36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0372 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0372  hypothetical protein  100 
 
 		 320 aa  649    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.301877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0341  beta-lactamase domain protein  40.2 
 
 		 310 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5118  hypothetical protein  40.69 
 
 		 306 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.525966  normal  0.805269 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3581  beta-lactamase domain protein  40.58 
 
 		 306 aa  218  7.999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.764764  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13610  hypothetical protein  39.34 
 
 		 306 aa  215  8e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.831469  normal  0.423606 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4733  hypothetical protein  39.78 
 
 		 293 aa  212  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.633267  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4819  hypothetical protein  39.78 
 
 		 293 aa  212  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0330621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5335  hypothetical protein  39.46 
 
 		 304 aa  211  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1449  hypothetical protein  38.74 
 
 		 305 aa  211  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.735502 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2991  beta-lactamase domain-containing protein  28.46 
 
 		 275 aa  90.5  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.59321  normal  0.0179831 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2990  beta-lactamase domain-containing protein  26.67 
 
 		 318 aa  89.7  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.718381  normal  0.0201833 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2990  hypothetical protein  24.56 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.3627  normal  0.116693 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33300  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  21.32 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3334  Beta-lactamase-like  33.68 
 
 		 245 aa  52.8  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.973711  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5227  beta-lactamase domain protein  27.39 
 
 		 224 aa  50.1  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1645  hypothetical protein  23.08 
 
 		 223 aa  49.3  0.00009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.787985 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3518  beta-lactamase domain protein  29.22 
 
 		 552 aa  48.9  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000333928  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4450  hypothetical protein  25.71 
 
 		 270 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1863  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.95 
 
 		 260 aa  47.4  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255866  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1936  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  28.95 
 
 		 257 aa  47.4  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2496  hypothetical protein  22.63 
 
 		 277 aa  47  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3467  beta-lactamase domain protein  25.37 
 
 		 243 aa  46.6  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.407477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0923  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.84 
 
 		 260 aa  46.2  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.319486  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4326  beta-lactamase-like  34.09 
 
 		 265 aa  45.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.111759  normal  0.502915 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5004  beta-lactamase domain-containing protein  34.74 
 
 		 317 aa  45.8  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331086  normal  0.0887437 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1084  beta-lactamase domain protein  38.16 
 
 		 302 aa  45.1  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1021  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  23.74 
 
 		 312 aa  45.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3484  beta-lactamase-like protein  31.58 
 
 		 248 aa  44.3  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0631  beta-lactamase domain protein  28.41 
 
 		 265 aa  43.9  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1895  beta-lactamase domain-containing protein  28.71 
 
 		 261 aa  43.5  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3973  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 252 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3617  beta-lactamase domain-containing protein  26.43 
 
 		 244 aa  43.5  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2063  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.15 
 
 		 255 aa  43.1  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.136922  hitchhiker  0.00967552 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0795  beta-lactamase-like  24.65 
 
 		 395 aa  43.1  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0893314  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0171  beta-lactamase domain protein  26.96 
 
 		 266 aa  42.7  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.389307  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0643  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  24.75 
 
 		 354 aa  42.7  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>