110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3062 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3062  hypothetical protein  100 
 
 		 534 aa  1112    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.838657  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2096  beta-lactamase domain-containing protein  46.54 
 
 		 535 aa  500  1e-140  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.894663  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03728  hypothetical protein  46.23 
 
 		 537 aa  485  1e-136  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.42275 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5192  hypothetical protein  43.8 
 
 		 541 aa  472  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  0.107608 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3422  beta-lactamase domain protein  45.03 
 
 		 535 aa  464  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0195853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6475  beta-lactamase domain-containing protein  43.76 
 
 		 538 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0135  polyketide synthase  44.55 
 
 		 530 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.474232  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1644  metallo-beta-lactamase family protein  44.07 
 
 		 530 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1563  metallo-beta-lactamase family protein  44.55 
 
 		 530 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.177034  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1238  polyketide synthase  44.09 
 
 		 530 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12530  hypothetical protein  28.01 
 
 		 361 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1139  hypothetical protein  31.11 
 
 		 362 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0516  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  30.57 
 
 		 590 aa  63.5  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0602  hypothetical protein  40.82 
 
 		 336 aa  61.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17819  normal  0.329897 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1210  hypothetical protein  39.77 
 
 		 358 aa  61.2  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00957617  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1659  outer membrane protein  28.95 
 
 		 376 aa  60.8  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.276517  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10098  hypothetical protein  29.32 
 
 		 377 aa  60.5  0.00000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.906022  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4699  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  33.33 
 
 		 367 aa  58.9  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3094  hypothetical protein  37.08 
 
 		 337 aa  58.2  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.815715 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5728  hypothetical protein  27.27 
 
 		 377 aa  57.8  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.340151 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1916  putative lipoprotein  26.34 
 
 		 361 aa  57.4  0.0000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0557  hypothetical protein  38.89 
 
 		 334 aa  57.4  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.653533 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0248  beta-lactamase domain protein  32.81 
 
 		 353 aa  57  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2809  hypothetical protein  40.26 
 
 		 335 aa  56.2  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0016  hypothetical protein  24.64 
 
 		 356 aa  55.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439945  hitchhiker  0.00397116 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1615  hypothetical protein  31.4 
 
 		 388 aa  55.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0155  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  29.46 
 
 		 380 aa  55.1  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00273299  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1463  hypothetical protein  25.68 
 
 		 383 aa  54.7  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000232167  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3326  putative lipoprotein  26.43 
 
 		 335 aa  54.7  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2131  hypothetical protein  36.05 
 
 		 354 aa  53.9  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0356  twin-arginine translocation pathway signal  30.53 
 
 		 353 aa  53.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0511  beta-lactamase-like  27.08 
 
 		 324 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.187629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1399  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  29.32 
 
 		 354 aa  52.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0621512  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8446  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  31.01 
 
 		 335 aa  52  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1708  hypothetical protein  25.3 
 
 		 358 aa  52  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2793  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  26.63 
 
 		 378 aa  51.2  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.351558 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0332  multidrug resistance protein RomA  29.79 
 
 		 333 aa  51.6  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0128421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0298  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  28.48 
 
 		 362 aa  51.2  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1704  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  26.87 
 
 		 385 aa  51.2  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.800105  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3346  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 329 aa  51.2  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0864202 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0369  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  29.82 
 
 		 330 aa  50.8  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.704278 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1004  hypothetical protein  24.37 
 
 		 361 aa  50.4  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.546188  normal  0.659608 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4200  hypothetical protein  30.89 
 
 		 331 aa  50.4  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4170  hypothetical protein  28.31 
 
 		 253 aa  50.4  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1076  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  37.04 
 
 		 419 aa  50.1  0.00009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4305  hypothetical protein  24.5 
 
 		 357 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10924  hypothetical protein  29.38 
 
 		 372 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6159  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like protein  25 
 
 		 374 aa  49.7  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.749982  normal  0.0786159 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2802  beta-lactamase domain-containing protein  30.51 
 
 		 352 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.502441  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5970  hypothetical protein  25.25 
 
 		 360 aa  50.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2469  hypothetical protein  35.8 
 
 		 353 aa  49.7  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1038  hypothetical protein  27.44 
 
