43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2642 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2642  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  566  1e-160  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.771371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3212  hypothetical protein  64.84 
 
 		 281 aa  333  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3507  hypothetical protein  59.22 
 
 		 281 aa  329  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.427616 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3633  hypothetical protein  57.09 
 
 		 290 aa  310  2e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.719397  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3193  hypothetical protein  58.75 
 
 		 268 aa  282  5.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7160  hypothetical protein  49.12 
 
 		 272 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0080  hypothetical protein  54.18 
 
 		 271 aa  262  6e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.141952 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0101  hypothetical protein  50.88 
 
 		 271 aa  254  9e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.293675 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0483  hypothetical protein  50.99 
 
 		 268 aa  223  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.711637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1834  hypothetical protein  50.99 
 
 		 268 aa  223  3e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150106  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0623  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  50.19 
 
 		 271 aa  217  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2077  hypothetical protein  47.47 
 
 		 279 aa  212  3.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0496  hypothetical protein  47.95 
 
 		 289 aa  186  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0731  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold  34.25 
 
 		 223 aa  99.4  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000173292  normal  0.767242 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0050  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  28.83 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000302941  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1161  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  31.41 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.412204  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0072  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  29.05 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1093  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold protein  28.57 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1402  hypothetical protein  26.27 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.492641  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1211  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.03 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000127632  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0717  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.68 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1933  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  28.07 
 
 		 211 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17310  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold protein  28.18 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0741  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  29.69 
 
 		 208 aa  67.8  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0613  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  25.68 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.093402  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1184  hypothetical protein  25.34 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482246  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1487  Zn-dependent hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  26.9 
 
 		 212 aa  64.7  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3116  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  30.41 
 
 		 220 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431062  hitchhiker  0.00109121 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2962  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  29.59 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00091403  hitchhiker  0.0000171806 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1744  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.7 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0309934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2755  putative zinc-dependent hydrolase  25.11 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.332124  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2441  zinc-dependent hydrolase, putative  25.85 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0225  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  28.25 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2052  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  25.21 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0437547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2419  hypothetical protein  22.69 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000960503  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1599  Zn-dependent hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  21.68 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3012  putative Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold family  24.34 
 
 		 229 aa  55.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.47572  normal  0.288675 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0029  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  23.87 
 
 		 211 aa  53.5  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4183  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  25.73 
 
 		 226 aa  47.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1421  beta-lactamase domain-containing protein  23.61 
 
 		 224 aa  47.4  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.831543  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1127  beta-lactamase domain protein  24.17 
 
 		 274 aa  45.8  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.852965  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1196  beta-lactamase domain protein  23.7 
 
 		 274 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1068  Beta-lactamase-like  23.75 
 
 		 274 aa  42.7  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>