182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2419 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2419  hypothetical protein  100 
 
 		 209 aa  426  1e-118  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000960503  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1161  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  50.72 
 
 		 228 aa  223  2e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.412204  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1487  Zn-dependent hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  48.11 
 
 		 212 aa  210  1e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1933  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  43.81 
 
 		 211 aa  201  6e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17310  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold protein  45.02 
 
 		 212 aa  192  3e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1093  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold protein  43.6 
 
 		 211 aa  192  4e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0613  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  41.9 
 
 		 214 aa  191  5e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.093402  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0050  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  46.41 
 
 		 210 aa  191  7e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000302941  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0741  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  46.89 
 
 		 208 aa  189  4e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0717  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  46.33 
 
 		 208 aa  186  2e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0225  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  41.78 
 
 		 213 aa  174  9e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1211  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  40.87 
 
 		 210 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000127632  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1184  hypothetical protein  39.42 
 
 		 210 aa  170  2e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482246  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1402  hypothetical protein  39.42 
 
 		 210 aa  169  3e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.492641  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0029  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  39.52 
 
 		 211 aa  168  5e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0731  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold  39.45 
 
 		 223 aa  155  3e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000173292  normal  0.767242 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0072  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  42.78 
 
 		 215 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2441  zinc-dependent hydrolase, putative  36.45 
 
 		 217 aa  150  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2755  putative zinc-dependent hydrolase  35.71 
 
 		 217 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.332124  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3116  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  40 
 
 		 220 aa  145  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431062  hitchhiker  0.00109121 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2962  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  41.34 
 
 		 220 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00091403  hitchhiker  0.0000171806 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1744  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  38.94 
 
 		 223 aa  138  4.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0309934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1599  Zn-dependent hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  29.91 
 
 		 243 aa  120  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2779  twin-arginine translocation pathway signal  32.88 
 
 		 255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0213  conserved hypothetical protein  34.43 
 
 		 211 aa  112  3e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.132572  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4183  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  31.51 
 
 		 226 aa  107  9.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3372  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  29.82 
 
 		 262 aa  105  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.323472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2730  hypothetical protein  29.82 
 
 		 262 aa  105  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3370  hypothetical protein  33.33 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.19595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3012  putative Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold family  30.87 
 
 		 229 aa  99  5e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.47572  normal  0.288675 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2710  hypothetical protein  28.9 
 
 		 290 aa  98.2  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4992  hypothetical protein  30.14 
 
 		 255 aa  97.8  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.240402  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0622  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  34.95 
 
 		 202 aa  95.5  5e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2052  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  27.63 
 
 		 226 aa  89.4  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0437547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4491  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  28.38 
 
 		 254 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0399  hypothetical protein  27.32 
 
 		 250 aa  81.6  0.000000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0306  beta-lactamase domain protein  29.9 
 
 		 227 aa  81.6  0.000000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2129  hypothetical protein  31.25 
 
 		 240 aa  78.2  0.00000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1271  hypothetical protein  28.57 
 
 		 220 aa  77.8  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.384497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0300  metal-dependent hydrolase  29.77 
 
 		 225 aa  76.6  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2448  hypothetical protein  27.71 
 
 		 240 aa  76.3  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27441  Zn-dependent hydrolase  30.12 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0803  metal-dependent hydrolase  27.69 
 
 		 237 aa  75.9  0.0000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000737495 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0810  metal-dependent hydrolase  27.78 
 
 		 225 aa  76.3  0.0000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1628  hypothetical protein  27.69 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1819  hypothetical protein  28.72 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0816  beta-lactamase domain-containing protein  28.34 
 
 		 222 aa  74.7  0.0000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1509  hypothetical protein  28.04 
 
 		 218 aa  72.8  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00164227  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0496  hypothetical protein  31.36 
 
 		 289 aa  72.8  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1073  metal-dependent hydrolase  29.02 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.316137  normal  0.112797 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1075  beta-lactamase domain protein  27.55 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0220029  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3716  metal-dependent hydrolase  28.87 
 
 		 230 aa  71.2  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0635  metal-dependent hydrolase  26.77 
 
 		 226 aa  70.9  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000707665  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02031  Zn-dependent hydrolase  27.65 
 
 		 246 aa  70.9  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.141712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1834  hypothetical protein  26.94 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150106  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0136  metal-dependent hydrolase  31.68 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.609022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2337  beta-lactamase domain protein  26.18 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3633  hypothetical protein  26.15 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.719397  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1074  metal-dependent hydrolase  25.25 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0315  metal-dependent hydrolase  30 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00468893  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0483  hypothetical protein  26.94 
 
 		 268 aa  69.7  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.711637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1344  metal-dependent hydrolase  30.77 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.181884 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1705  beta-lactamase-like  26.74 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1645  hypothetical protein  26.67 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.787985 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7160  hypothetical protein  27.8 
 
 		 272 aa  68.9  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1421  beta-lactamase domain-containing protein  26.57 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.831543  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2127  metallo-beta-lactamase family protein  29.35 
 
 		 246 aa  68.6  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1697  hypothetical protein  25.82 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1653  metal-dependent hydrolase  28.9 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.348192  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1348  metal-dependent hydrolase  27.41 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.324127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0151  metallo-beta-lactamase family protein  28.93 
 
 		 240 aa  67  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1774  beta-lactamase domain protein  29.9 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.613108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1587  metal-dependent hydrolase  31.66 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.725937  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0101  hypothetical protein  25.99 
 
 		 271 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.293675 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1493  metal-dependent hydrolase  28.27 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.264611  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1740  metal-dependent hydrolase  27.55 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0849685  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0623  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.8 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0081  beta-lactamase domain-containing protein  30.3 
 
 		 239 aa  66.2  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.316272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0080  hypothetical protein  26.01 
 
 		 271 aa  65.5  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.141952 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0666  beta-lactamase domain protein  28.72 
 
 		 229 aa  64.7  0.0000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389415  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2077  hypothetical protein  26.34 
 
 		 279 aa  64.7  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2131  hypothetical protein  27.47 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.605971  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2279  beta-lactamase domain protein  29.17 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2368  beta-lactamase domain protein  26.02 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.355207  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1443  beta-lactamase domain protein  27.46 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.995838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0154  hypothetical protein  26.88 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.61111  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4343  metal-dependent hydrolase  25.25 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3437  beta-lactamase-like  28.71 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2570  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like  26.04 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.950272  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4722  metal-dependent hydrolase  25.25 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4201  beta-lactamase domain-containing protein  25.79 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4354  metal-dependent hydrolase  25.25 
 
 		 227 aa  62  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4747  metal-dependent hydrolase  25.25 
 
 		 227 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0515  metal-dependent hydrolase  25.25 
 
 		 227 aa  61.6  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4507  metal-dependent hydrolase  25.25 
 
 		 227 aa  61.6  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4860  metal-dependent hydrolase  25.25 
 
 		 227 aa  61.6  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4729  metal-dependent hydrolase  25.25 
 
 		 227 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4741  metal-dependent hydrolase  25.25 
 
 		 227 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2125  metal-dependent hydrolase  28.86 
 
 		 226 aa  61.2  0.000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.192097  normal  0.207518 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4324  beta-lactamase-like  27.75 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>