43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_27441 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_27441  Zn-dependent hydrolase  100 
 
 
245 aa  483  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2448  hypothetical protein  70 
 
 
240 aa  325  4.0000000000000003e-88  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2129  hypothetical protein  72.64 
 
 
240 aa  318  3e-86  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02031  Zn-dependent hydrolase  59.02 
 
 
246 aa  286  2e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.141712  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02141  Zn-dependent hydrolase  43.64 
 
 
242 aa  200  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4992  hypothetical protein  43.42 
 
 
255 aa  196  4.0000000000000005e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.240402  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0399  hypothetical protein  46.58 
 
 
250 aa  193  2e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0187  hypothetical protein  40 
 
 
241 aa  189  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0306634  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02051  Zn-dependent hydrolase  39.55 
 
 
241 aa  188  5.999999999999999e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0314417  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4491  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  42.04 
 
 
254 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02031  Zn-dependent hydrolase  39.74 
 
 
241 aa  186  3e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.041064  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2779  twin-arginine translocation pathway signal  42.57 
 
 
255 aa  180  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2730  hypothetical protein  46.03 
 
 
262 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3372  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  46.03 
 
 
262 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.323472  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2710  hypothetical protein  42.79 
 
 
290 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3370  hypothetical protein  41.06 
 
 
263 aa  172  5e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.19595  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0029  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  31.25 
 
 
211 aa  96.7  3e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0072  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.78 
 
 
215 aa  85.9  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1161  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  35.56 
 
 
228 aa  85.1  9e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.412204  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0741  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  29.52 
 
 
208 aa  82  0.000000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0717  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  28.31 
 
 
208 aa  80.5  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2962  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  33.53 
 
 
220 aa  79.3  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00091403  hitchhiker  0.0000171806 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2419  hypothetical protein  30.12 
 
 
209 aa  76.6  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000960503  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1093  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold protein  26.84 
 
 
211 aa  75.9  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1487  Zn-dependent hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  29.23 
 
 
212 aa  75.9  0.0000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1402  hypothetical protein  30.41 
 
 
210 aa  76.3  0.0000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.492641  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1184  hypothetical protein  30.41 
 
 
210 aa  76.3  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482246  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0225  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  29.02 
 
 
213 aa  74.7  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3116  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  30.09 
 
 
220 aa  73.2  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431062  hitchhiker  0.00109121 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1211  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  29.24 
 
 
210 aa  72  0.000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000127632  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1933  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  26.2 
 
 
211 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1744  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  28.12 
 
 
223 aa  68.6  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0309934  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0613  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  25.73 
 
 
214 aa  67  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.093402  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0050  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  26.53 
 
 
210 aa  64.7  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000302941  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0731  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold  30 
 
 
223 aa  61.2  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000173292  normal  0.767242 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1599  Zn-dependent hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  22.56 
 
 
243 aa  56.6  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17310  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold protein  25.47 
 
 
212 aa  56.6  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0622  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.75 
 
 
202 aa  55.5  0.0000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4183  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  24.7 
 
 
226 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3012  putative Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold family  24.14 
 
 
229 aa  44.3  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.47572  normal  0.288675 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0213  conserved hypothetical protein  25 
 
 
211 aa  43.9  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.132572  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2052  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  24.16 
 
 
226 aa  42.4  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0437547  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1819  hypothetical protein  28.16 
 
 
223 aa  41.6  0.01  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>