20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4819 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_4819  hypothetical protein  100 
 
 
293 aa  574  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0330621  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4733  hypothetical protein  100 
 
 
293 aa  574  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.633267  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5118  hypothetical protein  94.86 
 
 
306 aa  549  1e-155  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.525966  normal  0.805269 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1449  hypothetical protein  70.79 
 
 
305 aa  397  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.735502 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13610  hypothetical protein  66.67 
 
 
306 aa  395  1e-109  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.831469  normal  0.423606 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5335  hypothetical protein  69.2 
 
 
304 aa  389  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3581  beta-lactamase domain protein  65.52 
 
 
306 aa  373  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.764764  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0341  beta-lactamase domain protein  51.22 
 
 
310 aa  271  7e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0372  hypothetical protein  39.78 
 
 
320 aa  212  7e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.301877  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2990  hypothetical protein  33.2 
 
 
312 aa  89.4  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.3627  normal  0.116693 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2991  beta-lactamase domain-containing protein  26.32 
 
 
275 aa  67.4  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.59321  normal  0.0179831 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2990  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 
318 aa  57.4  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.718381  normal  0.0201833 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1327  Zn-dependent hydrolase  25.54 
 
 
351 aa  47  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2663  Zn-dependent hydrolase  24.82 
 
 
351 aa  45.8  0.0009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.880125  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33300  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  24.51 
 
 
315 aa  45.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0118  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  28.52 
 
 
353 aa  45.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0215  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 
409 aa  44.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14470  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  30.07 
 
 
365 aa  43.5  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3434  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  53.06 
 
 
800 aa  43.5  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.242762  normal  0.0166392 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1127  beta-lactamase domain protein  29.01 
 
 
274 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.852965  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>