 		 403 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06900  hypothetical protein  28.08 
 
 		 248 aa  48.9  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2071  hypothetical protein  36.99 
 
 		 324 aa  49.3  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338371  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2206  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.23 
 
 		 516 aa  48.9  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0475184  normal  0.51009 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2358  hypothetical protein  34.57 
 
 		 324 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000948775  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3095  hypothetical protein  36.36 
 
 		 324 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000159672  hitchhiker  7.43882e-22 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2273  hypothetical protein  35.06 
 
 		 324 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79645e-45 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2047  beta-lactamase domain protein  24.78 
 
 		 363 aa  49.3  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517312 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2646  hypothetical protein  28.06 
 
 		 335 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2277  hypothetical protein  36.36 
 
 		 324 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00343587  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0218  twin-arginine translocation pathway signal  26.25 
 
 		 351 aa  48.5  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.161292  hitchhiker  0.0076706 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2230  hypothetical protein  33.33 
 
 		 324 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00325578  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14470  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  24.56 
 
 		 365 aa  48.5  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2092  hypothetical protein  35.06 
 
 		 324 aa  48.1  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0491509  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2032  hypothetical protein  35.06 
 
 		 324 aa  48.1  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000509701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2247  hypothetical protein  35.06 
 
 		 324 aa  48.1  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0231046  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2708  outer membrane protein RomA  33.72 
 
 		 320 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3103  metallo-beta-lactamase superfamily protein  30.4 
 
 		 480 aa  48.1  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.588827  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2965  hypothetical protein  34.52 
 
 		 252 aa  47.8  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0145434  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2916  hypothetical protein  30.85 
 
 		 336 aa  47.8  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0163  hypothetical protein  25.52 
 
 		 440 aa  47.4  0.0006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000295747 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2030  hypothetical protein  35.06 
 
 		 423 aa  47.4  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.746583  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1640  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  26.87 
 
 		 325 aa  47.4  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.3963  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2484  hypothetical protein  35.06 
 
 		 328 aa  47.4  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.171929  normal  0.376161 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2411  beta-lactamase domain-containing protein  36.36 
 
 		 353 aa  47.4  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670149  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1122  Beta-lactamase-like  26.47 
 
 		 325 aa  47  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1649  beta-lactamase domain-containing protein  30.12 
 
 		 324 aa  46.6  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000196619  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0647  hypothetical protein  30.25 
 
 		 353 aa  46.2  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.151729 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4276  hypothetical protein  33.68 
 
 		 344 aa  46.6  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0626  beta-lactamase domain protein  30.95 
 
 		 353 aa  46.6  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2601  outer membrane protein RomA  31.4 
 
 		 320 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000137657 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0781  hypothetical protein  20.3 
 
 		 320 aa  45.4  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0380986  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1801  beta-lactamase domain protein  36.36 
 
 		 330 aa  45.8  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2703  hypothetical protein  30.23 
 
 		 320 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000340422 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1520  hypothetical protein  29.03 
 
 		 308 aa  45.8  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0215  beta-lactamase domain protein  25.61 
 
 		 409 aa  45.8  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6004  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  25.51 
 
 		 374 aa  45.1  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.829765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1707  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  24.75 
 
 		 386 aa  45.1  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5759  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  25.51 
 
 		 374 aa  45.1  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.774373 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1327  Zn-dependent hydrolase  25.15 
 
 		 351 aa  45.1  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0851  hypothetical protein  20.4 
 
 		 320 aa  45.1  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.424638  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2464  outer membrane protein  32.14 
 
 		 159 aa  45.1  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000287892  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4430  hypothetical protein  26.95 
 
 		 372 aa  45.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3314  twin-arginine translocation pathway signal  31.31 
 
 		 344 aa  44.7  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.837429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4517  hypothetical protein  26.95 
 
 		 372 aa  45.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1677  beta-lactamase domain-containing protein  25.27 
 
 		 367 aa  44.7  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0836093 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13852  hypothetical protein  27.54 
 
 		 516 aa  45.1  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.559931 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2503  hypothetical protein  31.4 
 
 		 320 aa  44.3  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00407253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2688  hypothetical protein  31.4 
 
 		 320 aa  44.3  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>