136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2441 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_2441  zinc-dependent hydrolase, putative  100 
 
 
217 aa  435  1e-121  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2755  putative zinc-dependent hydrolase  97.24 
 
 
217 aa  426  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.332124  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1933  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  43.58 
 
 
211 aa  160  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1093  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold protein  40.48 
 
 
211 aa  159  4e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0613  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  40.62 
 
 
214 aa  156  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.093402  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1161  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  34.27 
 
 
228 aa  156  3e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.412204  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2419  hypothetical protein  36.45 
 
 
209 aa  150  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000960503  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0225  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  37.56 
 
 
213 aa  149  2e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17310  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold protein  40.45 
 
 
212 aa  148  5e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0717  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  40.78 
 
 
208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1487  Zn-dependent hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  38.1 
 
 
212 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0741  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  41.34 
 
 
208 aa  144  8.000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0050  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  38.58 
 
 
210 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000302941  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1211  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  33.49 
 
 
210 aa  135  4e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000127632  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0731  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold  33.18 
 
 
223 aa  135  6.0000000000000005e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000173292  normal  0.767242 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1184  hypothetical protein  32.08 
 
 
210 aa  131  9e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482246  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0072  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  34.88 
 
 
215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1402  hypothetical protein  32.08 
 
 
210 aa  129  3e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.492641  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3116  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  34.47 
 
 
220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431062  hitchhiker  0.00109121 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2962  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  32.87 
 
 
220 aa  126  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00091403  hitchhiker  0.0000171806 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0029  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  34.74 
 
 
211 aa  123  2e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1744  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  34.4 
 
 
223 aa  123  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0309934  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1599  Zn-dependent hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  30.04 
 
 
243 aa  100  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4992  hypothetical protein  31.51 
 
 
255 aa  92.4  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.240402  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4183  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  32.73 
 
 
226 aa  92.4  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4491  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  28.1 
 
 
254 aa  79.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2779  twin-arginine translocation pathway signal  27.85 
 
 
255 aa  77.8  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3012  putative Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold family  26.29 
 
 
229 aa  75.1  0.0000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.47572  normal  0.288675 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3372  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.98 
 
 
262 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.323472  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2730  hypothetical protein  27.98 
 
 
262 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0622  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  29.14 
 
 
202 aa  73.6  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2710  hypothetical protein  26.15 
 
 
290 aa  73.2  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0213  conserved hypothetical protein  33.68 
 
 
211 aa  70.9  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.132572  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1063  beta-lactamase domain protein  28.42 
 
 
218 aa  69.7  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.575371  normal  0.476054 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2052  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  23.45 
 
 
226 aa  68.6  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0437547  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1421  beta-lactamase domain-containing protein  25.32 
 
 
224 aa  67.8  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.831543  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3370  hypothetical protein  27.18 
 
 
263 aa  67  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.19595  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1705  beta-lactamase-like  26.05 
 
 
219 aa  64.7  0.0000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4442  metal-dependent hydrolase  27.92 
 
 
228 aa  62.8  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.187711  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4343  metal-dependent hydrolase  26.9 
 
 
227 aa  62.4  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4747  metal-dependent hydrolase  26.9 
 
 
227 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4507  metal-dependent hydrolase  26.9 
 
 
227 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4354  metal-dependent hydrolase  26.9 
 
 
227 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4860  metal-dependent hydrolase  26.9 
 
 
227 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0816  beta-lactamase domain-containing protein  24.88 
 
 
222 aa  60.8  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4729  metal-dependent hydrolase  26.9 
 
 
227 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1834  hypothetical protein  28.8 
 
 
268 aa  60.5  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150106  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2642  hypothetical protein  25.85 
 
 
277 aa  60.1  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.771371  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0545  hypothetical protein  26.67 
 
 
223 aa  60.1  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0125992 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0483  hypothetical protein  28 
 
 
268 aa  60.1  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.711637  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0306  beta-lactamase domain protein  26.67 
 
 
227 aa  60.1  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1073  metal-dependent hydrolase  26.56 
 
