35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1239 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1239  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 		 529 aa  1094    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884178 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1330  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  95.65 
 
 		 529 aa  1059    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2206  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  70.13 
 
 		 516 aa  759    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0475184  normal  0.51009 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5114  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  53.44 
 
 		 516 aa  531  1e-150  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.363505  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5026  Rieske (2Fe-2S) region  53.44 
 
 		 516 aa  531  1e-150  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.276564  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5407  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  53.24 
 
 		 516 aa  530  1e-149  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0156  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  50 
 
 		 525 aa  523  1e-147  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1152  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  51.52 
 
 		 521 aa  519  1e-146  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.142651  normal  0.0715031 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5657  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  51.52 
 
 		 520 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.302322  normal  0.203451 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0188  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  49.18 
 
 		 548 aa  505  9.999999999999999e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13852  hypothetical protein  50.76 
 
 		 516 aa  503  1e-141  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.559931 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2842  Rieske (2Fe-2S) domain protein  52.65 
 
 		 526 aa  504  1e-141  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2184  Rieske (2Fe-2S) domain protein  46.76 
 
 		 549 aa  471  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0116  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.36 
 
 		 481 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420174  normal  0.988969 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0163  hypothetical protein  23.69 
 
 		 440 aa  87.4  6e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000295747 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1515  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.45 
 
 		 469 aa  75.1  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08671  hypothetical protein  22.39 
 
 		 479 aa  72  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0459434  unclonable  0.0000000643383 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3515  hypothetical protein  29.03 
 
 		 434 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3062  phthalate 4,5-dioxygenase  58.54 
 
 		 431 aa  50.1  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.021682 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1563  metallo-beta-lactamase family protein  28.1 
 
 		 530 aa  49.3  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.177034  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1644  metallo-beta-lactamase family protein  28.1 
 
 		 530 aa  49.3  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0135  polyketide synthase  28.1 
 
 		 530 aa  49.3  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.474232  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1238  polyketide synthase  28.1 
 
 		 530 aa  48.1  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2516  Rieske (2Fe-2S) domain protein  51.22 
 
 		 326 aa  47.8  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00793645  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0162  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.84 
 
 		 98 aa  47  0.0008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000163908 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06900  hypothetical protein  33.33 
 
 		 248 aa  47  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2688  Rieske (2Fe-2S) protein  32.41 
 
 		 352 aa  45.8  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03728  hypothetical protein  30.58 
 
 		 537 aa  44.7  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.42275 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3422  beta-lactamase domain protein  24.84 
 
 		 535 aa  44.3  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0195853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1687  Rieske (2Fe-2S) domain protein  48.78 
 
 		 449 aa  44.3  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1708  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  40 
 
 		 113 aa  44.3  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.78764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8462  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.81 
 
 		 448 aa  44.3  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40637  predicted protein  40 
 
 		 510 aa  44.3  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1286  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  41.03 
 
 		 104 aa  43.9  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1445  Rieske (2Fe-2S) protein  44.44 
 
 		 437 aa  43.9  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.491711  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>