141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_1211 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_1211  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  100 
 
 
210 aa  426  1e-118  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000127632  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1402  hypothetical protein  94.76 
 
 
210 aa  411  1e-114  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.492641  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1184  hypothetical protein  94.76 
 
 
210 aa  410  1e-114  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482246  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2962  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  45.32 
 
 
220 aa  209  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00091403  hitchhiker  0.0000171806 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3116  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  44.33 
 
 
220 aa  208  4e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431062  hitchhiker  0.00109121 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1744  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  43.18 
 
 
223 aa  198  3.9999999999999996e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0309934  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0072  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  41.9 
 
 
215 aa  192  5e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0613  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  41.75 
 
 
214 aa  187  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.093402  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2419  hypothetical protein  40.87 
 
 
209 aa  173  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000960503  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0741  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  43.58 
 
 
208 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0717  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  43.02 
 
 
208 aa  170  1e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1161  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  43.82 
 
 
228 aa  168  7e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.412204  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1093  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold protein  42.31 
 
 
211 aa  167  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1933  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  40.98 
 
 
211 aa  167  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4183  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  36.99 
 
 
226 aa  164  6.9999999999999995e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1487  Zn-dependent hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  39.34 
 
 
212 aa  164  6.9999999999999995e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0225  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  38.28 
 
 
213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0029  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  38.57 
 
 
211 aa  159  3e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0731  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold  34.26 
 
 
223 aa  141  7e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000173292  normal  0.767242 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17310  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold protein  35.39 
 
 
212 aa  140  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0050  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  33.81 
 
 
210 aa  138  7e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000302941  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2755  putative zinc-dependent hydrolase  33.49 
 
 
217 aa  137  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.332124  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2441  zinc-dependent hydrolase, putative  33.49 
 
 
217 aa  135  4e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1599  Zn-dependent hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  31.7 
 
 
243 aa  125  5e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4491  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  29.19 
 
 
254 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2052  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  30.09 
 
 
226 aa  101  7e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0437547  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0399  hypothetical protein  31.28 
 
 
250 aa  99  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3372  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  29.91 
 
 
262 aa  96.7  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.323472  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2730  hypothetical protein  29.91 
 
 
262 aa  96.7  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2779  twin-arginine translocation pathway signal  28.57 
 
 
255 aa  94.7  8e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2710  hypothetical protein  28.5 
 
 
290 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0080  hypothetical protein  30.67 
 
 
271 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.141952 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0101  hypothetical protein  30.67 
 
 
271 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.293675 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3370  hypothetical protein  27.96 
 
 
263 aa  93.6  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.19595  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4992  hypothetical protein  27.57 
 
 
255 aa  92  6e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.240402  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0622  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  35.14 
 
 
202 aa  89  4e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7160  hypothetical protein  29.46 
 
 
272 aa  84  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3012  putative Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold family  27.11 
 
 
229 aa  84  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.47572  normal  0.288675 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3212  hypothetical protein  25.79 
 
 
281 aa  81.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0213  conserved hypothetical protein  28.77 
 
 
211 aa  77.8  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.132572  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3193  hypothetical protein  28.57 
 
 
268 aa  77.8  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0483  hypothetical protein  28.51 
 
 
268 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.711637  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3633  hypothetical protein  30.64 
 
 
290 aa  77.4  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.719397  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1834  hypothetical protein  28.05 
 
 
268 aa  77  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150106  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2077  hypothetical protein  26.79 
 
 
279 aa  76.6  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02141  Zn-dependent hydrolase  32.35 
 
 
242 aa  76.3  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02051  Zn-dependent hydrolase  33.53 
 
 
241 aa  75.1  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0314417  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02031  Zn-dependent hydrolase  34.5 
 
 
241 aa  74.7  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.041064  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3507  hypothetical protein  27.17 
 
 
281 aa  74.7  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.427616 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0187  hypothetical protein  31.93 
 
 
241 aa  72.4  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0306634  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27441  Zn-dependent hydrolase  29.24 
 
 
245 aa  72  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1421  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 
224 aa  71.2  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.831543  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0623  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  26.36 
 