 
227 aa  60.1  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.316137  normal  0.112797 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4722  metal-dependent hydrolase  26.4 
 
 
227 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0515  metal-dependent hydrolase  26.4 
 
 
227 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3716  metal-dependent hydrolase  26.26 
 
 
230 aa  58.5  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0080  hypothetical protein  25.66 
 
 
271 aa  58.5  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.141952 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0666  beta-lactamase domain protein  26.37 
 
 
229 aa  58.2  0.00000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389415  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4741  metal-dependent hydrolase  25.38 
 
 
227 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0767  metal-dependent hydrolase  29.15 
 
 
226 aa  58.2  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2696  metal-dependent hydrolase  27.41 
 
 
226 aa  58.2  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2071  hypothetical protein  28.04 
 
 
324 aa  57.8  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338371  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0101  hypothetical protein  24.78 
 
 
271 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.293675 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1154  hypothetical protein  25.47 
 
 
219 aa  57  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0623  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  28 
 
 
271 aa  57.4  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3294  metal-dependent hydrolase  27.27 
 
 
227 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.692615  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2358  hypothetical protein  25.35 
 
 
324 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000948775  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1740  metal-dependent hydrolase  24.62 
 
 
228 aa  55.8  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0849685  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2277  hypothetical protein  26.73 
 
 
324 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00343587  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0399  hypothetical protein  22.48 
 
 
250 aa  54.7  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3193  hypothetical protein  21.52 
 
 
268 aa  54.7  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1649  beta-lactamase domain-containing protein  25.7 
 
 
324 aa  54.3  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000196619  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2230  hypothetical protein  26.61 
 
 
324 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00325578  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5695  metal-dependent hydrolase  22.22 
 
 
291 aa  53.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1261  beta-lactamase-like protein  22.73 
 
 
242 aa  54.3  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.191714  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3095  hypothetical protein  26.15 
 
 
324 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000159672  hitchhiker  7.43882e-22 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3633  hypothetical protein  22.81 
 
 
290 aa  53.9  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.719397  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1697  hypothetical protein  26.6 
 
 
211 aa  53.1  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2368  beta-lactamase domain protein  25 
 
 
227 aa  53.1  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.355207  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1524  beta-lactamase domain-containing protein  22.75 
 
 
285 aa  52.8  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0136  metal-dependent hydrolase  24 
 
 
237 aa  52.4  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.609022  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3945  beta-lactamase domain-containing protein  21.78 
 
 
244 aa  52.4  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.24739  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1344  metal-dependent hydrolase  24.12 
 
 
228 aa  51.6  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.181884 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7160  hypothetical protein  23.38 
 
 
272 aa  51.6  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0760  beta-lactamase domain protein  26.02 
 
 
237 aa  52  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2030  hypothetical protein  25.23 
 
 
423 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.746583  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1271  hypothetical protein  25.63 
 
 
220 aa  51.2  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.384497  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1819  hypothetical protein  22.84 
 
 
223 aa  51.2  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2273  hypothetical protein  25.81 
 
 
324 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79645e-45 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3617  beta-lactamase domain-containing protein  21.33 
 
 
244 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2092  hypothetical protein  25.81 
 
 
324 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0491509  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2032  hypothetical protein  25.81 
 
 
324 aa  50.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000509701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2247  hypothetical protein  25.81 
 
 
324 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0231046  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1509  hypothetical protein  22.75 
 
 
218 aa  50.4  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00164227  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3212  hypothetical protein  23.53 
 
 
281 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1270  metal-dependent hydrolase  26.21 
 
 
229 aa  49.3  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1763  metal-dependent hydrolase  23.08 
 
 
229 aa  49.7  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1797  metal-dependent hydrolase  23.08 
 
 
229 aa  49.7  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3437  beta-lactamase-like  22.48 
 
 
233 aa  49.3  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1628  hypothetical protein  23.98 
 
 
221 aa  49.3  0.00005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02051  Zn-dependent hydrolase  27.31 
 
 
241 aa  48.5  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0314417  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>