30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5657 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0156  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  72.21 
 
 
525 aa  797    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0188  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  67.4 
 
 
548 aa  753    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13852  hypothetical protein  83.43 
 
 
516 aa  889    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.559931 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1152  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  90.77 
 
 
521 aa  986    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.142651  normal  0.0715031 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5407  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  86.35 
 
 
516 aa  943    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5657  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
520 aa  1075    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.302322  normal  0.203451 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5114  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  86.15 
 
 
516 aa  941    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.363505  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5026  Rieske (2Fe-2S) region  86.15 
 
 
516 aa  941    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.276564  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1330  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  51.52 
 
 
529 aa  519  1e-146  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1239  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  51.52 
 
 
529 aa  518  1.0000000000000001e-145  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884178 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2206  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  49.43 
 
 
516 aa  511  1e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0475184  normal  0.51009 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2842  Rieske (2Fe-2S) domain protein  52.35 
 
 
526 aa  499  1e-140  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2184  Rieske (2Fe-2S) domain protein  45.94 
 
 
549 aa  463  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0116  Rieske (2Fe-2S) domain protein  23.57 
 
 
481 aa  94.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420174  normal  0.988969 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0163  hypothetical protein  23.93 
 
 
440 aa  91.7  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000295747 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1515  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  29.71 
 
 
469 aa  89  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08671  hypothetical protein  25.67 
 
 
479 aa  61.6  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0459434  unclonable  0.0000000643383 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3515  hypothetical protein  32.86 
 
 
434 aa  52.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0162  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.67 
 
 
98 aa  51.2  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000163908 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0576  Rieske (2Fe-2S) region  55.26 
 
 
323 aa  47.4  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3062  phthalate 4,5-dioxygenase  52.5 
 
 
431 aa  46.2  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.021682 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3095  hypothetical protein  37.04 
 
 
324 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000159672  hitchhiker  7.43882e-22 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2358  hypothetical protein  37.04 
 
 
324 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000948775  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2071  hypothetical protein  37.04 
 
 
324 aa  45.1  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338371  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2230  hypothetical protein  35.8 
 
 
324 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00325578  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2030  hypothetical protein  37.04 
 
 
423 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.746583  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4325  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  42 
 
 
369 aa  44.7  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6475  beta-lactamase domain-containing protein  28.93 
 
 
538 aa  44.3  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2596  beta-lactamase domain protein  29.49 
 
 
236 aa  43.5  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.477747  normal  0.239808 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2277  hypothetical protein  35.8 
 
 
324 aa  43.5  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00343587  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>