128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A1563 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A0135  polyketide synthase  100 
 
 		 530 aa  1087    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.474232  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1238  polyketide synthase  94.72 
 
 		 530 aa  1030    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1644  metallo-beta-lactamase family protein  99.81 
 
 		 530 aa  1085    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1563  metallo-beta-lactamase family protein  100 
 
 		 530 aa  1087    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.177034  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3062  hypothetical protein  44.55 
 
 		 534 aa  426  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.838657  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2096  beta-lactamase domain-containing protein  42.23 
 
 		 535 aa  404  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.894663  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3422  beta-lactamase domain protein  41.68 
 
 		 535 aa  379  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0195853  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03728  hypothetical protein  40.93 
 
 		 537 aa  374  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.42275 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5192  hypothetical protein  39.48 
 
 		 541 aa  371  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  0.107608 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6475  beta-lactamase domain-containing protein  39.85 
 
 		 538 aa  360  5e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0511  beta-lactamase-like  27.62 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.187629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12530  hypothetical protein  32.09 
 
 		 361 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4699  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  26.61 
 
 		 367 aa  67.8  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1139  hypothetical protein  31.71 
 
 		 362 aa  67  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0356  twin-arginine translocation pathway signal  27.97 
 
 		 353 aa  65.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1801  beta-lactamase domain protein  29.15 
 
 		 330 aa  62  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5728  hypothetical protein  25.13 
 
 		 377 aa  61.2  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.340151 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2411  beta-lactamase domain-containing protein  29.41 
 
 		 353 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670149  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2809  hypothetical protein  28.12 
 
 		 335 aa  58.9  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2454  outer membrane protein RomA  25.25 
 
 		 320 aa  58.9  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.023558  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2601  outer membrane protein RomA  26.18 
 
 		 320 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000137657 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1399  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  28.8 
 
 		 354 aa  58.5  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0621512  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2703  hypothetical protein  27.13 
 
 		 320 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000340422 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0248  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 353 aa  57.4  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1708  hypothetical protein  23.62 
 
 		 358 aa  57.4  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0557  hypothetical protein  33.33 
 
 		 334 aa  57  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.653533 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2708  outer membrane protein RomA  26.7 
 
 		 320 aa  57  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2503  hypothetical protein  26.18 
 
 		 320 aa  57  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00407253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2688  hypothetical protein  26.18 
 
 		 320 aa  57  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2184  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.41 
 
 		 549 aa  57  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2464  outer membrane protein  37.35 
 
 		 159 aa  56.2  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000287892  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1210  hypothetical protein  35.71 
 
 		 358 aa  56.6  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00957617  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0218  twin-arginine translocation pathway signal  27.68 
 
 		 351 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.161292  hitchhiker  0.0076706 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1916  putative lipoprotein  21.33 
 
 		 361 aa  55.5  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0602  hypothetical protein  33.59 
 
 		 336 aa  56.2  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17819  normal  0.329897 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3326  putative lipoprotein  27.51 
 
 		 335 aa  55.5  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0155  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  32.18 
 
 		 380 aa  55.5  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00273299  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1704  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  24.51 
 
 		 385 aa  55.5  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.800105  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0952  hypothetical protein  26.8 
 
 		 332 aa  55.1  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.47256  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0298  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  24.35 
 
 		 362 aa  55.1  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0369  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  34.85 
 
 		 330 aa  54.7  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.704278 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0835  putative Zn-dependent hydrolase  26.8 
 
 		 332 aa  55.1  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1910  beta-lactamase domain protein  26.63 
 
 		 652 aa  54.3  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000293974  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1677  beta-lactamase domain-containing protein  26.34 
 
 		 367 aa  54.3  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0836093 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2802  beta-lactamase domain-containing protein  28.22 
 
 		 352 aa  53.9  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.502441  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2724  hypothetical protein  25.13 
 
 		 320 aa  53.9  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000835291  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0332  multidrug resistance protein RomA  32.53 
 
 		 333 aa  53.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0128421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4200  hypothetical protein  32.77 
 
 		 331 aa  53.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1044  hypothetical protein  26.9 
 
 		 296 aa  52.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.228114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1707  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  24.37 
 
 		 386 aa  52.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0163  hypothetical protein  24.31 
 
