109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2990 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2990  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
318 aa  653    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.718381  normal  0.0201833 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2991  beta-lactamase domain-containing protein  56.3 
 
 
275 aa  322  7e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.59321  normal  0.0179831 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33300  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  39.62 
 
 
315 aa  207  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0372  hypothetical protein  26.67 
 
 
320 aa  89.7  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.301877  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2990  hypothetical protein  29.44 
 
 
312 aa  80.9  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.3627  normal  0.116693 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0341  beta-lactamase domain protein  27.2 
 
 
310 aa  71.2  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1763  metal-dependent hydrolase  27.41 
 
 
229 aa  68.2  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1797  metal-dependent hydrolase  27.41 
 
 
229 aa  68.2  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13610  hypothetical protein  25 
 
 
306 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.831469  normal  0.423606 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1127  beta-lactamase domain protein  29.11 
 
 
274 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.852965  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1196  beta-lactamase domain protein  28.99 
 
 
274 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1068  Beta-lactamase-like  29.41 
 
 
274 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5118  hypothetical protein  25.42 
 
 
306 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.525966  normal  0.805269 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5227  beta-lactamase domain protein  25.5 
 
 
224 aa  60.5  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5335  hypothetical protein  23.69 
 
 
304 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1271  hypothetical protein  24.16 
 
 
220 aa  58.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.384497  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3581  beta-lactamase domain protein  23.01 
 
 
306 aa  58.9  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.764764  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3716  metal-dependent hydrolase  24.17 
 
 
230 aa  57.4  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0583  beta-lactamase domain protein  26.75 
 
 
225 aa  57.8  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4733  hypothetical protein  27.27 
 
 
293 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.633267  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4819  hypothetical protein  27.27 
 
 
293 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0330621  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1073  metal-dependent hydrolase  30.23 
 
 
227 aa  57  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.316137  normal  0.112797 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2229  beta-lactamase domain-containing protein  30.3 
 
 
230 aa  56.6  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0154515  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0574  beta-lactamase domain-containing protein  24.91 
 
 
230 aa  55.8  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.087898  normal  0.169456 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0803  metal-dependent hydrolase  28.15 
 
 
237 aa  55.8  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000737495 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2268  metallo beta lactamase superfamily protein  26.25 
 
 
230 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0834784  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0942  beta-lactamase domain-containing protein  26.25 
 
 
230 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0652855  normal  0.381593 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1524  beta-lactamase domain-containing protein  24.32 
 
 
285 aa  54.3  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1261  beta-lactamase-like protein  36.78 
 
 
242 aa  53.5  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.191714  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1420  hypothetical protein  34.88 
 
 
547 aa  53.5  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128957  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1769  metal-dependent hydrolase  29.01 
 
 
234 aa  53.1  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0315  metal-dependent hydrolase  27.08 
 
 
223 aa  52.8  0.000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00468893  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3467  beta-lactamase domain protein  34.23 
 
 
243 aa  52.8  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.407477  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3437  beta-lactamase-like  36.67 
 
 
233 aa  52.8  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1920  beta-lactamase-like  35.23 
 
 
230 aa  52.4  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.74415 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3945  beta-lactamase domain-containing protein  28.89 
 
 
244 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.24739  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3617  beta-lactamase domain-containing protein  24.9 
 
 
244 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3346  beta-lactamase domain-containing protein  27.74 
 
 
329 aa  52  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0864202 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0741  beta-lactamase domain protein  34.83 
 
 
232 aa  52  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0221035 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1725  beta-lactamase domain protein  35.63 
 
 
235 aa  52.4  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12233  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4324  beta-lactamase-like  35.56 
 
 
273 aa  51.6  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0635  metal-dependent hydrolase  26.92 
 
 
226 aa  51.2  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000707665  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0171  beta-lactamase domain protein  33.91 
 
 
266 aa  51.6  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.389307  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1270  metal-dependent hydrolase  27.01 
 
 
229 aa  50.8  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0151  metallo-beta-lactamase family protein  24.07 
 
 
240 aa  50.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0810  metal-dependent hydrolase  28.57 
 
 
225 aa  50.4  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2788  UPF0173 metal-dependent hydrolase  30.68 
 
 
230 aa  49.7  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2407  beta-lactamase domain protein  24.47 
 
 
233 aa  50.1  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000667891  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1074  metal-dependent hydrolase  28.57 
 
 
225 aa  49.7  0.00007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0942  metal-dependent hydrolase  33.33 
 
