236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2131 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2131  hypothetical protein  100 
 
 
208 aa  422  1e-117  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.605971  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1697  hypothetical protein  62.32 
 
 
211 aa  275  3e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0154  hypothetical protein  48.53 
 
 
214 aa  194  5.000000000000001e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.61111  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0545  hypothetical protein  45.54 
 
 
223 aa  194  8.000000000000001e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0125992 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1645  hypothetical protein  43.19 
 
 
223 aa  186  2e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.787985 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1819  hypothetical protein  42.52 
 
 
223 aa  186  3e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1509  hypothetical protein  44.5 
 
 
218 aa  185  4e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00164227  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1271  hypothetical protein  47 
 
 
220 aa  176  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.384497  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1628  hypothetical protein  42.92 
 
 
221 aa  176  2e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16670  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold  42.36 
 
 
228 aa  169  3e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.242022 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2570  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like  36.92 
 
 
258 aa  115  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.950272  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3920  putative metal-dependent hydrolase  35.87 
 
 
244 aa  107  9.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.39883 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2914  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like  33.64 
 
 
255 aa  106  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1421  beta-lactamase domain-containing protein  33.65 
 
 
224 aa  102  5e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.831543  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0816  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
222 aa  95.9  4e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1646  hypothetical protein  32.09 
 
 
221 aa  94.7  9e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1063  beta-lactamase domain protein  29.67 
 
 
218 aa  93.6  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.575371  normal  0.476054 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0400  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  49.02 
 
 
190 aa  93.6  2e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.564256 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0204  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  48.54 
 
 
190 aa  92.8  3e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.000768603  normal  0.146366 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3716  metal-dependent hydrolase  27.19 
 
 
230 aa  90.9  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1358  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  31.92 
 
 
251 aa  90.9  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0896223 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1653  metal-dependent hydrolase  33.02 
 
 
226 aa  90.1  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.348192  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09183  putative metal-dependent hydrolase  34.01 
 
 
270 aa  88.2  9e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.607675  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0944  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  32.58 
 
 
277 aa  84.7  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1344  metal-dependent hydrolase  31.28 
 
 
228 aa  84  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.181884 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0300  metal-dependent hydrolase  32.34 
 
 
225 aa  84.3  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0136  metal-dependent hydrolase  31.72 
 
 
237 aa  84.7  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.609022  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1586  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  32.58 
 
 
277 aa  84  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.600595  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2288  hypothetical protein  29.25 
 
 
237 aa  84  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0210  hypothetical protein  31.34 
 
 
281 aa  82.8  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1310  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  36.3 
 
 
195 aa  82  0.000000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0262357  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1587  metal-dependent hydrolase  31.84 
 
 
226 aa  81.6  0.000000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.725937  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6076  putative metal-dependent hydrolase  31.03 
 
 
252 aa  80.1  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0613  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.57 
 
 
214 aa  79.7  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.093402  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3437  beta-lactamase-like  30.7 
 
 
233 aa  79  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1154  hypothetical protein  32.51 
 
 
219 aa  79  0.00000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2279  beta-lactamase domain protein  31.65 
 
 
230 aa  78.6  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1816  beta-lactamase domain-containing protein  35.62 
 
 
265 aa  77.4  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.604126  normal  0.629992 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0529  hypothetical protein  27.65 
 
 
235 aa  77.4  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.251005  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1073  metal-dependent hydrolase  27.14 
 
 
227 aa  77.8  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.316137  normal  0.112797 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0306  beta-lactamase domain protein  31.61 
 
 
227 aa  76.6  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1524  beta-lactamase domain-containing protein  29 
 
 
285 aa  76.3  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2724  hypothetical protein  27.04 
 
 
247 aa  76.6  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.550274 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0151  metallo-beta-lactamase family protein  30.43 
 
 
240 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1196  beta-lactamase domain protein  29.57 
 
 
274 aa  75.9  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0081  beta-lactamase domain-containing protein  28.12 
 
 
239 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.316272  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0315  metal-dependent hydrolase  30.33 
 
 
223 aa  75.1  0.0000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00468893  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0606  hypothetical protein  26.34 
 
 
248 aa  74.7  0.0000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.431786 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0029  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  29.67 
 
 
211 aa  74.3  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1068  Beta-lactamase-like  29.61 
 
