47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2710 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2710  hypothetical protein  100 
 
 
290 aa  597  1e-170  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3372  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  66.16 
 
 
262 aa  375  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.323472  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2730  hypothetical protein  66.16 
 
 
262 aa  375  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4992  hypothetical protein  58.3 
 
 
255 aa  314  9e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.240402  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3370  hypothetical protein  55.17 
 
 
263 aa  309  2.9999999999999997e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.19595  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2779  twin-arginine translocation pathway signal  59.07 
 
 
255 aa  308  6.999999999999999e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4491  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  56.03 
 
 
254 aa  298  9e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0399  hypothetical protein  52.53 
 
 
250 aa  264  1e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27441  Zn-dependent hydrolase  45.74 
 
 
245 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02031  Zn-dependent hydrolase  43.52 
 
 
246 aa  171  9e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.141712  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02051  Zn-dependent hydrolase  37.2 
 
 
241 aa  169  5e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0314417  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02031  Zn-dependent hydrolase  36.19 
 
 
241 aa  166  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.041064  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0187  hypothetical protein  35.71 
 
 
241 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0306634  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02141  Zn-dependent hydrolase  34.88 
 
 
242 aa  160  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2448  hypothetical protein  37.84 
 
 
240 aa  155  5.0000000000000005e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2129  hypothetical protein  40.41 
 
 
240 aa  154  2e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1161  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  35.52 
 
 
228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.412204  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0717  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  34.22 
 
 
208 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0741  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  33.69 
 
 
208 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0613  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  31.34 
 
 
214 aa  112  5e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.093402  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0225  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  29.91 
 
 
213 aa  110  3e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1487  Zn-dependent hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  31.05 
 
 
212 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1093  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold protein  31.05 
 
 
211 aa  107  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0029  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  29.19 
 
 
211 aa  105  6e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1184  hypothetical protein  30.92 
 
 
210 aa  103  3e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482246  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1933  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  28.25 
 
 
211 aa  103  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17310  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold protein  30.32 
 
 
212 aa  102  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2962  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  31.05 
 
 
220 aa  102  9e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00091403  hitchhiker  0.0000171806 
 
 
-
 
NC_002936  DET1402  hypothetical protein  28.5 
 
 
210 aa  97.8  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.492641  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2419  hypothetical protein  28.9 
 
 
209 aa  97.8  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000960503  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1211  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  28.5 
 
 
210 aa  94  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000127632  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3116  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  29.33 
 
 
220 aa  93.2  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431062  hitchhiker  0.00109121 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0072  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.6 
 
 
215 aa  92  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0050  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.73 
 
 
210 aa  89.7  6e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000302941  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0731  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold  27.98 
 
 
223 aa  82  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000173292  normal  0.767242 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1599  Zn-dependent hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  25.21 
 
 
243 aa  80.1  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1744  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  33.33 
 
 
223 aa  77  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0309934  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2755  putative zinc-dependent hydrolase  26.61 
 
 
217 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.332124  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2441  zinc-dependent hydrolase, putative  26.15 
 
 
217 aa  73.2  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4183  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  23.48 
 
 
226 aa  65.9  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2052  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  26.18 
 
 
226 aa  63.2  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0437547  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3012  putative Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold family  25 
 
 
229 aa  56.6  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.47572  normal  0.288675 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2220  beta-lactamase domain-containing protein  30.05 
 
 
225 aa  54.7  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0622  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.78 
 
 
202 aa  53.5  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1443  beta-lactamase domain protein  28.36 
 
 
224 aa  47.4  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.995838  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1310  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  32.58 
 
 
195 aa  46.2  0.0006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0262357  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0300  metal-dependent hydrolase  22.86 
 
 
225 aa  43.9  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>