57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2206 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2206  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
516 aa  1077    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0475184  normal  0.51009 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1239  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  70.13 
 
 
529 aa  759    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884178 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1330  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  70.71 
 
 
529 aa  761    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2842  Rieske (2Fe-2S) domain protein  51.78 
 
 
526 aa  538  9.999999999999999e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0156  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  50.48 
 
 
525 aa  522  1e-147  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5114  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  51.55 
 
 
516 aa  522  1e-147  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.363505  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5026  Rieske (2Fe-2S) region  51.55 
 
 
516 aa  522  1e-147  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.276564  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5407  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  51.36 
 
 
516 aa  521  1e-146  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2184  Rieske (2Fe-2S) domain protein  48.34 
 
 
549 aa  513  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1152  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  50.48 
 
 
521 aa  511  1e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.142651  normal  0.0715031 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5657  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  49.43 
 
 
520 aa  511  1e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.302322  normal  0.203451 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0188  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  49.17 
 
 
548 aa  503  1e-141  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13852  hypothetical protein  48.47 
 
 
516 aa  496  1e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.559931 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0116  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.28 
 
 
481 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420174  normal  0.988969 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0163  hypothetical protein  25.4 
 
 
440 aa  87.8  4e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000295747 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1515  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.45 
 
 
469 aa  81.6  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08671  hypothetical protein  29.81 
 
 
479 aa  61.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0459434  unclonable  0.0000000643383 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2965  hypothetical protein  33.33 
 
 
252 aa  57.4  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0145434  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1644  metallo-beta-lactamase family protein  28.1 
 
 
530 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1563  metallo-beta-lactamase family protein  28.1 
 
 
530 aa  52  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.177034  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0135  polyketide synthase  28.1 
 
 
530 aa  52  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.474232  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1238  polyketide synthase  27.27 
 
 
530 aa  50.4  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03728  hypothetical protein  32.41 
 
 
537 aa  50.1  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.42275 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2809  hypothetical protein  36.05 
 
 
335 aa  50.1  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3062  hypothetical protein  26.23 
 
 
534 aa  48.9  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.838657  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06900  hypothetical protein  32.94 
 
 
248 aa  48.9  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3515  hypothetical protein  25.27 
 
 
434 aa  46.6  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0602  hypothetical protein  35.23 
 
 
336 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17819  normal  0.329897 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0516  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  28.18 
 
 
590 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3422  beta-lactamase domain protein  24.84 
 
 
535 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0195853  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5192  hypothetical protein  24.42 
 
 
541 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  0.107608 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2030  hypothetical protein  35.8 
 
 
423 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.746583  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6475  beta-lactamase domain-containing protein  26.81 
 
 
538 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3095  hypothetical protein  34.57 
 
 
324 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000159672  hitchhiker  7.43882e-22 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3437  beta-lactamase-like  26.29 
 
 
233 aa  45.8  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2230  hypothetical protein  35.8 
 
 
324 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00325578  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2358  hypothetical protein  35.8 
 
 
324 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000948775  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5678  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  42.59 
 
 
408 aa  45.1  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000120872  normal  0.0293014 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1175  Phthalate 4,5-dioxygenase  45.24 
 
 
452 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.769494  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0557  hypothetical protein  37.8 
 
 
334 aa  45.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.653533 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5901  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  42.59 
 
 
408 aa  45.1  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00683325  hitchhiker  0.00740172 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2688  Rieske (2Fe-2S) protein  33 
 
 
352 aa  45.4  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1399  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  32.61 
 
 
354 aa  45.4  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0621512  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2277  hypothetical protein  34.57 
 
 
324 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00343587  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1073  metal-dependent hydrolase  31.01 
 
 
227 aa  44.7  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.316137  normal  0.112797 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1687  Rieske (2Fe-2S) domain protein  50 
 
 
449 aa  44.3  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1445  Rieske (2Fe-2S) protein  45.45 
 
 
437 aa  44.3  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.491711  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2273  hypothetical protein  34.57 
 
 
324 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79645e-45 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0511  beta-lactamase-like  32.03 
 
 
324 aa  43.9  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.187629  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2786  beta-lactamase domain-containing protein  30.86 
 
 
225 aa  43.9  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.480164  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0218  twin-arginine translocation pathway signal  29.69 
 
 
351 aa  43.9  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.161292  hitchhiker  0.0076706 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2268  Rieske (2Fe-2S) protein  45.24 
 
 
452 aa  43.9  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0946291  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2071  hypothetical protein  34.57 
 
 
324 aa  43.9  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338371  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2247  hypothetical protein  34.57 
 
 
324 aa  43.5  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0231046  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8462  Rieske (2Fe-2S) domain protein  45.24 
 
 
448 aa  43.5  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2032  hypothetical protein  34.57 
 
 
324 aa  43.5  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000509701  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2092  hypothetical protein  34.57 
 
 
324 aa  43.5  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0491509  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>