 		 440 aa  52.8  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000295747 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3346  beta-lactamase domain-containing protein  41.33 
 
 		 329 aa  52.8  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0864202 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1659  outer membrane protein  24.2 
 
 		 376 aa  52  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.276517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1685  hypothetical protein  27.59 
 
 		 303 aa  51.6  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000226604  hitchhiker  0.00000586595 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3094  hypothetical protein  25.56 
 
 		 337 aa  51.6  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.815715 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2206  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.1 
 
 		 516 aa  52  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0475184  normal  0.51009 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0516  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  25.84 
 
 		 590 aa  51.2  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3103  metallo-beta-lactamase superfamily protein  28.23 
 
 		 480 aa  51.2  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.588827  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3095  hypothetical protein  24.84 
 
 		 324 aa  51.2  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000159672  hitchhiker  7.43882e-22 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2131  hypothetical protein  26.45 
 
 		 354 aa  51.2  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0810  metal-dependent hydrolase  37.93 
 
 		 225 aa  50.8  0.00006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4170  hypothetical protein  30.23 
 
 		 253 aa  50.8  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2230  hypothetical protein  24.18 
 
 		 324 aa  50.8  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00325578  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3423  hypothetical protein  25.23 
 
 		 367 aa  50.4  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0456892  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3864  outer membrane protein RomA  26.32 
 
 		 369 aa  50.1  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14470  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  25.27 
 
 		 365 aa  49.7  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2358  hypothetical protein  26.4 
 
 		 324 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000948775  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2277  hypothetical protein  25.6 
 
 		 324 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00343587  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4305  hypothetical protein  24.11 
 
 		 357 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1239  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.1 
 
 		 529 aa  49.3  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8446  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  36.26 
 
 		 335 aa  49.3  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0851  hypothetical protein  19.35 
 
 		 320 aa  48.9  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.424638  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38030  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  30 
 
 		 211 aa  48.5  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4276  hypothetical protein  33.68 
 
 		 344 aa  48.5  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10098  hypothetical protein  31.91 
 
 		 377 aa  48.5  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.906022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2273  hypothetical protein  24.8 
 
 		 324 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79645e-45 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0666  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 229 aa  48.1  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389415  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0781  hypothetical protein  18.92 
 
 		 320 aa  47.8  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0380986  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0647  hypothetical protein  27.51 
 
 		 353 aa  47.8  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.151729 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2842  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.98 
 
 		 526 aa  47.8  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3601  beta-lactamase domain-containing protein  27.66 
 
 		 353 aa  47.8  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.572189  normal  0.0110578 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0658  hypothetical protein  27.51 
 
 		 353 aa  47.8  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.149707 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2965  hypothetical protein  25.76 
 
 		 252 aa  47.8  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0145434  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_003296  RS05497  hypothetical protein  24.06 
 
 		 362 aa  47.4  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.428676 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4081  putative Zn-dependent hydrolase  36.76 
 
 		 216 aa  47.4  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.921082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0449  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  21.9 
 
 		 376 aa  47.4  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2092  hypothetical protein  24.8 
 
 		 324 aa  47.4  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0491509  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2032  hypothetical protein  24.8 
 
 		 324 aa  47.4  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000509701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2247  hypothetical protein  24.8 
 
 		 324 aa  47.4  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0231046  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0936  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  29.21 
 
 		 364 aa  47  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1038  hypothetical protein  25 
 
 		 403 aa  47  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2030  hypothetical protein  21.57 
 
 		 423 aa  47  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.746583  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1615  hypothetical protein  24.39 
 
 		 388 aa  46.6  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1004  hypothetical protein  32.93 
 
 		 361 aa  47  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.546188  normal  0.659608 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2754  metallo-beta-lactamase family protein  26.72 
 
 		 342 aa  46.6  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000143801  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2484  hypothetical protein  26.61 
 
 		 328 aa  47  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.171929  normal  0.376161 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06900  hypothetical protein  26 
 
 		 248 aa  47  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6159  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like protein  23.98 
 
 		 374 aa  46.6  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.749982  normal  0.0786159 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1451  hypothetical protein  26.72 
 
 		 342 aa  46.6  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  normal  0.158925 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2071  hypothetical protein  25.21 
 
 		 324 aa  46.6  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338371  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>