58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5062 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5062  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 209 aa  417  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10801  hypothetical protein  46.23 
 
 		 212 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4938  beta-lactamase domain-containing protein  44.44 
 
 		 217 aa  161  6e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.248634 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4555  beta-lactamase-like protein  46.08 
 
 		 217 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4643  beta-lactamase domain-containing protein  46.08 
 
 		 217 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3460  beta-lactamase domain protein  46.32 
 
 		 219 aa  160  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.443408  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6881  beta-lactamase domain protein  42.38 
 
 		 207 aa  159  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38030  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  40.87 
 
 		 211 aa  157  9e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1622  beta-lactamase domain-containing protein  47.03 
 
 		 216 aa  156  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5131  beta-lactamase domain-containing protein  46.24 
 
 		 218 aa  155  4e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3615  beta-lactamase domain protein  43.39 
 
 		 215 aa  147  8e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.674887  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2098  beta-lactamase domain-containing protein  41.75 
 
 		 219 aa  142  5e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.244954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4081  putative Zn-dependent hydrolase  39.57 
 
 		 216 aa  135  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.921082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8107  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  36.96 
 
 		 213 aa  131  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.880761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4981  beta-lactamase domain-containing protein  37.31 
 
 		 209 aa  128  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0220064 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3973  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  38.04 
 
 		 214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0515  beta-lactamase domain-containing protein  37.67 
 
 		 211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35790  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold family  37.24 
 
 		 213 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0058  hypothetical protein  36.22 
 
 		 212 aa  122  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1742  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  38.1 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.611049  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00690  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold  35.41 
 
 		 215 aa  117  9e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0834  beta-lactamase domain-containing protein  39.46 
 
 		 209 aa  117  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.572776  normal  0.0230513 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2841  beta-lactamase domain-containing protein  34.95 
 
 		 210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0379  hypothetical protein  35.14 
 
 		 211 aa  112  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.760291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0779  beta-lactamase domain-containing protein  38.38 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00376489 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2372  hypothetical protein  31.98 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000518182 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1881  Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold family  35.96 
 
 		 214 aa  95.5  5e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.187473 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23370  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold  33.91 
 
 		 241 aa  93.2  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2637  hypothetical protein  33.1 
 
 		 190 aa  83.6  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.48007  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2914  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like  26.87 
 
 		 255 aa  53.9  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1819  hypothetical protein  29.23 
 
 		 223 aa  51.6  0.000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2407  beta-lactamase domain protein  28.14 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000667891  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1599  Zn-dependent hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  26.74 
 
 		 243 aa  50.1  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1509  hypothetical protein  26.37 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00164227  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2131  hypothetical protein  29.26 
 
 		 208 aa  45.8  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.605971  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2199  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  24.5 
 
 		 499 aa  45.1  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0635  metal-dependent hydrolase  26.5 
 
 		 226 aa  45.1  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000707665  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1769  metal-dependent hydrolase  32.69 
 
 		 234 aa  45.1  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1586  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  26.8 
 
 		 277 aa  45.1  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.600595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1628  hypothetical protein  28.14 
 
 		 221 aa  44.3  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2570  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like  26.18 
 
 		 258 aa  44.3  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.950272  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3786  beta-lactamase domain-containing protein  31.36 
 
 		 243 aa  44.3  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.295357 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0810  metal-dependent hydrolase  29.53 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0545  hypothetical protein  28.42 
 
 		 223 aa  43.9  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0125992 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1715  metal-dependent hydrolase  32.74 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.207116 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0942  metal-dependent hydrolase  32.11 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.338724  normal  0.244099 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1271  hypothetical protein  26.52 
 
 		 220 aa  43.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.384497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0315  metal-dependent hydrolase  23.62 
 
 		 223 aa  42.7  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00468893  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2530  metallo-beta-lactamase family protein YycJ  25.44 
 
 		 266 aa  42.7  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.22966  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1519  metal-dependent hydrolase  32.74 
 
 		 234 aa  42.4  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.835845 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2724  hypothetical protein  25.58 
 
 		 247 aa  42.4  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.550274 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1362  metal-dependent hydrolase  35.37 
 
 		 234 aa  42.4  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0022  beta-lactamase domain-containing protein  25.86 
 
 		 266 aa  42  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0022  beta-lactamase domain-containing protein  25.86 
 
 		 266 aa  42  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1653  metal-dependent hydrolase  24.26 
 
 		 226 aa  42  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.348192  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0574  beta-lactamase domain-containing protein  31.25 
 
 		 230 aa  41.6  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.087898  normal  0.169456 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1587  metal-dependent hydrolase  22.67 
 
 		 226 aa  41.2  0.01  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.725937  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1645  hypothetical protein  29.31 
 
 		 223 aa  41.6  0.01  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.787985 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>