44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2841 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2841  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
210 aa  426  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8107  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  68.08 
 
 
213 aa  298  6e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.880761  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3973  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  49.07 
 
 
214 aa  205  4e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35790  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold family  51.89 
 
 
213 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2372  hypothetical protein  45.87 
 
 
218 aa  195  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000518182 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0058  hypothetical protein  49.06 
 
 
212 aa  192  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4981  beta-lactamase domain-containing protein  45.58 
 
 
209 aa  173  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0220064 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0779  beta-lactamase domain-containing protein  45.02 
 
 
209 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00376489 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0834  beta-lactamase domain-containing protein  45.75 
 
 
209 aa  167  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.572776  normal  0.0230513 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0515  beta-lactamase domain-containing protein  44.65 
 
 
211 aa  157  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0379  hypothetical protein  41.04 
 
 
211 aa  141  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.760291  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00690  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold  39.71 
 
 
215 aa  139  3.9999999999999997e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2637  hypothetical protein  48.75 
 
 
190 aa  135  4e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.48007  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2098  beta-lactamase domain-containing protein  38.89 
 
 
219 aa  132  5e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.244954  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10801  hypothetical protein  41.85 
 
 
212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4938  beta-lactamase domain-containing protein  42.11 
 
 
217 aa  128  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.248634 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4643  beta-lactamase domain-containing protein  42.11 
 
 
217 aa  128  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4555  beta-lactamase-like protein  42.11 
 
 
217 aa  128  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3460  beta-lactamase domain protein  35.45 
 
 
219 aa  126  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.443408  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38030  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  35.05 
 
 
211 aa  126  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1742  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  38.81 
 
 
219 aa  121  7e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.611049  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1622  beta-lactamase domain-containing protein  38 
 
 
216 aa  119  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5131  beta-lactamase domain-containing protein  36.45 
 
 
218 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5062  beta-lactamase domain protein  34.95 
 
 
209 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1881  Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold family  41.62 
 
 
214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.187473 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4081  putative Zn-dependent hydrolase  35.5 
 
 
216 aa  109  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.921082  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3615  beta-lactamase domain protein  32.88 
 
 
215 aa  106  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.674887  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6881  beta-lactamase domain protein  36.76 
 
 
207 aa  106  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23370  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold  31.75 
 
 
241 aa  77  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0545  hypothetical protein  27.23 
 
 
223 aa  55.8  0.0000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0125992 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1645  hypothetical protein  26.94 
 
 
223 aa  49.3  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.787985 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1819  hypothetical protein  25.65 
 
 
223 aa  48.5  0.00007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3920  putative metal-dependent hydrolase  25.67 
 
 
244 aa  46.6  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.39883 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1725  beta-lactamase domain protein  27.59 
 
 
235 aa  46.2  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12233  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2131  hypothetical protein  30.27 
 
 
208 aa  44.3  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.605971  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1509  hypothetical protein  23.91 
 
 
218 aa  43.1  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00164227  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1287  beta-lactamase superfamily hydrolase  24.56 
 
 
230 aa  43.1  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.66334  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2047  DNA polymerase III epsilon subunit  24.44 
 
 
200 aa  43.5  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0204926  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1628  hypothetical protein  26.29 
 
 
221 aa  42.4  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2153  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 
262 aa  41.6  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.250478  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0741  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  42 
 
 
208 aa  41.6  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0717  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  42 
 
 
208 aa  41.6  0.009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06151  putative hydroxyacylglutathione hydrolase  27.14 
 
 
303 aa  41.6  0.009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.117028  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2717  beta-lactamase superfamily hydrolase  30.71 
 
 
239 aa  41.6  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>