134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1184 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1184  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  428  1e-119  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482246  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1211  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  94.76 
 
 		 210 aa  410  1e-114  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000127632  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1402  hypothetical protein  93.81 
 
 		 210 aa  409  1e-113  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.492641  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2962  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  45.81 
 
 		 220 aa  208  5e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00091403  hitchhiker  0.0000171806 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3116  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  44.83 
 
 		 220 aa  206  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431062  hitchhiker  0.00109121 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0072  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  43.81 
 
 		 215 aa  193  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1744  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  43.18 
 
 		 223 aa  192  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0309934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0613  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  41.26 
 
 		 214 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.093402  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0741  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  43.58 
 
 		 208 aa  171  6.999999999999999e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2419  hypothetical protein  39.42 
 
 		 209 aa  170  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000960503  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0717  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  43.02 
 
 		 208 aa  168  5e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1093  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold protein  41.76 
 
 		 211 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1161  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  42.7 
 
 		 228 aa  165  4e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.412204  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1933  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  39.9 
 
 		 211 aa  164  6.9999999999999995e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4183  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  38.36 
 
 		 226 aa  163  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0225  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  38.76 
 
 		 213 aa  161  7e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1487  Zn-dependent hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  38.1 
 
 		 212 aa  159  2e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0029  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  37.62 
 
 		 211 aa  157  1e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0731  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold  33.48 
 
 		 223 aa  136  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000173292  normal  0.767242 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17310  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold protein  33.71 
 
 		 212 aa  136  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0050  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  33.33 
 
 		 210 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000302941  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2755  putative zinc-dependent hydrolase  32.08 
 
 		 217 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.332124  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2441  zinc-dependent hydrolase, putative  32.08 
 
 		 217 aa  131  9e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1599  Zn-dependent hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  29.52 
 
 		 243 aa  119  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4491  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  30.62 
 
 		 254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2710  hypothetical protein  30.92 
 
 		 290 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2730  hypothetical protein  30.37 
 
 		 262 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3372  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  30.37 
 
 		 262 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.323472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0399  hypothetical protein  30.81 
 
 		 250 aa  101  9e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2052  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  30.53 
 
 		 226 aa  100  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0437547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2779  twin-arginine translocation pathway signal  29.03 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4992  hypothetical protein  28.04 
 
 		 255 aa  97.4  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.240402  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3370  hypothetical protein  28.91 
 
 		 263 aa  97.8  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.19595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0622  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  34.46 
 
 		 202 aa  87  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0101  hypothetical protein  29.33 
 
 		 271 aa  85.9  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.293675 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0080  hypothetical protein  28.89 
 
 		 271 aa  85.1  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.141952 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3012  putative Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold family  28 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.47572  normal  0.288675 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02141  Zn-dependent hydrolase  32.37 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7160  hypothetical protein  27.68 
 
 		 272 aa  80.1  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27441  Zn-dependent hydrolase  30.41 
 
 		 245 aa  76.3  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3633  hypothetical protein  29.48 
 
 		 290 aa  76.3  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.719397  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02031  Zn-dependent hydrolase  32.24 
 
 		 241 aa  74.7  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.041064  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0187  hypothetical protein  32.53 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0306634  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3193  hypothetical protein  27.23 
 
 		 268 aa  74.7  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0483  hypothetical protein  28.05 
 
 		 268 aa  73.6  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.711637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02051  Zn-dependent hydrolase  32.73 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0314417  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2077  hypothetical protein  26.67 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1834  hypothetical protein  27.6 
 
 		 268 aa  73.2  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150106  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0213  conserved hypothetical protein  26.42 
 
 		 211 aa  72  0.000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.132572  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3212  hypothetical protein  25 
 
 		 281 aa  72.4  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3507  hypothetical protein  27.17 
 
 		 281 aa  72  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.427616 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1421  beta-lactamase domain-containing protein  31.05 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.831543  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0623  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.48 
 
 		 271 aa  68.9  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02031  Zn-dependent hydrolase  27.75 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.141712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0545  hypothetical protein  26.53 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0125992 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2642  hypothetical protein  24.88 
 
 		 277 aa  66.6  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.771371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2129  hypothetical protein  27.88 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1645  hypothetical protein  27 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.787985 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1344  metal-dependent hydrolase  25.64 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.181884 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2448  hypothetical protein  25 
 
 		 240 aa  64.3  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0496  hypothetical protein  26.7 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3437  beta-lactamase-like  26.63 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1740  metal-dependent hydrolase  27.04 
 
 		 228 aa  61.6  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0849685  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1705  beta-lactamase-like  27.81 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1819  hypothetical protein  25.89 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1628  hypothetical protein  26.4 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1073  metal-dependent hydrolase  25.13 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.316137  normal  0.112797 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1774  beta-lactamase domain protein  25.77 
 
 		 239 aa  58.2  0.00000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.613108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0803  metal-dependent hydrolase  25.51 
 
 		 237 aa  57  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000737495 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1074  metal-dependent hydrolase  24.62 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0136  metal-dependent hydrolase  27.84 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.609022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0300  metal-dependent hydrolase  28.36 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2131  hypothetical protein  26.04 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.605971  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2337  beta-lactamase domain protein  22.86 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1697  hypothetical protein  25.81 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0816  beta-lactamase domain-containing protein  24.6 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4722  metal-dependent hydrolase  21.21 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0515  metal-dependent hydrolase  21.21 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5227  beta-lactamase domain protein  25.91 
 
 		 224 aa  52.8  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0081  beta-lactamase domain-containing protein  28.93 
 
 		 239 aa  52.8  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.316272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1310  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  26.9 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0262357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1348  metal-dependent hydrolase  22.56 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.324127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1509  hypothetical protein  23.68 
 
 		 218 aa  52.8  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00164227  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0306  beta-lactamase domain protein  25.77 
 
 		 227 aa  52.4  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4741  metal-dependent hydrolase  21.21 
 
 		 227 aa  52  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4354  metal-dependent hydrolase  20.71 
 
 		 227 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4442  metal-dependent hydrolase  20.71 
 
 		 228 aa  51.6  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.187711  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2098  beta-lactamase domain-containing protein  25.35 
 
 		 219 aa  51.2  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.244954  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4507  metal-dependent hydrolase  20.71 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4343  metal-dependent hydrolase  20.71 
 
 		 227 aa  51.6  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1271  hypothetical protein  26.56 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.384497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0151  metallo-beta-lactamase family protein  25.52 
 
 		 240 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4860  metal-dependent hydrolase  20.71 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4201  beta-lactamase domain-containing protein  24.12 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4729  metal-dependent hydrolase  20.71 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2279  beta-lactamase domain protein  26.32 
 
 		 230 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4747  metal-dependent hydrolase  20.71 
 
 		 227 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4324  beta-lactamase-like  27.44 
 
 		 273 aa  50.1  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1154  hypothetical protein  26.19 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1127  beta-lactamase domain protein  24.39 
 
 		 274 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.852965  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>