More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13268 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13268  transmembrane transport protein  100 
 
 		 1048 aa  2043    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.321047 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13760  hypothetical protein  63.66 
 
 		 1065 aa  1165    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.217439 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.56 
 
 		 531 aa  300  1e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0658046  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4115  major facilitator transporter  41.2 
 
 		 468 aa  267  8.999999999999999e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.976029 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12585  hypothetical protein  36.71 
 
 		 583 aa  262  2e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.274213  normal  0.619754 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0155  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.19 
 
 		 487 aa  253  1e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.086904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0278  major facilitator superfamily MFS_1  42.69 
 
 		 467 aa  245  3e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1939  major facilitator transporter  40.73 
 
 		 477 aa  239  2e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207274  normal  0.576775 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5749  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.36 
 
 		 607 aa  220  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.36 
 
 		 498 aa  216  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4598  cyclic nucleotide-binding protein  32.97 
 
 		 581 aa  213  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0649502  normal  0.461096 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0161  cyclic nucleotide-binding protein  32.61 
 
 		 583 aa  211  5e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102095  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.31 
 
 		 478 aa  211  6e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.29 
 
 		 522 aa  209  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.98 
 
 		 502 aa  208  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1265  major facilitator superfamily MFS_1  33.08 
 
 		 524 aa  207  6e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1737  cyclic nucleotide-binding protein  31.55 
 
 		 584 aa  203  9.999999999999999e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.987776 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.27 
 
 		 527 aa  202  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.35 
 
 		 515 aa  201  7e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701538  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4406  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.92 
 
 		 514 aa  200  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.853367 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7577  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.24 
 
 		 487 aa  197  9e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1911  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.1 
 
 		 585 aa  197  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0262  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.34 
 
 		 500 aa  196  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0858399  decreased coverage  0.0004758 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5573  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.95 
 
 		 474 aa  196  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1646  multidrug ABC transporter, permease  30.5 
 
 		 582 aa  196  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1670  multidrug resistance protein B  31.07 
 
 		 582 aa  195  4e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.11549  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3511  multidrug resistance protein B  30.73 
 
 		 582 aa  195  4e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1947  multidrug ABC transporter, permease  31.31 
 
 		 582 aa  194  6e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.128457  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.98 
 
 		 489 aa  194  6e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.1 
 
 		 512 aa  192  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.68 
 
 		 469 aa  192  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.12 
 
 		 528 aa  192  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5012  major facilitator transporter  34.36 
 
 		 490 aa  191  7e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675946  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.9 
 
 		 487 aa  189  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.52 
 
 		 485 aa  188  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.57 
 
 		 502 aa  188  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.25 
 
 		 509 aa  188  4e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.38 
 
 		 489 aa  188  5e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6356  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.13 
 
 		 492 aa  184  7e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0223  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.27 
 
 		 500 aa  184  7e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4689  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.49 
 
 		 516 aa  184  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.200154  hitchhiker  0.00098784 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.13 
 
 		 522 aa  184  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2110  major facilitator superfamily MFS_1  33.56 
 
 		 457 aa  183  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273414 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.54 
 
 		 763 aa  181  4.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  33.82 
 
 		 522 aa  181  9e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3179  cyclic nucleotide-binding protein  33.77 
 
 		 639 aa  180  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  32.24 
 
 		 497 aa  179  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0603  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.17 
 
 		 498 aa  179  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.66 
 
 		 540 aa  179  3e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0420  major facilitator superfamily permease  29.76 
 
 		 608 aa  179  3e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5301  major facilitator transporter  35.43 
 
 		 468 aa  178  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5559  major facilitator transporter  35.43 
 
 		 468 aa  178  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.39 
 
 		 488 aa  179  4e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.41 
 
 		 488 aa  177  8e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.66 
 
 		 508 aa  177  9e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.83 
 
 		 478 aa  177  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.88 
 
 		 564 aa  176  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0759  major facilitator superfamily permease  31.65 
 
 		 554 aa  176  1.9999999999999998e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000977825  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5514  major facilitator transporter  35.19 
 
 		 483 aa  176  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.514216  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6387  major facilitator transporter  34.94 
 
 		 480 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5878  major facilitator transporter  35.19 
 
 		 483 aa  176  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.307584 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0346  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.69 
 
 		 490 aa  175  3.9999999999999995e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.149604 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0499  major facilitator superfamily MFS_1  36.76 
 
 		 465 aa  175  3.9999999999999995e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2168  major facilitator superfamily MFS_1  33.09 
 
 		 483 aa  175  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.647242 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.04 
 
 		 493 aa  175  3.9999999999999995e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2956  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.66 
 
 		 521 aa  175  3.9999999999999995e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17940  arabinose efflux permease family protein  35.51 
 
 		 457 aa  175  5e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.34 
 
 		 514 aa  175  5e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.83 
 
 		 480 aa  174  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4562  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.81 
 
 		 506 aa  175  5e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.573494  normal  0.0249229 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3195  cyclic nucleotide-binding protein  32.29 
 
 		 598 aa  174  5.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.81 
 
 		 506 aa  174  5.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1413  major facilitator transporter  32.96 
 
 		 479 aa  174  7.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5186  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.64 
 
 		 506 aa  174  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5673  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.64 
 
 		 506 aa  174  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00952524 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1801  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.74 
 
 		 504 aa  173  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0797811  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3502  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.44 
 
 		 474 aa  173  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8291  major facilitator superfamily MFS_1  33.62 
 
 		 480 aa  173  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.18 
 
 		 507 aa  173  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0213589 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.04 
 
 		 504 aa  172  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.54 
 
 		 486 aa  172  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.54 
 
 		 486 aa  172  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.54 
 
 		 486 aa  172  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.54 
 
 		 486 aa  172  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.54 
 
 		 486 aa  172  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4810  major facilitator transporter  34.69 
 
 		 555 aa  172  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.54 
 
 		 486 aa  172  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2370  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.65 
 
 		 520 aa  172  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236919  normal  0.7616 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4713  major facilitator transporter  38.34 
 
 		 397 aa  172  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12357  integral membrane transport protein  34.59 
 
 		 537 aa  172  4e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2687  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  31.14 
 
 		 466 aa  171  6e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.594602  normal  0.701968 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7966  major facilitator superfamily MFS_1  33.26 
 
 		 487 aa  171  7e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.92 
 
 		 646 aa  171  8e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.75 
 
 		 519 aa  171  8e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.706315  hitchhiker  0.000232213 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4044  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.92 
 
 		 646 aa  171  8e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1374  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.53 
 
 		 624 aa  171  9e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.138128  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.22 
 
 		 505 aa  170  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0124  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.81 
 
 		 471 aa  170  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.55159  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.62 
 
 		 553 aa  170  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3984  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.92 
 
 		 646 aa  170  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086459  normal  0.10455 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>