50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0834 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0834  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 209 aa  412  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.572776  normal  0.0230513 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0779  beta-lactamase domain-containing protein  88.04 
 
 		 209 aa  367  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00376489 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2372  hypothetical protein  42.4 
 
 		 218 aa  182  3e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000518182 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8107  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  44.71 
 
 		 213 aa  175  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.880761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35790  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold family  48.17 
 
 		 213 aa  167  1e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2841  beta-lactamase domain-containing protein  45.75 
 
 		 210 aa  167  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3973  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  44.6 
 
 		 214 aa  165  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4981  beta-lactamase domain-containing protein  43.4 
 
 		 209 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0220064 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0058  hypothetical protein  42.45 
 
 		 212 aa  161  5.0000000000000005e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00690  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold  43.33 
 
 		 215 aa  149  3e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3615  beta-lactamase domain protein  43.39 
 
 		 215 aa  147  9e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.674887  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2637  hypothetical protein  47.83 
 
 		 190 aa  145  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.48007  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3460  beta-lactamase domain protein  40.57 
 
 		 219 aa  146  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.443408  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1622  beta-lactamase domain-containing protein  39.15 
 
 		 216 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5131  beta-lactamase domain-containing protein  37.09 
 
 		 218 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4555  beta-lactamase-like protein  37.91 
 
 		 217 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4643  beta-lactamase domain-containing protein  37.91 
 
 		 217 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10801  hypothetical protein  39.42 
 
 		 212 aa  138  4.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4938  beta-lactamase domain-containing protein  37.56 
 
 		 217 aa  138  7e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.248634 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4081  putative Zn-dependent hydrolase  39.9 
 
 		 216 aa  136  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.921082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0379  hypothetical protein  37.88 
 
 		 211 aa  131  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.760291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38030  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  38.16 
 
 		 211 aa  129  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2098  beta-lactamase domain-containing protein  38.97 
 
 		 219 aa  128  5.0000000000000004e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.244954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0515  beta-lactamase domain-containing protein  39.9 
 
 		 211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6881  beta-lactamase domain protein  42.11 
 
 		 207 aa  125  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5062  beta-lactamase domain protein  39.46 
 
 		 209 aa  117  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1742  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  37.44 
 
 		 219 aa  117  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.611049  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1881  Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold family  43.68 
 
 		 214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.187473 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23370  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold  37.32 
 
 		 241 aa  107  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0545  hypothetical protein  30.77 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0125992 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1819  hypothetical protein  26.67 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1645  hypothetical protein  27.18 
 
 		 223 aa  49.3  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.787985 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1334  beta-lactamase domain protein  32.32 
 
 		 263 aa  46.6  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0154  hypothetical protein  26.04 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.61111  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1509  hypothetical protein  22.65 
 
 		 218 aa  43.9  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00164227  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2464  outer membrane protein  30.43 
 
 		 159 aa  43.1  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000287892  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4741  metal-dependent hydrolase  26.04 
 
 		 227 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4442  metal-dependent hydrolase  25.44 
 
 		 228 aa  43.1  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.187711  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2114  hydroxyacylglutathione hydrolase  32 
 
 		 260 aa  43.1  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000176506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1725  beta-lactamase domain protein  25.75 
 
 		 235 aa  42.7  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12233  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2688  hypothetical protein  30.43 
 
 		 320 aa  42.7  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2503  hypothetical protein  30.43 
 
 		 320 aa  42.7  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00407253  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0072  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  31.94 
 
 		 215 aa  42.4  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3294  metal-dependent hydrolase  30.86 
 
 		 227 aa  42  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.692615  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1677  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 367 aa  42  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0836093 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2601  outer membrane protein RomA  30.43 
 
 		 320 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000137657 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0515  metal-dependent hydrolase  25.44 
 
 		 227 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4722  metal-dependent hydrolase  25.44 
 
 		 227 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6475  beta-lactamase domain-containing protein  30.21 
 
 		 538 aa  41.6  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3422  beta-lactamase domain protein  36.67 
 
 		 535 aa  41.6  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0195853  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>