50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0722 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008705  Mkms_0736  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.141568 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0722  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0716  hypothetical protein  99.46 
 
 		 185 aa  362  1e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.158068  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2118  hypothetical protein  59.88 
 
 		 173 aa  154  8e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2153  hypothetical protein  45.58 
 
 		 153 aa  105  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3979  hypothetical protein  40.56 
 
 		 162 aa  96.7  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2820  membrane protein-like protein  38.71 
 
 		 175 aa  86.7  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6294  hypothetical protein  38.73 
 
 		 162 aa  84.3  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.47453  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3478  hypothetical protein  39.87 
 
 		 175 aa  81.3  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4131  Protein of unknown function DUF2231, transmembrane  36.3 
 
 		 165 aa  78.6  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.159201 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4364  hypothetical protein  39.86 
 
 		 168 aa  78.6  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.801295  normal  0.025652 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0125  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.99 
 
 		 277 aa  77.4  0.00000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249783 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2708  hypothetical protein  33.77 
 
 		 173 aa  75.1  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3428  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.55 
 
 		 296 aa  74.3  0.0000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1196  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.91 
 
 		 289 aa  73.6  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1428  hypothetical protein  36.43 
 
 		 170 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.536406 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0895  hypothetical protein  38.52 
 
 		 315 aa  70.9  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0773726  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2673  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  34.29 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1447  hypothetical protein  33.33 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2790  hypothetical protein  32.19 
 
 		 173 aa  68.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.49529 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1008  hypothetical protein  32.72 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0124  hypothetical protein  32.65 
 
 		 171 aa  67  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.658752  normal  0.409828 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1488  hypothetical protein  28.99 
 
 		 180 aa  65.9  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2739  hypothetical protein  30 
 
 		 189 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.504849 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20170  hypothetical protein  38.68 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0976183  normal  0.0396109 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1387  membrane protein  32.34 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4533  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.12 
 
 		 294 aa  61.2  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441672  normal  0.86514 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2915  hypothetical protein  32.26 
 
 		 154 aa  60.5  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.39688 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1919  hypothetical protein  30.46 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.90171  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11160  hypothetical protein  31.21 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0258  hypothetical protein  30.07 
 
 		 153 aa  51.6  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0232  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.11 
 
 		 303 aa  50.4  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02690  hypothetical protein  33.33 
 
 		 224 aa  50.1  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.1579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2570  membrane protein-like  32.39 
 
 		 185 aa  48.9  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4736  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  32.45 
 
 		 293 aa  48.9  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4823  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  32.95 
 
 		 285 aa  47.8  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1038  hypothetical protein  33.77 
 
 		 180 aa  47.8  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0270  hypothetical protein  32.12 
 
 		 189 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0260  hypothetical protein  32.12 
 
 		 189 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.075822  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0250  hypothetical protein  32.12 
 
 		 189 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.960554 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4000  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.82 
 
 		 322 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2265  membrane protein-like protein  32.61 
 
 		 152 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.560629  normal  0.0217418 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01474  membrane protein-like protein  28.57 
 
 		 156 aa  43.9  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2871  Rieske (2Fe-2S) region  32.34 
 
 		 292 aa  43.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0799  hypothetical protein  24.46 
 
 		 161 aa  43.1  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4812  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.33 
 
 		 304 aa  43.5  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0333  Rieske (2Fe-2S) protein  34.31 
 
 		 298 aa  43.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1782  hypothetical protein  33.1 
 
 		 151 aa  42.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.811236  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0513  Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase-like protein  31.96 
 
 		 303 aa  42  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0429  hypothetical protein  31.69 
 
 		 151 aa  41.6  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.055069  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>