245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0586 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0586  Rieske 2Fe-2S family protein  100 
 
 
104 aa  216  7.999999999999999e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2045  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  55.88 
 
 
103 aa  130  7.999999999999999e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.294291  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2847  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.78 
 
 
120 aa  92.4  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.15292  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3558  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.83 
 
 
111 aa  89  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4634  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.83 
 
 
111 aa  89  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1314  Rieske (2Fe-2S) region  39.42 
 
 
111 aa  88.6  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0871721 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1765  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.1 
 
 
112 aa  88.2  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.538609  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0930  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.24 
 
 
112 aa  88.2  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00957645 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3342  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.2 
 
 
131 aa  85.9  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.139334  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4027  hypothetical protein  34.65 
 
 
110 aa  83.6  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.307444 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2541  benzene/toluene monooxygenase ferredoxin subunit  36.89 
 
 
111 aa  81.6  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.558987 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5677  Rieske (2Fe-2S) region  34.95 
 
 
116 aa  81.3  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0225  Rieske 2Fe-2S family protein  36.63 
 
 
108 aa  80.1  0.000000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0375984  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3818  Rieske (2Fe-2S) region  34.95 
 
 
111 aa  78.2  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0794094  normal  0.0599225 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0816  benzene/toluene monooxygenase ferredoxin subunit  38.24 
 
 
111 aa  76.6  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4301  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.31 
 
 
111 aa  75.1  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.828362  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6713  putative ferredoxin  40.74 
 
 
96 aa  73.9  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.491449  normal  0.188584 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4859  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34 
 
 
122 aa  65.1  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0807982  normal  0.0317192 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0213  Rieske (2Fe-2S) protein  30.69 
 
 
126 aa  61.2  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.225427 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1780  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  37.04 
 
 
105 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.307476  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1076  putative Rieske (2Fe-2S) family protein  31.48 
 
 
356 aa  57.8  0.00000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.329475  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2516  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.33 
 
 
326 aa  57  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00793645  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7180  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.56 
 
 
114 aa  57  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.602112 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0544  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
127 aa  57  0.00000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.478802  normal  0.402117 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23360  assimilatory nitrite reductase, small subunit  37.84 
 
 
108 aa  54.3  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0534419  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2741  cytochrome P450  35.62 
 
 
599 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25917  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1113  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  33.33 
 
 
120 aa  53.9  0.0000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3526  assimilatory nitrite reductase small subunit  35.14 
 
 
108 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5690  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38 
 
 
104 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0215436 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41540  assimilatory nitrite reductase small subunit  35.14 
 
 
108 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.369116  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0807  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  37.74 
 
 
331 aa  53.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2308  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  30.86 
 
 
110 aa  52.8  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.619497  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3621  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40 
 
 
377 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14640  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  33.96 
 
 
112 aa  52.8  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.857724  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0669  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  37.1 
 
 
123 aa  51.2  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.163122  normal  0.0446226 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2095  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  33.33 
 
 
108 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0602377  normal  0.0657417 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2815  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.21 
 
 
107 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.717991 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0591  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  36.84 
 
 
118 aa  49.7  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1996  nitrite reductase  26.37 
 
 
118 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0459175  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0780  rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.29 
 
 
100 aa  49.7  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.12357  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2145  nitrite reductase [NAD(P)H] small subunit  26.37 
 
 
118 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1445  Rieske (2Fe-2S) protein  34.02 
 
 
437 aa  50.1  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.491711  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0648  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.29 
 
 
361 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.149026 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0659  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.29 
 
 
361 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.210033 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1596  toluene-4-monooxygenase system protein C  29.35 
 
 
117 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6323  Rieske (2Fe-2S) region  33.73 
 
 
101 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0576  Rieske (2Fe-2S) region  34.25 
 
 
323 aa  49.3  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6044  Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase-like protein  38.16 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3163  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  24.73 
 
 
105 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.33632  normal  0.290875 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0914  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.41 
 
 
518 aa  48.9  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0653376  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0627  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.29 
 
 
361 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0396  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.96 
 
 
360 aa  48.5  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.547393 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1969  nitrite reductase (NAD(P)H)  25.27 
 
 
105 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.595397  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1948  nitrite reductase  25.27 
 
 
105 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0102  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.99 
 
 
354 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.178853  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3413  vanillate monooxygenase  39.39 
 
 
345 aa  48.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2176  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  25.27 
 
 
105 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1989  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  25.27 
 
 
104 aa  48.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1136  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.58 
 
 
373 aa  48.1  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  0.28876 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3458  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  36.99 
 
 
354 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.28008  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1661  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  36.99 
 
 
354 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3880  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  36.99 
 
 
354 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3962  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  36.99 
 
 
354 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3092  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  36.99 
 
 
354 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2672  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.14 
 
 
110 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2292  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  27.38 
 
 
105 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0130  Rieske (2Fe-2S) protein  32.04 
 
 
106 aa  47.8  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2768  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.9 
 
 
109 aa  47.4  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2673  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  33.33 
 
 
649 aa  47.4  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2166  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.53 
 
 
123 aa  47.4  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.112377 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1967  Rieske (2Fe-2S) region  30.67 
 
 
96 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0966264  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1996  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.67 
 
 
100 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.664018  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4115  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  33.85 
 
 
127 aa  47.4  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.063358  normal  0.0248701 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4419  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  29.67 
 
 
367 aa  47  0.00009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5508  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  32.04 
 
 
104 aa  47  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.358971 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1911  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.67 
 
 
100 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5354  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.93 
 
 
370 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.111829  normal  0.289416 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  30.59 
 
 
334 aa  46.6  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3308  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.78 
 
 
513 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.705785 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1457  MocE Rieske (2Fe-2S)  28.57 
 
 
103 aa  46.2  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.768182 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4275  Rieske (2Fe-2S) region  37.1 
 
 
106 aa  46.2  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2821  Rieske (2Fe-2S) region  31.87 
 
 
102 aa  47  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0808  carboxymuconolactone decarboxylase  33.77 
 
 
211 aa  47  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4451  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  36.07 
 
 
111 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.468725  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2369  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.29 
 
 
285 aa  47  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.010436 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3969  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30 
 
 
105 aa  46.2  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0167  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.78 
 
 
109 aa  46.2  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000930652 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0481  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  36.23 
 
 
353 aa  47  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0971818  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1989  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  29.07 
 
 
104 aa  45.4  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1088  ferredoxin subunit of A ring-hydroxylating dioxygenase oxidoreductase protein  31.87 
 
 
103 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.173698  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2239  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
350 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0991  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  30.56 
 
 
103 aa  45.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.220686  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0207  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  26.03 
 
 
105 aa  45.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2677  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  26.83 
 
 
101 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0396  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  36.36 
 
 
125 aa  45.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.7121  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5415  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40 
 
 
521 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.792379  normal  0.597511 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1196  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.37 
 
 
289 aa  45.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1161  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.96 
 
 
374 aa  45.8  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000071782  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0622  putative Rieske (2Fe-2S) protein  41.51 
 
 
314 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0948094 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2151  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  27.54 
 
 
105 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.981833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>