More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2270 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2270  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 
477 aa  966    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00166052 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2894  cyclic nucleotide-binding protein  48.8 
 
 
482 aa  443  1e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00660929  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3166  cyclic nucleotide-binding protein  48.75 
 
 
482 aa  427  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363184  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3689  cyclic nucleotide-binding protein  43.97 
 
 
454 aa  375  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120597  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0343  cyclic nucleotide-binding protein  28.88 
 
 
811 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0783507  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0590  cyclic nucleotide-binding protein  27.76 
 
 
801 aa  124  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.120802  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0301  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.7 
 
 
858 aa  120  3.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04987  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit (PKA regulatory subunit) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O59922]  30.99 
 
 
412 aa  90.9  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.599779  normal  0.51731 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3152  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.42 
 
 
487 aa  87.4  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.833452  normal  0.47191 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5160  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.08 
 
 
739 aa  87.4  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.8765  normal  0.911102 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3722  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.12 
 
 
760 aa  82.4  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.44099  normal  0.232019 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1755  Iron-sulfur cluster-binding protein  32.69 
 
 
149 aa  76.6  0.0000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.176343  normal  0.108296 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0474  electron transport protein  33.52 
 
 
201 aa  76.6  0.0000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4712  cyclic nucleotide-binding protein  35.29 
 
 
412 aa  76.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566577  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05510  cAMP-dependent protein kinase inhibitor, putative  31.25 
 
 
482 aa  75.5  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5447  voltage-dependent potassium channel  32.34 
 
 
409 aa  74.3  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.532768  normal  0.0697598 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3370  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.53 
 
 
425 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2732  cyclic nucleotide-binding protein  34.53 
 
 
425 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3368  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.37 
 
 
503 aa  74.3  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00879958  normal  0.135189 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1238  iron-sulfur cluster-binding protein  32.69 
 
 
149 aa  74.3  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  33.99 
 
 
419 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2199  cyclic nucleotide-binding protein  32.76 
 
 
357 aa  72.8  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_3120  predicted protein  24.24 
 
 
241 aa  71.6  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82287  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit (PKA regulatory subunit)  27.11 
 
 
441 aa  71.2  0.00000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.770378 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.31 
 
 
231 aa  70.1  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2493  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.77 
 
 
149 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5210  cyclic nucleotide-binding protein  33.61 
 
 
355 aa  68.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.465426  normal  0.688608 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12585  hypothetical protein  27.78 
 
 
583 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.274213  normal  0.619754 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1513  cyclic nucleotide-binding protein  31.47 
 
 
308 aa  68.2  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00604424  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2303  MscS Mechanosensitive ion channel  36.19 
 
 
512 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.697138  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4277  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.1 
 
 
173 aa  67.8  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1378  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.68 
 
 
408 aa  68.2  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2425  electron transport protein HydN  30.99 
 
 
180 aa  67.4  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.743401 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32 
 
 
224 aa  67  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0309  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  31.11 
 
 
212 aa  66.2  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.600557  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.93 
 
 
225 aa  66.2  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.89 
 
 
222 aa  66.2  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2571 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4598  cyclic nucleotide-binding protein  32.31 
 
 
581 aa  66.6  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0649502  normal  0.461096 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30 
 
 
224 aa  65.9  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3674  cyclic nucleotide-binding protein  37 
 
 
788 aa  65.1  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.301148 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4020  cyclic nucleotide-binding  38.78 
 
 
367 aa  65.1  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109231  normal  0.727114 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4597  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.1 
 
 
169 aa  65.1  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.16 
 
 
226 aa  64.3  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4944  cyclic nucleotide-binding protein  32.74 
 
 
454 aa  63.9  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658137  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4219  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.99 
 
 
177 aa  63.9  0.000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
226 aa  63.9  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4730  cyclic nucleotide-binding protein  32.03 
 
 
286 aa  63.5  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.813554  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1737  cyclic nucleotide-binding protein  29.46 
 
 
584 aa  62.8  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.987776 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2102  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
227 aa  62.8  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10105  hypothetical protein  36.15 
 
