41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3212 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3212  hypothetical protein  100 
 
 
281 aa  580  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3507  hypothetical protein  90.39 
 
 
281 aa  530  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.427616 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3633  hypothetical protein  60.99 
 
 
290 aa  323  1e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.719397  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2642  hypothetical protein  61.7 
 
 
277 aa  315  6e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.771371  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3193  hypothetical protein  51.29 
 
 
268 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0080  hypothetical protein  49.08 
 
 
271 aa  262  4e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.141952 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0101  hypothetical protein  48.2 
 
 
271 aa  259  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.293675 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7160  hypothetical protein  47.86 
 
 
272 aa  257  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1834  hypothetical protein  46.85 
 
 
268 aa  223  2e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150106  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0483  hypothetical protein  46.85 
 
 
268 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.711637  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0623  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  45.72 
 
 
271 aa  223  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2077  hypothetical protein  44.02 
 
 
279 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0496  hypothetical protein  42.15 
 
 
289 aa  185  9e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0731  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold  30.63 
 
 
223 aa  97.4  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000173292  normal  0.767242 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1211  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  25.79 
 
 
210 aa  80.9  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000127632  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1093  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold protein  31.64 
 
 
211 aa  80.5  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1402  hypothetical protein  26.24 
 
 
210 aa  78.2  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.492641  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0717  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  31.46 
 
 
208 aa  75.5  0.0000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0741  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  28.05 
 
 
208 aa  75.1  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0072  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  26.2 
 
 
215 aa  74.3  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0050  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.43 
 
 
210 aa  74.7  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000302941  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3116  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  28.57 
 
 
220 aa  73.2  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431062  hitchhiker  0.00109121 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1161  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  30.11 
 
 
228 aa  72.4  0.000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.412204  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1487  Zn-dependent hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  26.22 
 
 
212 aa  72.4  0.000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1184  hypothetical protein  25 
 
 
210 aa  72  0.000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482246  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0613  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  28.41 
 
 
214 aa  70.9  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.093402  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2962  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  28.44 
 
 
220 aa  69.3  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00091403  hitchhiker  0.0000171806 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1599  Zn-dependent hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  21.76 
 
 
243 aa  68.6  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1744  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.4 
 
 
223 aa  68.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0309934  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1933  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  28.93 
 
 
211 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0029  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  26.67 
 
 
211 aa  64.3  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0225  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  27.27 
 
 
213 aa  62.8  0.000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17310  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold protein  27.88 
 
 
212 aa  61.2  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2419  hypothetical protein  23.32 
 
 
209 aa  57.4  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000960503  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4183  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  24.32 
 
 
226 aa  51.6  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2755  putative zinc-dependent hydrolase  23.87 
 
 
217 aa  50.1  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.332124  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2441  zinc-dependent hydrolase, putative  23.53 
 
 
217 aa  49.3  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2052  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  31.58 
 
 
226 aa  48.9  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0437547  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3012  putative Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold family  25.54 
 
 
229 aa  48.1  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.47572  normal  0.288675 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0291  beta-lactamase domain protein  28.5 
 
 
227 aa  47.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3370  hypothetical protein  22.46 
 
 
263 aa  44.3  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.19595  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>