 
274 aa  74.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1774  beta-lactamase domain protein  29.63 
 
 
239 aa  74.3  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.613108  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1127  beta-lactamase domain protein  27.83 
 
 
274 aa  74.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.852965  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1161  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  30.6 
 
 
228 aa  73.6  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.412204  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1261  beta-lactamase-like protein  30.09 
 
 
242 aa  73.9  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.191714  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2419  hypothetical protein  27.47 
 
 
209 aa  73.2  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000960503  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1443  beta-lactamase domain protein  28.22 
 
 
224 aa  73.9  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.995838  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0731  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold  28.44 
 
 
223 aa  72.8  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000173292  normal  0.767242 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1705  beta-lactamase-like  27.31 
 
 
219 aa  72.8  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0635  metal-dependent hydrolase  28.84 
 
 
226 aa  72.8  0.000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000707665  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0803  metal-dependent hydrolase  29.78 
 
 
237 aa  72.8  0.000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000737495 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1074  metal-dependent hydrolase  28.31 
 
 
225 aa  73.2  0.000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5227  beta-lactamase domain protein  29.19 
 
 
224 aa  72.4  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0583  beta-lactamase domain protein  27.85 
 
 
225 aa  72  0.000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1740  metal-dependent hydrolase  26.94 
 
 
228 aa  72  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0849685  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0810  metal-dependent hydrolase  28.91 
 
 
225 aa  72  0.000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2127  metallo-beta-lactamase family protein  27.56 
 
 
246 aa  72  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1933  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  27.8 
 
 
211 aa  71.6  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0072  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  28.65 
 
 
215 aa  70.5  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4324  beta-lactamase-like  30.25 
 
 
273 aa  70.5  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0171  beta-lactamase domain protein  27.06 
 
 
266 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.389307  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0741  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.87 
 
 
208 aa  69.7  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0489  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  28.5 
 
 
248 aa  69.3  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1093  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold protein  23.9 
 
 
211 aa  69.3  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1920  beta-lactamase-like  28.44 
 
 
230 aa  69.3  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.74415 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1348  metal-dependent hydrolase  28.77 
 
 
225 aa  69.3  0.00000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.324127  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1493  metal-dependent hydrolase  27.48 
 
 
228 aa  68.6  0.00000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.264611  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0717  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.87 
 
 
208 aa  68.6  0.00000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4201  beta-lactamase domain-containing protein  28.64 
 
 
227 aa  68.6  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0341  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  30.14 
 
 
291 aa  68.6  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17310  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold protein  29.08 
 
 
212 aa  68.2  0.00000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0225  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  29.41 
 
 
213 aa  67.8  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2337  beta-lactamase domain protein  27.85 
 
 
222 aa  67.8  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0962  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 
230 aa  67  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2407  beta-lactamase domain protein  26.73 
 
 
233 aa  66.2  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000667891  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1763  metal-dependent hydrolase  28.12 
 
 
229 aa  66.2  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1797  metal-dependent hydrolase  28.12 
 
 
229 aa  66.2  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1075  beta-lactamase domain protein  26.85 
 
 
227 aa  65.5  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0220029  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2467  hypothetical protein  26.51 
 
 
292 aa  65.1  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0050  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  28.77 
 
 
210 aa  64.7  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000302941  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1519  metal-dependent hydrolase  30.47 
 
 
234 aa  62.8  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.835845 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2220  beta-lactamase domain-containing protein  28.85 
 
 
225 aa  62.8  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2596  beta-lactamase domain protein  25.56 
 
 
236 aa  62.4  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.477747  normal  0.239808 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2788  UPF0173 metal-dependent hydrolase  31.98 
 
 
230 aa  62  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0574  beta-lactamase domain-containing protein  29.63 
 
 
230 aa  62  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.087898  normal  0.169456 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1487  Zn-dependent hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  25.14 
 
 
212 aa  62  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4313  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  30.81 
 
 
261 aa  62  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.678939  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1270  metal-dependent hydrolase  28.37 
 
 
229 aa  60.5  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2368  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 
227 aa  60.1  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.355207  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5695  metal-dependent hydrolase  27.56 
 
 
291 aa  60.5  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1184  hypothetical protein  26.18 
 
 
210 aa  60.5  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482246  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>