 
504 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3825  CBS domain-containing protein  36.36 
 
 
598 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138236 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0165  cyclic nucleotide-binding  36.04 
 
 
124 aa  62.4  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1119  catabolite gene activator (cAMP receptor protein) (cAMP-regulatory protein)  36.28 
 
 
222 aa  62  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00910  Fe-S-cluster-containing hydrogenase subunit  36.2 
 
 
177 aa  61.6  0.00000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2440  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  30.33 
 
 
509 aa  61.6  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00769093 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0153  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  33.77 
 
 
251 aa  61.6  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3713  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  38.46 
 
 
613 aa  61.6  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000235103  unclonable  0.0000000288509 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  32.47 
 
 
413 aa  61.6  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2108  hypothetical protein  40 
 
 
835 aa  61.6  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13268  transmembrane transport protein  30.83 
 
 
1048 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.321047 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  30.3 
 
 
225 aa  61.2  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1892  cyclic nucleotide-binding protein  34.78 
 
 
147 aa  61.2  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.326195  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02563  formate dehydrogenase-H, [4Fe-4S] ferredoxin subunit  32.74 
 
 
175 aa  60.8  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0976  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.74 
 
 
175 aa  60.8  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.961546  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3164  electron transport protein HydN  32.74 
 
 
175 aa  60.8  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5417  cyclic nucleotide-binding protein  26.72 
 
 
419 aa  60.8  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0881735  normal  0.0681678 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3800  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
225 aa  60.8  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2836  electron transport protein HydN  32.74 
 
 
175 aa  60.8  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0600195 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3963  electron transport protein HydN  32.74 
 
 
175 aa  60.8  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4220  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  29.03 
 
 
667 aa  60.8  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2997  electron transport protein HydN  32.74 
 
 
175 aa  60.8  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0999  electron transport protein HydN  32.74 
 
 
175 aa  60.8  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00184229 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2849  electron transport protein HydN  32.74 
 
 
175 aa  60.8  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02528  hypothetical protein  32.74 
 
 
175 aa  60.8  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2621  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.71 
 
 
467 aa  60.5  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167094  decreased coverage  0.0008696 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0323  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  30.9 
 
 
176 aa  60.8  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1814  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.6 
 
 
242 aa  60.5  0.00000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.38579  normal  0.245711 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3804  MscS Mechanosensitive ion channel  32.95 
 
 
495 aa  60.1  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4278  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  29.94 
 
 
674 aa  60.1  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2614  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  29.3 
 
 
659 aa  60.1  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2074  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.3 
 
 
225 aa  60.1  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.05 
 
 
223 aa  60.1  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0884  hydrogenase large subunit domain protein  32.5 
 
 
507 aa  60.1  0.00000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.139599  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3896  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.89 
 
 
157 aa  60.1  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3777  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.89 
 
 
157 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0432  cyclic nucleotide-binding protein  35.96 
 
 
860 aa  59.3  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2635  cyclic nucleotide-binding protein  31.58 
 
 
228 aa  59.7  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4351  cyclic nucleotide-binding protein  36 
 
 
948 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.85 
 
 
251 aa  59.7  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4949  4Fe-4S binding domain protein  29.89 
 
 
157 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.773507 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2280  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.96 
 
 
226 aa  59.7  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000058005  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0137  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.89 
 
 
157 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  26.67 
 
 
225 aa  58.9  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3029  electron transport protein HydN  31.29 
 
 
181 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.135002  hitchhiker  0.0000568906 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2192  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  31.43 
 
 
189 aa  58.9  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.574269 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3152  electron transport protein HydN  31.29 
 
 
181 aa  59.3  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0528498 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0049  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.62 
 
 
252 aa  59.3  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.422683  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11563  predicted protein  31.13 
 
 
238 aa  59.3  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.684972  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3186  electron transport protein HydN  30.86 
 
 
181 aa  58.5  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0817  CBS domain-containing protein  34.03 
 
 
603 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.175091 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>