More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3689 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3689  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 
454 aa  931    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120597  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2270  cyclic nucleotide-binding protein  44.19 
 
 
477 aa  356  5e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00166052 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3166  cyclic nucleotide-binding protein  42.37 
 
 
482 aa  343  4e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363184  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2894  cyclic nucleotide-binding protein  40.93 
 
 
482 aa  339  7e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00660929  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5160  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.18 
 
 
739 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.8765  normal  0.911102 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0343  cyclic nucleotide-binding protein  26.04 
 
 
811 aa  113  7.000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0783507  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0301  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  22.7 
 
 
858 aa  98.6  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0590  cyclic nucleotide-binding protein  25.41 
 
 
801 aa  92.8  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.120802  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3368  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.83 
 
 
503 aa  80.5  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00879958  normal  0.135189 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.85 
 
 
224 aa  79.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
222 aa  76.3  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2571 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04987  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit (PKA regulatory subunit) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O59922]  30.49 
 
 
412 aa  75.1  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.599779  normal  0.51731 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_12211  predicted protein  39.78 
 
 
528 aa  73.2  0.000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0474  electron transport protein  32.92 
 
 
201 aa  72.8  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1755  Iron-sulfur cluster-binding protein  30.52 
 
 
149 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.176343  normal  0.108296 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4712  cyclic nucleotide-binding protein  32.28 
 
 
412 aa  72.4  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566577  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3152  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.24 
 
 
487 aa  71.6  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.833452  normal  0.47191 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1119  catabolite gene activator (cAMP receptor protein) (cAMP-regulatory protein)  33.33 
 
 
222 aa  70.5  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3800  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
225 aa  69.7  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2725  cyclic nucleotide binding/GGDEF domain-containing protein  30.4 
 
 
322 aa  69.3  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.792666  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2425  electron transport protein HydN  33.13 
 
 
180 aa  69.7  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.743401 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1915  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.33 
 
 
189 aa  68.9  0.0000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.936876  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2493  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.22 
 
 
149 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4598  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  30.97 
 
 
674 aa  67.4  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.3 
 
 
225 aa  67  0.0000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  26.37 
 
 
225 aa  67  0.0000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4278  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  34.78 
 
 
674 aa  67  0.0000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1792  electron transport protein HydN  30.87 
 
 
189 aa  66.6  0.0000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.288357  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  29.92 
 
 
419 aa  66.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5447  voltage-dependent potassium channel  33.6 
 
 
409 aa  65.1  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.532768  normal  0.0697598 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4038  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.92 
 
 
409 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1861  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.82 
 
 
212 aa  65.5  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00000613847  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  25 
 
 
225 aa  65.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4277  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.33 
 
 
173 aa  65.1  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2719  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 
151 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.460468  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1954  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  28.45 
 
 
141 aa  64.3  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05510  cAMP-dependent protein kinase inhibitor, putative  28.5 
 
 
482 aa  63.5  0.000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1378  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.92 
 
 
408 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.02 
 
 
225 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.15 
 
 
226 aa  62.8  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3212  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
229 aa  62.4  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0543887  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0911  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.71 
 
 
188 aa  62.8  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2387  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.28 
 
 
188 aa  62  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1037  cyclic nucleotide-binding protein  26.67 
 
 
227 aa  62  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.272663 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1598  hypothetical protein  24.07 
 
 
407 aa  62.4  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.303519  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4351  cyclic nucleotide-binding protein  28.29 
 
 
948 aa  62  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4011  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  30.97 
 
 
671 aa  62.4  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1286  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.43 
 
 
138 aa  61.2  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82287  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit (PKA regulatory subunit)  30.17 
 
 
441 aa  61.6  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.770378 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7131  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.47 
 
 
155 aa  61.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.331754 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3187  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.08 
 
 
177 aa  60.8  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.722972 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4405  cyclic nucleotide-binding protein  32.31 
 
 
148 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.45 
 
 
225 aa  60.8  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3019  cyclic nucleotide-binding protein  34.03 
 
 
149 aa  60.5  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.852704  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1887  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.63 
 
 
386 aa  60.5  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.796318  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1238  iron-sulfur cluster-binding protein  33.03 
 
 
149 aa  60.5  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4597  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.77 
 
 
169 aa  60.1  0.00000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4220  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  34.48 
 
 
667 aa  60.1  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2303  MscS Mechanosensitive ion channel  37.35 
 
 
512 aa  59.7  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.697138  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3122  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 
149 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5981  cyclic nucleotide-binding protein  29.93 
 
 
155 aa  59.7  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2896  cyclic nucleotide-binding  33.33 
 
 
194 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.633977  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1737  cyclic nucleotide-binding protein  25 
 
 
584 aa  59.7  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.987776 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13268  transmembrane transport protein  30.43 
 
 
1048 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.321047 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0538  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.58 
 
 
151 aa  58.9  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.957974  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3831  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  31.33 
 
 
671 aa  58.9  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2905  cyclic nucleotide-binding protein  27.73 
 
 
157 aa  58.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0600936 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5417  cyclic nucleotide-binding protein  27.2 
 
 
419 aa  58.9  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0881735  normal  0.0681678 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0962  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.54 
 
 
173 aa  58.9  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.23059 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3684  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  31.33 
 
 
671 aa  58.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3692  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.72 
 
 
146 aa  58.2  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6888  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  31.3 
 
 
506 aa  58.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3249  cyclic nucleotide-binding protein  30.38 
 
 
171 aa  58.2  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2607  cyclic nucleotide-binding protein  27.36 
 
 
215 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2700  cyclic nucleotide-binding protein  27.36 
 
 
215 aa  57.8  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00108848  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00910  Fe-S-cluster-containing hydrogenase subunit  33.77 
 
 
177 aa  57.8  0.0000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.36 
 
 
219 aa  57.8  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0309  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  30.72 
 
 
212 aa  57.4  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.600557  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2614  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  31.53 
 
 
659 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2775  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  30.84 
 
 
493 aa  57.4  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.85719 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2747  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  31.53 
 
 
659 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02359  fused predicted oxidoreductase: FeS binding subunit/NAD/FAD-binding subunit  31.53 
 
 
659 aa  57.4  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02563  formate dehydrogenase-H, [4Fe-4S] ferredoxin subunit  30.57 
 
 
175 aa  57.4  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1209  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  31.53 
 
 
659 aa  57.4  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0976  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.57 
 
 
175 aa  57.4  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.961546  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1202  glutamate synthase, small subunit  31.53 
 
 
659 aa  57.4  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0572  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.39 
 
 
398 aa  57  0.0000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3963  electron transport protein HydN  30.57 
 
 
175 aa  57.4  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0619  NrfC protein  30.53 
 
 
180 aa  57  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.2857  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0731  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  33.03 
 
 
652 aa  57.4  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.272693  normal  0.130877 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3689  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  31.53 
 
 
659 aa  57.4  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3164  electron transport protein HydN  30.57 
 
 
175 aa  57.4  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0999  electron transport protein HydN  30.57 
 
 
175 aa  57.4  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00184229 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2836  electron transport protein HydN  30.57 
 
 
175 aa  57.4  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0600195 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2849  electron transport protein HydN  30.57 
 
 
175 aa  57.4  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2597  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  31.53 
 
 
659 aa  57.4  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02321  hypothetical protein  31.53 
 
 
659 aa  57.4  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02528  hypothetical protein  30.57 
 
 
175 aa  57.4  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2997  electron transport protein HydN  30.57 
 
 
175 aa  57.4  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2440  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  30 
 
 
509 aa  57.4  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00769093 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>