetical protein  34.58 
 
 		 171 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.866951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4002  hypothetical protein  34.58 
 
 		 171 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164166  normal  0.35729 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1133  protein of unknown function DUF1003  33.93 
 
 		 173 aa  77  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138978  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0718  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.93 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.45 
 
 		 242 aa  77  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.3 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0121  protein of unknown function DUF1003  34.48 
 
 		 167 aa  76.3  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.446057 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4489  hypothetical protein  29.45 
 
 		 181 aa  75.9  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.204166  normal  0.0890855 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.46 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 228 aa  75.9  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4099  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 237 aa  75.9  0.0000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000655046 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2074  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 		 225 aa  75.5  0.0000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2016  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 229 aa  75.1  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776172  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1446  hypothetical protein  37 
 
 		 180 aa  75.1  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117838  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 225 aa  75.1  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4286  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 241 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3370  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.38 
 
 		 425 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0979  cAMP-binding protein  29.7 
 
 		 239 aa  74.7  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2732  cyclic nucleotide-binding protein  34.38 
 
 		 425 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0328  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0277272  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3816  hypothetical protein  37.61 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.313725  normal  0.183885 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1944  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.69 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0362  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74387  normal  0.571703 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1863  protein of unknown function DUF1003  40.26 
 
 		 176 aa  73.6  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.600017  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2292  protein of unknown function DUF1003  43.18 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.8 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>