91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2098 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2098  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
219 aa  423  1e-117  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.244954  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0515  beta-lactamase domain-containing protein  49.74 
 
 
211 aa  159  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35790  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold family  45.37 
 
 
213 aa  158  5e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4981  beta-lactamase domain-containing protein  48.68 
 
 
209 aa  157  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0220064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8107  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  39.81 
 
 
213 aa  148  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.880761  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0058  hypothetical protein  42.59 
 
 
212 aa  148  7e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5062  beta-lactamase domain protein  41.75 
 
 
209 aa  142  5e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38030  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  39.5 
 
 
211 aa  139  3.9999999999999997e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1742  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  43.12 
 
 
219 aa  137  8.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.611049  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0379  hypothetical protein  46.84 
 
 
211 aa  137  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.760291  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2841  beta-lactamase domain-containing protein  38.89 
 
 
210 aa  132  5e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0779  beta-lactamase domain-containing protein  40.82 
 
 
209 aa  132  5e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00376489 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3973  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  35.48 
 
 
214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1622  beta-lactamase domain-containing protein  39.06 
 
 
216 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0834  beta-lactamase domain-containing protein  38.97 
 
 
209 aa  128  6e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.572776  normal  0.0230513 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3615  beta-lactamase domain protein  38.73 
 
 
215 aa  128  7.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.674887  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10801  hypothetical protein  38.92 
 
 
212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00690  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold  41.31 
 
 
215 aa  125  4.0000000000000003e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4555  beta-lactamase-like protein  36.32 
 
 
217 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4938  beta-lactamase domain-containing protein  37.77 
 
 
217 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.248634 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4643  beta-lactamase domain-containing protein  36.32 
 
 
217 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5131  beta-lactamase domain-containing protein  36.79 
 
 
218 aa  124  8.000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3460  beta-lactamase domain protein  35.35 
 
 
219 aa  123  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.443408  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6881  beta-lactamase domain protein  40.86 
 
 
207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2372  hypothetical protein  36.36 
 
 
218 aa  115  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000518182 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1881  Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold family  43.81 
 
 
214 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.187473 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4081  putative Zn-dependent hydrolase  35.38 
 
 
216 aa  108  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.921082  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23370  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold  37.05 
 
 
241 aa  99.8  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2637  hypothetical protein  39.39 
 
 
190 aa  88.2  8e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.48007  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0154  hypothetical protein  31.52 
 
 
214 aa  72  0.000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.61111  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16670  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold  30.92 
 
 
228 aa  64.7  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.242022 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2570  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like  25.95 
 
 
258 aa  64.7  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.950272  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0545  hypothetical protein  27.17 
 
 
223 aa  58.2  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0125992 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1344  metal-dependent hydrolase  24.62 
 
 
228 aa  56.2  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.181884 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1599  Zn-dependent hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  24.74 
 
 
243 aa  55.1  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1819  hypothetical protein  28.57 
 
 
223 aa  55.1  0.0000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1645  hypothetical protein  28.57 
 
 
223 aa  54.3  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.787985 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1509  hypothetical protein  28.74 
 
 
218 aa  54.3  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00164227  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1628  hypothetical protein  30.16 
 
 
221 aa  53.5  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3920  putative metal-dependent hydrolase  27.04 
 
 
244 aa  53.5  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.39883 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2467  hypothetical protein  32.95 
 
 
292 aa  54.3  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1402  hypothetical protein  26.67 
 
 
210 aa  53.5  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.492641  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1211  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  25 
 
 
210 aa  52  0.000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000127632  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2696  metal-dependent hydrolase  26.84 
 
 
226 aa  50.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0050  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  28.79 
 
 
210 aa  51.2  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000302941  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1184  hypothetical protein  25.35 
 
 
210 aa  51.2  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482246  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2914  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like  24.86 
 
 
255 aa  50.4  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1271  hypothetical protein  28.02 
 
 
220 aa  50.1  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.384497  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6275  hypothetical protein  28.8 
 
 
281 aa  50.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2131  hypothetical protein  32.78 
 
 
208 aa  50.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.605971  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2337  beta-lactamase domain protein  25.52 
 
 
222 aa  48.5  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0721  metallo-beta-lactamase superfamily protein  30.65 
 
 
269 aa  48.5  0.00008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1697  hypothetical protein  28.25 
 
 
211 aa  48.5  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1816  beta-lactamase domain-containing protein  26.53 
 
 
265 aa  47.8  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.604126  normal  0.629992 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0944  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.75 
 
 
277 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4313  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.87 
 
 
261 aa  47  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.678939  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0072  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  25.39 
 
 
215 aa  46.6  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1161  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  28.72 
 
 
228 aa  46.6  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.412204  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3294  metal-dependent hydrolase  23.12 
 
 
227 aa  46.2  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.692615  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4442  metal-dependent hydrolase  24.37 
 
 
228 aa  46.2  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.187711  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2596  beta-lactamase domain protein  22.22 
 
 
236 aa  46.2  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.477747  normal  0.239808 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0315  metal-dependent hydrolase  24.87 
 
 
223 aa  46.2  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00468893  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2786  beta-lactamase domain-containing protein  26.04 
 
 
225 aa  45.4  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.480164  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4741  metal-dependent hydrolase  25.38 
 
 
227 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0300  metal-dependent hydrolase  27.55 
 
 
225 aa  45.4  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2419  hypothetical protein  23.53 
 
 
209 aa  45.1  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000960503  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0767  metal-dependent hydrolase  25.37 
 
 
226 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1740  metal-dependent hydrolase  22.73 
 
 
228 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0849685  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1586  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  26.19 
 
 
277 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.600595  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3555  beta-lactamase domain-containing protein  24.08 
 
 
300 aa  44.7  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000166822  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4343  metal-dependent hydrolase  24.37 
 
 
227 aa  43.5  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4747  metal-dependent hydrolase  23.86 
 
 
227 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0666  beta-lactamase domain protein  20.81 
 
 
229 aa  43.1  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389415  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0210  hypothetical protein  27.63 
 
 
281 aa  43.5  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1074  metal-dependent hydrolase  24.62 
 
 
225 aa  43.1  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0171  beta-lactamase domain protein  25 
 
 
266 aa  43.1  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.389307  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1324  putative L-ascorbate-6-phosphate lactonase UlaG  23.5 
 
 
353 aa  42.7  0.004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09183  putative metal-dependent hydrolase  22.56 
 
 
270 aa  42.7  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.607675  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4729  metal-dependent hydrolase  23.86 
 
 
227 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0810  metal-dependent hydrolase  26.15 
 
 
225 aa  42.7  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10861  hypothetical protein  25.29 
 
 
246 aa  42.7  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00208613 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0803  metal-dependent hydrolase  24.1 
 
 
237 aa  42.7  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000737495 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4860  metal-dependent hydrolase  23.86 
 
 
227 aa  42.4  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4354  metal-dependent hydrolase  23.86 
 
 
227 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4507  metal-dependent hydrolase  23.86 
 
 
227 aa  42.4  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1348  metal-dependent hydrolase  24.1 
 
 
225 aa  42  0.006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.324127  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4343  beta-lactamase domain-containing protein  27.23 
 
 
236 aa  42  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585725  normal  0.230491 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4722  metal-dependent hydrolase  24.37 
 
 
227 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0613  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  23.94 
 
 
214 aa  41.6  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.093402  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2724  hypothetical protein  26.94 
 
 
247 aa  42  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.550274 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1744  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  24.35 
 
 
223 aa  41.6  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0309934  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>