 
234 aa  49.7  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.338724  normal  0.244099 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1653  metal-dependent hydrolase  40.85 
 
 
226 aa  49.7  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.348192  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1587  metal-dependent hydrolase  40.85 
 
 
226 aa  49.3  0.00008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.725937  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0081  beta-lactamase domain-containing protein  25.37 
 
 
239 aa  49.3  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.316272  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1348  metal-dependent hydrolase  26.67 
 
 
225 aa  49.3  0.00009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.324127  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2125  metal-dependent hydrolase  25.5 
 
 
226 aa  48.9  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.192097  normal  0.207518 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2220  beta-lactamase domain-containing protein  24.46 
 
 
225 aa  48.5  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0962  beta-lactamase domain protein  27.82 
 
 
230 aa  48.9  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3518  beta-lactamase domain protein  38.46 
 
 
552 aa  48.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000333928  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0627  beta-lactamase domain protein  26.12 
 
 
555 aa  48.1  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.223093  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0767  metal-dependent hydrolase  29.53 
 
 
226 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1443  beta-lactamase domain protein  25.32 
 
 
224 aa  47  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.995838  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0306  beta-lactamase domain protein  22.94 
 
 
227 aa  47  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0645  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  33.72 
 
 
564 aa  46.2  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000101529  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0545  hypothetical protein  24.73 
 
 
223 aa  46.2  0.0007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0125992 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0557  hypothetical protein  26.37 
 
 
334 aa  46.2  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.653533 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1287  beta-lactamase superfamily hydrolase  29.89 
 
 
230 aa  46.2  0.0008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.66334  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1819  hypothetical protein  24.86 
 
 
223 aa  45.4  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0878  hypothetical protein  23.92 
 
 
244 aa  45.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4343  beta-lactamase domain-containing protein  32.18 
 
 
236 aa  45.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585725  normal  0.230491 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0248  beta-lactamase domain protein  38.46 
 
 
353 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1347  beta-lactamase domain protein  32.58 
 
 
248 aa  45.4  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0129245  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1715  metal-dependent hydrolase  29.89 
 
 
234 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.207116 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1774  beta-lactamase domain protein  32.56 
 
 
239 aa  45.4  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.613108  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0511  beta-lactamase-like  34.38 
 
 
324 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.187629  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1449  hypothetical protein  23.36 
 
 
305 aa  45.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.735502 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1460  beta-lactamase domain protein  34.15 
 
 
566 aa  45.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1519  metal-dependent hydrolase  29.55 
 
 
234 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.835845 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2724  beta-lactamase domain protein  25.18 
 
 
240 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2696  metal-dependent hydrolase  33.33 
 
 
226 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0291  beta-lactamase domain protein  31.03 
 
 
227 aa  44.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1740  metal-dependent hydrolase  28.74 
 
 
228 aa  44.3  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0849685  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3315  beta-lactamase domain protein  31.03 
 
 
236 aa  44.3  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1772  beta-lactamase domain protein  33.75 
 
 
555 aa  43.9  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0198506  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00690  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold  31.3 
 
 
215 aa  44.3  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2750  beta-lactamase domain protein  23.41 
 
 
237 aa  44.3  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.435711  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1827  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 
555 aa  43.9  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4747  metal-dependent hydrolase  30.68 
 
 
227 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4507  metal-dependent hydrolase  31.03 
 
 
227 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4343  metal-dependent hydrolase  30.68 
 
 
227 aa  43.9  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4860  metal-dependent hydrolase  31.03 
 
 
227 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0218  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 
351 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.161292  hitchhiker  0.0076706 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4333  beta-lactamase domain-containing protein  23.1 
 
 
241 aa  43.9  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4729  metal-dependent hydrolase  31.03 
 
 
227 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1493  metal-dependent hydrolase  23.97 
 
 
228 aa  43.5  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.264611  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0369  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  35.9 
 
 
330 aa  43.1  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.704278 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0947  beta-lactamase domain protein  30 
 
 
555 aa  43.1  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164083  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6275  hypothetical protein  21.48 
 
 
281 aa  43.1  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1009  hypothetical protein  28.42 
 
 
238 aa  43.1  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0580203  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2786  beta-lactamase domain-containing protein  28.74 
 
 
225 aa  43.1  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.480164  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2373  beta-lactamase domain protein  30.56 
 
 
445 aa  42.7  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.151302  normal  0.285639 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>