104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0165 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0165  cyclic nucleotide-binding  100 
 
 		 124 aa  250  6e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2490  cyclic nucleotide-binding protein  30.19 
 
 		 143 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.529165  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2535  cyclic nucleotide-binding protein  30.19 
 
 		 143 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.187626  normal  0.577012 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2527  cyclic nucleotide-binding protein  30.19 
 
 		 143 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.122265 
 
 
-
 
NC_004310  BR2005  cyclic nucleotide-binding protein  31.9 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1928  cyclic nucleotide-binding protein  31.9 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0964  cyclic nucleotide-binding protein  28.7 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5607  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit  26.23 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0049  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 252 aa  53.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.422683  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3425  cyclic nucleotide-binding protein  30.56 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1926  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.83 
 
 		 168 aa  51.6  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28 
 
 		 225 aa  51.6  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2270  cyclic nucleotide-binding protein  36.04 
 
 		 477 aa  50.4  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00166052 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0922  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.93 
 
 		 597 aa  50.1  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.47 
 
 		 223 aa  50.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  27.45 
 
 		 220 aa  49.3  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5981  cyclic nucleotide-binding protein  27.05 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.77 
 
 		 231 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1482  hypothetical protein  28.97 
 
 		 401 aa  48.9  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1243  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.63 
 
 		 231 aa  48.9  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00145976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4187  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.84 
 
 		 254 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.338954  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7131  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.05 
 
 		 155 aa  48.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.331754 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3348  cyclic nucleotide-binding  29.6 
 
 		 254 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0090  cyclic nucleotide-binding protein  33.65 
 
 		 177 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247588  normal  0.0443693 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1501  hypothetical protein  28.97 
 
 		 401 aa  47.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2352  cyclic nucleotide-binding protein  34.88 
 
 		 154 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.674498  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_12211  predicted protein  30 
 
 		 528 aa  47.8  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3166  cyclic nucleotide-binding protein  25.86 
 
 		 482 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3673  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.84 
 
 		 254 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1878  cyclic nucleotide-binding protein  32.97 
 
 		 275 aa  47.4  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.116046  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1517  cyclic nucleotide-binding protein  34.88 
 
 		 154 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0629843  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 226 aa  47.4  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4881  putative cyclic-AMP receptor-like protein  34.21 
 
 		 281 aa  47.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353478  normal  0.139273 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2894  cyclic nucleotide-binding protein  26.72 
 
 		 482 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00660929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1592  cyclic nucleotide-binding protein  25.78 
 
 		 368 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.116595 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1612  cyclic nucleotide-binding protein  34.88 
 
 		 154 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0343  cyclic nucleotide-binding protein  28.23 
 
 		 811 aa  47  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0783507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1521  cyclic nucleotide-binding protein  34.88 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.000183504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2732  cyclic nucleotide-binding protein  31.03 
 
 		 425 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3370  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.03 
 
 		 425 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1803  cyclic nucleotide-binding protein  32.71 
 
 		 271 aa  46.2  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00580763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4601  cyclic nucleotide-binding protein  25 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.930738 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0144  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  24.62 
 
 		 227 aa  45.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.993696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1061  Crp family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 214 aa  45.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0336611  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0718  cyclic nucleotide-binding  24.07 
 
 		 747 aa  45.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00567448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2199  cyclic nucleotide-binding protein  25.62 
 
 		 357 aa  45.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0841  cyclic nucleotide-binding protein  25 
 
 		 160 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  31.87 
 
 		 225 aa  45.1  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1486  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 240 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0161  cyclic nucleotide-binding protein  30.77 
 
 		 161 aa  44.7  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4818  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 224 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4904  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 224 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63653  Leucine rich repeat protein, contains F-box  35.63 
 
 		 868 aa  44.3  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.422768  normal  0.952681 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5205  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 224 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  hitchhiker  0.000819508 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13707  Cpr/FNR family transcriptional regulator  25 
 
 		 224 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0333343 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3761  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 227 aa  44.3  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0509841  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1037  cyclic nucleotide-binding protein  23.77 
 
 		 227 aa  44.3  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.272663 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3019  cyclic nucleotide-binding protein  28.04 
 
 		 149 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.852704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3539  cyclic nucleotide-binding protein  25.4 
 
 		 857 aa  43.5  0.0009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0290793  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04510  cyclic nucleotide-binding domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G03170)  34.83 
 
 		 923 aa  43.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  28.7 
 
 		 228 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2514  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 231 aa  43.5  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.619242 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1513  cyclic nucleotide-binding protein  29.91 
 
 		 308 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00604424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5435  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 224 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1371  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 224 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0955358 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3546  cyclic nucleotide-binding  29.13 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.194157 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3692  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  24.47 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1954  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4893  cyclic nucleotide-binding protein  24.59 
 
 		 237 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.7 
 
 		 225 aa  42  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3368  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.07 
 
 		 503 aa  42.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00879958  normal  0.135189 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1892  cyclic nucleotide-binding protein  23.85 
 
 		 147 aa  41.6  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.326195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5013  cyclic nucleotide-binding protein  28.7 
 
 		 147 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.32822  normal  0.191008 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2303  MscS Mechanosensitive ion channel  27 
 
 		 512 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.697138  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3035  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.49 
 
 		 224 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.738115  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0505  cyclic nucleotide-binding protein  25 
 
 		 224 aa  41.6  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.287437  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2257  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.84 
 
 		 234 aa  41.6  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000784359  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2725  cyclic nucleotide binding/GGDEF domain-containing protein  26 
 
 		 322 aa  41.2  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.792666  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0664  cyclic nucleotide-binding  32.14 
 
 		 449 aa  41.6  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0101822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1472  CAAX amino terminal protease family  25.24 
 
 		 381 aa  41.6  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.407531  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 226 aa  41.6  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0386  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.19 
 
 		 340 aa  41.2  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4730  cyclic nucleotide-binding protein  35.62 
 
 		 286 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.813554  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 225 aa  41.2  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4790  cyclic nucleotide-binding protein  26.61 
 
 		 170 aa  41.2  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1291  cyclic nucleotide-binding protein  29.89 
 
 		 164 aa  41.2  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.234039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2719  cyclic nucleotide-binding protein  28.04 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.460468  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0432  cyclic nucleotide-binding protein  24.39 
 
 		 860 aa  41.2  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2911  cyclic nucleotide-binding protein  35.29 
 
 		 1124 aa  41.2  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.965385  normal  0.0176228 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.74 
 
 		 226 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4903  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  38.6 
 
 		 163 aa  40.8  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.533642 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4137  cyclic nucleotide-binding protein  25.78 
 
 		 177 aa  40.8  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.252066 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.36 
 
 		 242 aa  40.8  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3494  cyclic nucleotide-binding protein  25.78 
 
 		 173 aa  40.8  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4388  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 225 aa  40.8  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4405  cyclic nucleotide-binding protein  27.1 
 
 		 148 aa  40.8  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4944  cyclic nucleotide-binding protein  29.59 
 
 		 454 aa  40.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0056  cyclic nucleotide-binding  26.77 
 
 		 739 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1494  cyclic nucleotide-binding protein  30.56 
 
 		 119 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00548568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1814  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.87 
 
 		 242 aa  40.4  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.38579  normal  0.245711 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>