69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5192 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2096  beta-lactamase domain-containing protein  57.52 
 
 		 535 aa  652    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.894663  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5192  hypothetical protein  100 
 
 		 541 aa  1122    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  0.107608 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3422  beta-lactamase domain protein  62.26 
 
 		 535 aa  678    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0195853  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03728  hypothetical protein  50.94 
 
 		 537 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.42275 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6475  beta-lactamase domain-containing protein  43.1 
 
 		 538 aa  477  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3062  hypothetical protein  43.8 
 
 		 534 aa  472  1e-132  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.838657  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1563  metallo-beta-lactamase family protein  39.48 
 
 		 530 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.177034  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0135  polyketide synthase  39.48 
 
 		 530 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.474232  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1238  polyketide synthase  38.52 
 
 		 530 aa  367  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1644  metallo-beta-lactamase family protein  39.48 
 
 		 530 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12530  hypothetical protein  28.66 
 
 		 361 aa  63.9  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1916  putative lipoprotein  24.25 
 
 		 361 aa  60.5  0.00000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1139  hypothetical protein  28.03 
 
 		 362 aa  60.1  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0332  multidrug resistance protein RomA  27.04 
 
 		 333 aa  56.6  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0128421  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2663  Zn-dependent hydrolase  26.29 
 
 		 351 aa  55.5  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.880125  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5728  hypothetical protein  33.33 
 
 		 377 aa  55.1  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.340151 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4699  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  35.04 
 
 		 367 aa  55.1  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1659  outer membrane protein  27.18 
 
 		 376 aa  53.1  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.276517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0511  beta-lactamase-like  34.15 
 
 		 324 aa  52  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.187629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1615  hypothetical protein  26.26 
 
 		 388 aa  52  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10098  hypothetical protein  29.03 
 
 		 377 aa  52  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.906022  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0155  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  32.22 
 
 		 380 aa  51.6  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00273299  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05497  hypothetical protein  24.12 
 
 		 362 aa  51.2  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.428676 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0851  hypothetical protein  23.47 
 
 		 320 aa  51.2  0.00005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.424638  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0016  hypothetical protein  22.5 
 
 		 356 aa  50.8  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439945  hitchhiker  0.00397116 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2047  beta-lactamase domain protein  28.04 
 
 		 363 aa  49.7  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517312 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0298  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  28.4 
 
 		 362 aa  49.7  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2646  hypothetical protein  26.23 
 
 		 335 aa  49.7  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0248  beta-lactamase domain protein  37.62 
 
 		 353 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1004  hypothetical protein  25.39 
 
 		 361 aa  49.7  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.546188  normal  0.659608 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3094  hypothetical protein  35.16 
 
 		 337 aa  49.3  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.815715 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0773  outer membrane protein expression inhibitor  27.55 
 
 		 375 aa  49.3  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000136723 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2131  hypothetical protein  33.33 
 
 		 354 aa  48.9  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1210  hypothetical protein  30 
 
 		 358 aa  49.3  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00957617  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1038  hypothetical protein  24.81 
 
 		 403 aa  47.4  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0218  twin-arginine translocation pathway signal  32.98 
 
 		 351 aa  47.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.161292  hitchhiker  0.0076706 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0163  hypothetical protein  28.43 
 
 		 440 aa  47.4  0.0007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000295747 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4170  hypothetical protein  24.6 
 
 		 253 aa  47.4  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0491  beta-lactamase domain-containing protein  27.01 
 
 		 227 aa  47.4  0.0007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1520  hypothetical protein  26.39 
 
 		 308 aa  47.4  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1327  Zn-dependent hydrolase  25.53 
 
 		 351 aa  47.4  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0516  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  24.07 
 
 		 590 aa  47  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0356  twin-arginine translocation pathway signal  34.65 
 
 		 353 aa  47  0.0009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0341  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  24.75 
 
 		 291 aa  46.2  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1463  hypothetical protein  25.82 
 
 		 383 aa  46.6  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000232167  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06900  hypothetical protein  24.03 
 
 		 248 aa  46.6  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2277  hypothetical protein  27.63 
 
 		 324 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00343587  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1284  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  30.59 
 
 		 393 aa  46.2  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.893751  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2358  hypothetical protein  29.25 
 
 		 324 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000948775  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2965  hypothetical protein  24 
 
 		 252 aa  46.6  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0145434  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4081  putative Zn-dependent hydrolase  36.36 
 
 		 216 aa  45.8  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.921082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2206  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.42 
 
 		 516 aa  45.8  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0475184  normal  0.51009 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8446  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  23.98 
 
 		 335 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4200  hypothetical protein  34.88 
 
 		 331 aa  45.8  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2184  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.7 
 
 		 549 aa  45.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0602  hypothetical protein  32.99 
 
 		 336 aa  45.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17819  normal  0.329897 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3346  beta-lactamase domain-containing protein  34.83 
 
 		 329 aa  45.1  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0864202 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2834  beta-lactamase domain-containing protein  25.19 
 
 		 329 aa  45.1  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1451  hypothetical protein  25.19 
 
 		 342 aa  45.4  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  normal  0.158925 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1399  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.69 
 
 		 354 aa  45.4  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0621512  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2754  metallo-beta-lactamase family protein  25.19 
 
 		 342 aa  45.4  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000143801  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0781  hypothetical protein  21.6 
 
 		 320 aa  45.1  0.004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0380986  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1715  metal-dependent hydrolase  26.23 
 
 		 234 aa  44.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.207116 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2469  hypothetical protein  32.94 
 
 		 353 aa  44.7  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3103  metallo-beta-lactamase superfamily protein  25.11 
 
 		 480 aa  44.3  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.588827  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2030  hypothetical protein  26.97 
 
 		 423 aa  43.9  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.746583  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0515  beta-lactamase domain-containing protein  37.88 
 
 		 211 aa  43.9  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0557  hypothetical protein  32.97 
 
 		 334 aa  43.5  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.653533 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2823  beta-lactamase domain-containing protein  27.41 
 
 		 332 aa  43.5  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00166686  hitchhiker  0.00150789 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>