More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2635 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2635  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 
228 aa  453  1e-127  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3304  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.82 
 
 
243 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010506 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4140  cyclic nucleotide-binding protein  36.07 
 
 
243 aa  104  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6568  cyclic nucleotide-binding protein  35.11 
 
 
228 aa  101  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.538415  normal  0.0410288 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4417  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.52 
 
 
258 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.48784  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6767  cyclic nucleotide-binding protein  34.57 
 
 
228 aa  98.6  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.171014  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5695  cyclic nucleotide-binding protein  35.6 
 
 
233 aa  97.4  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0746044  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4711  cyclic nucleotide-binding protein  34.24 
 
 
230 aa  94  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.754309  decreased coverage  0.00295307 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2874  cyclic nucleotide-binding protein  32.07 
 
 
228 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.191735 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3468  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.89 
 
 
236 aa  91.7  9e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3301  cyclic nucleotide-binding protein  29.89 
 
 
229 aa  90.9  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00259627 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4195  cyclic nucleotide-binding  32.62 
 
 
234 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.164725  normal  0.773983 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4566  cyclic nucleotide-binding protein  32.62 
 
 
234 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.940335  normal  0.142026 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5739  cyclic nucleotide-binding protein  36.02 
 
 
235 aa  89  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.172184 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2514  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
231 aa  86.7  3e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.619242 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28321  putative regulatory protein  31.28 
 
 
231 aa  86.7  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.270503 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.29 
 
 
251 aa  85.9  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1061  Crp family transcriptional regulator  29.41 
 
 
214 aa  83.6  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0336611  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2016  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.8 
 
 
229 aa  84  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776172  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.82 
 
 
222 aa  81.6  0.000000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2571 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0797  cyclic nucleotide-binding protein  31.44 
 
 
217 aa  81.6  0.000000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1955  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.57 
 
 
229 aa  79.7  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  27.75 
 
 
220 aa  78.6  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01198  cyclic nucleotide-binding protein  26.24 
 
 
229 aa  78.6  0.00000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4219  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.67 
 
 
219 aa  78.6  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.408304  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.32 
 
 
219 aa  78.2  0.00000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.18 
 
 
224 aa  78.2  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4596  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.88 
 
 
230 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.43 
 
 
228 aa  78.2  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2706  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.95 
 
 
228 aa  76.6  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154877  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3511  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.93 
 
 
233 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.69 
 
 
225 aa  76.3  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1119  catabolite gene activator (cAMP receptor protein) (cAMP-regulatory protein)  28.65 
 
 
222 aa  75.5  0.0000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0349  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.97 
 
 
222 aa  75.1  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000192919 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.41 
 
 
225 aa  74.7  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.04 
 
 
225 aa  74.3  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0723  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.18 
 
 
228 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.01 
 
 
225 aa  74.7  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8981  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.69 
 
 
222 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  26.32 
 
 
226 aa  73.6  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.04 
 
 
224 aa  73.2  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.37 
 
 
231 aa  72.8  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.79 
 
 
226 aa  72.8  0.000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3367  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.76 
 
 
230 aa  72.8  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0519  Fnr-like transcriptional activator  27.37 
 
 
246 aa  72.4  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3066  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.79 
 
 
232 aa  72.4  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.86 
 
 
223 aa  72  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2357  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.47 
 
 
212 aa  72  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.27 
 
 
226 aa  71.6  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2074  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.51 
 
 
225 aa  71.2  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.51 
 
 
225 aa  70.5  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.66 
 
 
231 aa  70.5  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.04 
 
 
226 aa  70.9  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0718  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.35 
 
 
224 aa  70.5  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  22.52 
 
 
225 aa  70.5  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0388  cAMP-regulatory protein  26.49 
 
 
212 aa  70.9  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0189183  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.9 
 
 
226 aa  70.1  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
226 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3800  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.32 
 
 
225 aa  70.1  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.67 
 
 
242 aa  70.1  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03580  putative transcriptional regulator  25.74 
 
 
228 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000980911  hitchhiker  0.0000000000977836 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4577  cAMP-regulatory protein  27.42 
 
 
214 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0351  putative transcriptional regulator  26.24 
 
 
228 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3421  Crp/Fnr family transcriptional regulator  25.26 
 
 
232 aa  69.3  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1557  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.7 
 
 
234 aa  69.3  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.986178 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.04 
 
 
225 aa  69.7  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5506  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.12 
 
 
246 aa  69.3  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.324567  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  26.84 
 
 
225 aa  68.9  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4277  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.25 
 
 
234 aa  68.9  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5316  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.72 
 
 
354 aa  68.9  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.27 
 
 
224 aa  68.6  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0369  cAMP-regulatory protein  26.29 
 
 
210 aa  68.6  0.00000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0293  cAMP-regulatory protein  26.29 
 
 
210 aa  68.9  0.00000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160804  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2191  cAMP-regulatory protein  26.29 
 
 
210 aa  68.9  0.00000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0292  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.88 
 
 
224 aa  68.6  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.210312  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1523  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.63 
 
 
231 aa  68.6  0.00000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2796  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.1 
 
 
250 aa  68.6  0.00000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6885  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24 
 
 
240 aa  68.2  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0303  cyclic nucleotide-binding domain protein  24.08 
 
 
236 aa  67.8  0.0000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.232206 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0505  cyclic nucleotide-binding protein  27.5 
 
 
224 aa  67.8  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.287437  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3227  CRP/FNR family transcriptional regulator  21.66 
 
 
232 aa  67.8  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4286  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.11 
 
 
241 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2102  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
227 aa  68.2  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1853  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.91 
 
 
240 aa  68.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0253  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.57 
 
 
224 aa  68.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3771  cAMP-regulatory protein  25.71 
 
 
210 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal  0.523362 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46100  cAMP-regulatory protein  24.44 
 
 
215 aa  67  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  26.32 
 
 
228 aa  67.4  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0979  cAMP-binding protein  24.51 
 
 
239 aa  67.4  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3663  cAMP-regulatory protein  25.71 
 
 
210 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.185514  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0755  cAMP-regulatory protein  22.83 
 
 
211 aa  67  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.276204 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3737  cAMP-regulatory protein  25.71 
 
 
210 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0176942 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3292  cAMP-regulatory protein  25.57 
 
 
211 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0112541  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3663  cAMP-regulatory protein  25.71 
 
 
210 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0252  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.4 
 
 
218 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000185636  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3834  cAMP-regulatory protein  25.71 
 
 
210 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.429858  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  25 
 
 
224 aa  67  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3733  cAMP-regulatory protein  25.71 
 
 
210 aa  67  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4667  cAMP-regulatory protein  25.71 
 
 
210 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00224827  normal  0.233908 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3784  cAMP-regulatory protein  25.71 
 
 
210 aa  66.6  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0916512  hitchhiker  0.00483948 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>