46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13852 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0156  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  71.95 
 
 
525 aa  790    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13852  hypothetical protein  100 
 
 
516 aa  1068    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.559931 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1152  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  84.01 
 
 
521 aa  914    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.142651  normal  0.0715031 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5407  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  83.43 
 
 
516 aa  911    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5657  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  83.43 
 
 
520 aa  907    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.302322  normal  0.203451 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5114  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  83.43 
 
 
516 aa  911    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.363505  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5026  Rieske (2Fe-2S) region  83.43 
 
 
516 aa  911    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.276564  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0188  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  66.97 
 
 
548 aa  752    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1239  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  50.76 
 
 
529 aa  514  1e-144  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884178 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1330  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  50.57 
 
 
529 aa  514  1e-144  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2206  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  48.47 
 
 
516 aa  508  9.999999999999999e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0475184  normal  0.51009 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2842  Rieske (2Fe-2S) domain protein  52.37 
 
 
526 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2184  Rieske (2Fe-2S) domain protein  45.42 
 
 
549 aa  449  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0116  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.66 
 
 
481 aa  106  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420174  normal  0.988969 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1515  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  29.78 
 
 
469 aa  95.5  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0163  hypothetical protein  23.68 
 
 
440 aa  93.6  7e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000295747 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08671  hypothetical protein  26.98 
 
 
479 aa  59.7  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0459434  unclonable  0.0000000643383 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3095  hypothetical protein  40.74 
 
 
324 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000159672  hitchhiker  7.43882e-22 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2358  hypothetical protein  40.74 
 
 
324 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000948775  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2071  hypothetical protein  40.74 
 
 
324 aa  53.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338371  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2230  hypothetical protein  39.51 
 
 
324 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00325578  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2030  hypothetical protein  40.74 
 
 
423 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.746583  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2277  hypothetical protein  39.51 
 
 
324 aa  51.6  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00343587  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2273  hypothetical protein  39.51 
 
 
324 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79645e-45 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2092  hypothetical protein  39.51 
 
 
324 aa  50.8  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0491509  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2032  hypothetical protein  39.51 
 
 
324 aa  50.8  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000509701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2247  hypothetical protein  39.51 
 
 
324 aa  50.8  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0231046  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0162  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.68 
 
 
98 aa  48.5  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000163908 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1649  beta-lactamase domain-containing protein  31.43 
 
 
324 aa  47.8  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000196619  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6475  beta-lactamase domain-containing protein  31.15 
 
 
538 aa  47.4  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3062  phthalate 4,5-dioxygenase  58.54 
 
 
431 aa  47  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.021682 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0516  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  31.68 
 
 
590 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3515  hypothetical protein  28.17 
 
 
434 aa  45.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1813  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.43 
 
 
309 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06900  hypothetical protein  31.03 
 
 
248 aa  45.4  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3062  hypothetical protein  27.54 
 
 
534 aa  45.4  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.838657  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1644  metallo-beta-lactamase family protein  27.74 
 
 
530 aa  44.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1563  metallo-beta-lactamase family protein  27.74 
 
 
530 aa  45.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.177034  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0135  polyketide synthase  27.74 
 
 
530 aa  45.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.474232  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2965  hypothetical protein  33.33 
 
 
252 aa  44.7  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0145434  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1399  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  37.5 
 
 
354 aa  44.7  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0621512  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0835  putative Zn-dependent hydrolase  38.57 
 
 
332 aa  44.3  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1576  Rieske (2Fe-2S) region  51.35 
 
 
358 aa  44.7  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.221742  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0952  hypothetical protein  38.57 
 
 
332 aa  44.3  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.47256  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2809  hypothetical protein  34.88 
 
 
335 aa  43.9  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03728  hypothetical protein  32.67 
 
 
537 aa  43.9  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.42275 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>