41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3633 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3633  hypothetical protein  100 
 
 		 290 aa  592  1e-168  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.719397  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3507  hypothetical protein  58.98 
 
 		 281 aa  325  4.0000000000000003e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.427616 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3212  hypothetical protein  63.85 
 
 		 281 aa  321  8e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2642  hypothetical protein  57.09 
 
 		 277 aa  296  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.771371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3193  hypothetical protein  52.31 
 
 		 268 aa  264  1e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0080  hypothetical protein  46.6 
 
 		 271 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.141952 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7160  hypothetical protein  45.61 
 
 		 272 aa  232  7.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0101  hypothetical protein  50 
 
 		 271 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.293675 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1834  hypothetical protein  52.04 
 
 		 268 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150106  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2077  hypothetical protein  46.12 
 
 		 279 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0483  hypothetical protein  51.58 
 
 		 268 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.711637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0623  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  51.82 
 
 		 271 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0496  hypothetical protein  47.81 
 
 		 289 aa  181  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0731  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold  33.03 
 
 		 223 aa  93.2  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000173292  normal  0.767242 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1211  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  30.64 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000127632  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1402  hypothetical protein  30.06 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.492641  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0613  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.27 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.093402  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1184  hypothetical protein  29.48 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482246  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0050  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  26.75 
 
 		 210 aa  75.1  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000302941  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1161  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  32.28 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.412204  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0717  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  32.64 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0741  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  32.12 
 
 		 208 aa  72  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1093  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold protein  26.48 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2419  hypothetical protein  26.15 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000960503  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0072  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  28.98 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1487  Zn-dependent hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  24.55 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1599  Zn-dependent hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  22.94 
 
 		 243 aa  68.6  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0225  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  29.05 
 
 		 213 aa  64.7  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3116  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  28.9 
 
 		 220 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431062  hitchhiker  0.00109121 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17310  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold protein  26.34 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2962  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  28.9 
 
 		 220 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00091403  hitchhiker  0.0000171806 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1744  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.62 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0309934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2052  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  28.42 
 
 		 226 aa  58.5  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0437547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1933  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  26.82 
 
 		 211 aa  58.9  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3012  putative Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold family  26.06 
 
 		 229 aa  58.2  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.47572  normal  0.288675 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0029  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.68 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2755  putative zinc-dependent hydrolase  24.57 
 
 		 217 aa  55.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.332124  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2441  zinc-dependent hydrolase, putative  22.81 
 
 		 217 aa  53.9  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4183  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  26.01 
 
 		 226 aa  48.9  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3370  hypothetical protein  24.24 
 
 		 263 aa  43.5  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.19595  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4992  hypothetical protein  27.64 
 
 		 255 aa  43.1  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.240402  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>