71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3012 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3012  putative Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold family  100 
 
 		 229 aa  473  1e-133  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.47572  normal  0.288675 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2052  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  71.37 
 
 		 226 aa  327  1.0000000000000001e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0437547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17310  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold protein  31.42 
 
 		 212 aa  112  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0225  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  36.57 
 
 		 213 aa  107  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1933  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  30.6 
 
 		 211 aa  103  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1093  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold protein  30.67 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0717  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  35.03 
 
 		 208 aa  100  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1599  Zn-dependent hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  26.43 
 
 		 243 aa  99.4  4e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2419  hypothetical protein  30.87 
 
 		 209 aa  99  6e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000960503  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0613  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  28.32 
 
 		 214 aa  98.2  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.093402  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0731  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold  28.45 
 
 		 223 aa  97.8  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000173292  normal  0.767242 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0741  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  34.52 
 
 		 208 aa  97.1  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1487  Zn-dependent hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  27.71 
 
 		 212 aa  97.1  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0029  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  28.76 
 
 		 211 aa  93.6  2e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1161  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  30.29 
 
 		 228 aa  92  6e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.412204  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0050  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.68 
 
 		 210 aa  89.7  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000302941  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1211  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.11 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000127632  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1402  hypothetical protein  27.71 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.492641  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1184  hypothetical protein  28 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482246  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2755  putative zinc-dependent hydrolase  24 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.332124  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2441  zinc-dependent hydrolase, putative  26.29 
 
 		 217 aa  75.1  0.0000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0072  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  30.68 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2779  twin-arginine translocation pathway signal  27.95 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4491  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.8 
 
 		 254 aa  69.3  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4992  hypothetical protein  25.11 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.240402  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3370  hypothetical protein  28.09 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.19595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3116  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  28.12 
 
 		 220 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431062  hitchhiker  0.00109121 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0399  hypothetical protein  25.44 
 
 		 250 aa  61.6  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2962  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  26.34 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00091403  hitchhiker  0.0000171806 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0213  conserved hypothetical protein  26.29 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.132572  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3633  hypothetical protein  26.06 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.719397  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2710  hypothetical protein  25 
 
 		 290 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1744  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  25.97 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0309934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2642  hypothetical protein  24.34 
 
 		 277 aa  55.5  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.771371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4183  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  25.43 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3507  hypothetical protein  25.53 
 
 		 281 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.427616 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3372  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  25.28 
 
 		 262 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.323472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2730  hypothetical protein  25.28 
 
 		 262 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0315  metal-dependent hydrolase  26.63 
 
 		 223 aa  52.4  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00468893  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1524  beta-lactamase domain-containing protein  25.46 
 
 		 285 aa  52  0.000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02141  Zn-dependent hydrolase  23.6 
 
 		 242 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0483  hypothetical protein  29.17 
 
 		 268 aa  50.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.711637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1834  hypothetical protein  28.33 
 
 		 268 aa  50.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150106  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1421  beta-lactamase domain-containing protein  26.32 
 
 		 224 aa  49.3  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.831543  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3212  hypothetical protein  25.54 
 
 		 281 aa  48.9  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0300  metal-dependent hydrolase  27.78 
 
 		 225 aa  48.9  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0583  beta-lactamase domain protein  28.08 
 
 		 225 aa  48.5  0.00008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0306  beta-lactamase domain protein  26.5 
 
 		 227 aa  47.8  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0496  hypothetical protein  26.72 
 
 		 289 aa  48.1  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0635  metal-dependent hydrolase  22.45 
 
 		 226 aa  47.4  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000707665  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1705  beta-lactamase-like  27.75 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02051  Zn-dependent hydrolase  23.33 
 
 		 241 aa  47  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0314417  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2279  beta-lactamase domain protein  26.91 
 
 		 230 aa  47  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02031  Zn-dependent hydrolase  20.7 
 
 		 241 aa  45.8  0.0005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.041064  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0136  metal-dependent hydrolase  27.14 
 
 		 237 aa  44.7  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.609022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2077  hypothetical protein  28.12 
 
 		 279 aa  44.7  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0187  hypothetical protein  20.89 
 
 		 241 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0306634  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0623  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  26.67 
 
 		 271 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27441  Zn-dependent hydrolase  24.14 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1068  Beta-lactamase-like  26.27 
 
 		 274 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02031  Zn-dependent hydrolase  24.64 
 
 		 246 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.141712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0803  metal-dependent hydrolase  25.76 
 
 		 237 aa  43.9  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000737495 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0151  metallo-beta-lactamase family protein  24.03 
 
 		 240 aa  43.1  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1127  beta-lactamase domain protein  25.81 
 
 		 274 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.852965  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1196  beta-lactamase domain protein  25.81 
 
 		 274 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0154  hypothetical protein  28.5 
 
 		 214 aa  43.5  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.61111  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1774  beta-lactamase domain protein  22.69 
 
 		 239 aa  43.1  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.613108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2131  hypothetical protein  26.94 
 
 		 208 aa  42.7  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.605971  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1819  hypothetical protein  23.61 
 
 		 223 aa  42.4  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0622  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  22.67 
 
 		 202 aa  42.4  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4324  beta-lactamase-like  24.07 
 
 		 273 aa  42.4  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>