More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2871 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2871  Rieske (2Fe-2S) region  100 
 
 
292 aa  568  1e-161  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1196  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.71 
 
 
289 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3428  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.38 
 
 
296 aa  147  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4533  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.98 
 
 
294 aa  139  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441672  normal  0.86514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4000  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  42.75 
 
 
322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0895  hypothetical protein  33.45 
 
 
315 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0773726  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0232  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
303 aa  116  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4736  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  35.5 
 
 
293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4812  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.96 
 
 
304 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0333  Rieske (2Fe-2S) protein  35.46 
 
 
298 aa  108  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0125  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.63 
 
 
277 aa  103  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.249783 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4823  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  33.22 
 
 
285 aa  103  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0513  Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase-like protein  36.15 
 
 
303 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2673  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  32 
 
 
270 aa  93.2  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0819  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.23 
 
 
294 aa  90.9  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1919  hypothetical protein  35.57 
 
 
221 aa  82  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.90171  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1008  hypothetical protein  33.75 
 
 
189 aa  71.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2739  hypothetical protein  36.73 
 
 
189 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.504849 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0987  Rieske 2Fe-2S family protein  38.83 
 
 
106 aa  68.9  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02690  hypothetical protein  41.28 
 
 
224 aa  67.8  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.1579  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5415  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.3 
 
 
521 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.792379  normal  0.597511 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0716  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.38 
 
 
105 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.025133  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1673  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  45.45 
 
 
110 aa  67  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.314946  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0167  Rieske (2Fe-2S) region  36.36 
 
 
119 aa  67  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0716  hypothetical protein  32.34 
 
 
185 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.158068  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0722  hypothetical protein  32.34 
 
 
185 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2821  Rieske (2Fe-2S) region  39 
 
 
102 aa  65.5  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0736  hypothetical protein  32.34 
 
 
185 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.141568 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2226  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.82 
 
 
114 aa  65.1  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000457155  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1987  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  42.86 
 
 
108 aa  64.3  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20170  hypothetical protein  34.25 
 
 
176 aa  63.5  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0976183  normal  0.0396109 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2820  membrane protein-like protein  35.62 
 
 
175 aa  63.5  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0311  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.22 
 
 
105 aa  63.2  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.021793 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1482  Rieske (2Fe-2S) region  39 
 
 
110 aa  63.2  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14640  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  38.78 
 
 
112 aa  62.8  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.857724  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2444  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.58 
 
 
117 aa  62.4  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.44307  normal  0.0794581 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0914  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.46 
 
 
518 aa  61.6  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0653376  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2708  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39 
 
 
107 aa  62  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1306  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.18 
 
 
146 aa  60.8  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1282  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.04 
 
 
137 aa  61.2  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.580287  normal  0.705623 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03310  conserved hypothetical protein  36.36 
 
 
585 aa  60.8  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3081  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.74 
 
 
114 aa  60.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0978825  normal  0.175913 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3755  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.56 
 
 
290 aa  60.5  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5941  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.02 
 
 
526 aa  60.1  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4301  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.73 
 
 
111 aa  60.1  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.828362  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13360  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  42.55 
 
 
122 aa  60.1  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.823074  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0308  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.79 
 
 
102 aa  60.1  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.359094 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1910  Rieske (2Fe-2S) domain protein  45.33 
 
 
171 aa  59.7  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0215924  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1985  putative dioxygenase  44.05 
 
 
110 aa  59.7  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51691  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3308  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.68 
 
 
114 aa  60.1  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000504578 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1197  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  37.93 
 
 
112 aa  59.7  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.430122  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4275  Rieske (2Fe-2S) region  34.07 
 
 
106 aa  59.7  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0991  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  35.29 
 
 
103 aa  59.7  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.220686  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0893  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.35 
 
 
504 aa  59.3  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.6615 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0242  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.45 
 
 
179 aa  58.5  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0648  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.47 
 
 
361 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.149026 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0659  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.47 
 
 
361 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.210033 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1502  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.35 
 
 
105 aa  58.5  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.165892 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2106  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  33.67 
 
 
127 aa  58.5  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0298831  normal  0.595074 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3243  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  42.42 
 
 
102 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.680425  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3012  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.19 
 
 
96 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.123081 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3979  hypothetical protein  35.77 
 
 
162 aa  57.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3232  Rieske (2Fe-2S) region  42.42 
 
 
102 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3294  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  42.42 
 
 
102 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.11925 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2338  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.86 
 
 
113 aa  57.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.700788 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2209  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.36 
 
 
106 aa  57.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.149896  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3214  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36 
 
 
137 aa  57  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.18886 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2153  hypothetical protein  34.88 
 
 
153 aa  57  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0271  putative dioxygenase ferredoxin subunit  34.34 
 
 
102 aa  57  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1314  Rieske (2Fe-2S) region  29.13 
 
 
111 aa  56.6  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0871721 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2135  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.46 
 
 
116 aa  57  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2840  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  34.02 
 
 
129 aa  56.6  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.41626 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3163  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  34.65 
 
 
105 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.33632  normal  0.290875 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1694  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.66 
 
 
105 aa  56.2  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0627  Rieske (2Fe-2S) domain protein  44.64 
 
 
361 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2594  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  37.23 
 
 
140 aa  55.8  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.101505 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0858  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.58 
 
 
301 aa  55.8  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1989  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  34.65 
 
 
104 aa  55.8  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0710  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  34.58 
 
 
296 aa  55.8  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2166  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.39 
 
 
123 aa  55.8  0.0000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.112377 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3205  nitrogen-fixing NifU-like  34.74 
 
 
311 aa  55.8  0.0000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12990  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  34.34 
 
 
170 aa  55.8  0.0000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0363688  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1329  putative dioxygenase, ferredoxin reductase component  38.64 
 
 
521 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0248077 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3462  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.79 
 
 
116 aa  55.5  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2329  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  32.99 
 
 
129 aa  55.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1038  hypothetical protein  31.95 
 
 
180 aa  55.5  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0538  Rieske (2Fe-2S) region  40.57 
 
 
131 aa  54.7  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.520467  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2292  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  34 
 
 
105 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2879  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.68 
 
 
107 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.388175  normal  0.0551812 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1112  hypothetical protein  28.12 
 
 
195 aa  54.7  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.900973  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2105  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32 
 
 
118 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2961  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  36.26 
 
 
111 aa  55.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01479  dioxygenase, ferredoxin reductase component, putative  36.14 
 
 
559 aa  54.3  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1327  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.33 
 
 
106 aa  54.7  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0198751  normal  0.195781 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0250  hypothetical protein  27.72 
 
 
189 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.960554 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0780  rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.64 
 
 
100 aa  54.3  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.12357  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1969  nitrite reductase (NAD(P)H)  34 
 
 
105 aa  54.3  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.595397  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1948  nitrite reductase  34 
 
 
105 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3621  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.68 
 
 
377 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2176  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  34 
 
 
105 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>