41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2448 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2448  hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  475  1e-133  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2129  hypothetical protein  76.25 
 
 
240 aa  367  1e-101  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27441  Zn-dependent hydrolase  70 
 
 
245 aa  325  4.0000000000000003e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02031  Zn-dependent hydrolase  56.03 
 
 
246 aa  262  3e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.141712  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0399  hypothetical protein  44.75 
 
 
250 aa  179  4e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02141  Zn-dependent hydrolase  38.74 
 
 
242 aa  173  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4992  hypothetical protein  42.2 
 
 
255 aa  169  2e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.240402  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02051  Zn-dependent hydrolase  38.28 
 
 
241 aa  168  6e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0314417  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0187  hypothetical protein  38.76 
 
 
241 aa  167  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0306634  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4491  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  41.79 
 
 
254 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02031  Zn-dependent hydrolase  36.89 
 
 
241 aa  166  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.041064  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2779  twin-arginine translocation pathway signal  38.99 
 
 
255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2730  hypothetical protein  40.4 
 
 
262 aa  158  8e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3372  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  40.4 
 
 
262 aa  158  8e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.323472  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2710  hypothetical protein  37.84 
 
 
290 aa  155  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3370  hypothetical protein  35.53 
 
 
263 aa  149  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.19595  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0072  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  31.25 
 
 
215 aa  87.4  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0741  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  29.52 
 
 
208 aa  86.7  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1161  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  32.96 
 
 
228 aa  86.7  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.412204  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0717  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  29.52 
 
 
208 aa  85.5  7e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2962  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  31.61 
 
 
220 aa  79  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00091403  hitchhiker  0.0000171806 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2419  hypothetical protein  27.71 
 
 
209 aa  76.3  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000960503  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0029  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  28 
 
 
211 aa  75.9  0.0000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3116  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  31.58 
 
 
220 aa  73.6  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431062  hitchhiker  0.00109121 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1933  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  27.08 
 
 
211 aa  72.4  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1744  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  29.53 
 
 
223 aa  69.7  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0309934  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0225  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  28.74 
 
 
213 aa  69.7  0.00000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1402  hypothetical protein  24.54 
 
 
210 aa  66.6  0.0000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.492641  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4183  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  26.01 
 
 
226 aa  65.5  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1184  hypothetical protein  25 
 
 
210 aa  64.3  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482246  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1487  Zn-dependent hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  28.14 
 
 
212 aa  63.9  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0613  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  26.45 
 
 
214 aa  63.2  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.093402  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17310  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold protein  26.15 
 
 
212 aa  62  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1093  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold protein  23.96 
 
 
211 aa  62  0.000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1211  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  23.61 
 
 
210 aa  61.2  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000127632  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0050  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  26.63 
 
 
210 aa  58.2  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000302941  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0622  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  28.25 
 
 
202 aa  56.6  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1599  Zn-dependent hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  20.5 
 
 
243 aa  50.8  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0731  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold  29.21 
 
 
223 aa  47.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000173292  normal  0.767242 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2052  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  23.33 
 
 
226 aa  43.9  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0437547  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0213  conserved hypothetical protein  24.68 
 
 
211 aa  43.1  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.132572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>