 
271 aa  69.7  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2642  hypothetical protein  26.61 
 
 
277 aa  69.7  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.771371  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1344  metal-dependent hydrolase  27.18 
 
 
228 aa  68.9  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.181884 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2129  hypothetical protein  29.19 
 
 
240 aa  65.9  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02031  Zn-dependent hydrolase  27.78 
 
 
246 aa  65.5  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.141712  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1740  metal-dependent hydrolase  27.55 
 
 
228 aa  64.7  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0849685  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1705  beta-lactamase-like  27.81 
 
 
219 aa  63.5  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1645  hypothetical protein  26.5 
 
 
223 aa  63.5  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.787985 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0545  hypothetical protein  25.51 
 
 
223 aa  63.2  0.000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0125992 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0496  hypothetical protein  26.7 
 
 
289 aa  63.2  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3437  beta-lactamase-like  27.14 
 
 
233 aa  62.8  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2448  hypothetical protein  23.61 
 
 
240 aa  61.2  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0803  metal-dependent hydrolase  27.04 
 
 
237 aa  59.7  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000737495 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1073  metal-dependent hydrolase  26.7 
 
 
227 aa  59.7  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.316137  normal  0.112797 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1074  metal-dependent hydrolase  25.64 
 
 
225 aa  59.3  0.00000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1310  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  26.9 
 
 
195 aa  59.3  0.00000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0262357  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1774  beta-lactamase domain protein  26.8 
 
 
239 aa  58.9  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.613108  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1628  hypothetical protein  26.4 
 
 
221 aa  58.2  0.00000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0136  metal-dependent hydrolase  27.84 
 
 
237 aa  57.8  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.609022  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1819  hypothetical protein  25.89 
 
 
223 aa  57  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4722  metal-dependent hydrolase  22.73 
 
 
227 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2337  beta-lactamase domain protein  24.29 
 
 
222 aa  56.6  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0515  metal-dependent hydrolase  22.73 
 
 
227 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1348  metal-dependent hydrolase  23.59 
 
 
225 aa  55.8  0.0000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.324127  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4741  metal-dependent hydrolase  22.73 
 
 
227 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4354  metal-dependent hydrolase  22.22 
 
 
227 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4343  metal-dependent hydrolase  22.22 
 
 
227 aa  54.7  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0300  metal-dependent hydrolase  26.18 
 
 
225 aa  54.7  0.0000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1509  hypothetical protein  25.26 
 
 
218 aa  54.7  0.0000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00164227  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4442  metal-dependent hydrolase  22.22 
 
 
228 aa  54.7  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.187711  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4507  metal-dependent hydrolase  22.22 
 
 
227 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4860  metal-dependent hydrolase  22.22 
 
 
227 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4729  metal-dependent hydrolase  22.22 
 
 
227 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0816  beta-lactamase domain-containing protein  25.13 
 
 
222 aa  54.7  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4747  metal-dependent hydrolase  22.22 
 
 
227 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0151  metallo-beta-lactamase family protein  26.04 
 
 
240 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4324  beta-lactamase-like  25.82 
 
 
273 aa  53.5  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2131  hypothetical protein  25 
 
 
208 aa  53.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.605971  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1697  hypothetical protein  25.27 
 
 
211 aa  52.8  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4201  beta-lactamase domain-containing protein  23.98 
 
 
227 aa  53.1  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0306  beta-lactamase domain protein  26.29 
 
 
227 aa  52.8  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0810  metal-dependent hydrolase  24.62 
 
 
225 aa  52.8  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5227  beta-lactamase domain protein  25.26 
 
 
224 aa  52.4  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1524  beta-lactamase domain-containing protein  37.18 
 
 
285 aa  52.4  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2279  beta-lactamase domain protein  26.32 
 
 
230 aa  52.4  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2098  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 
219 aa  52  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.244954  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0291  beta-lactamase domain protein  24.74 
 
 
227 aa  52  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2759  beta-lactamase domain protein  25 
 
 
239 aa  50.8  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0721774  normal  0.565273 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>