144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0232 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0232  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
303 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0513  Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase-like protein  67.88 
 
 
303 aa  353  2e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4812  Rieske (2Fe-2S) domain protein  58.19 
 
 
304 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3428  Rieske (2Fe-2S) domain protein  47.75 
 
 
296 aa  277  1e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0333  Rieske (2Fe-2S) protein  53.05 
 
 
298 aa  241  7.999999999999999e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0895  hypothetical protein  45.96 
 
 
315 aa  232  6e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0773726  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4736  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  42.7 
 
 
293 aa  188  9e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4823  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  42.35 
 
 
285 aa  180  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0819  Rieske (2Fe-2S) domain protein  45.77 
 
 
294 aa  180  2.9999999999999997e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4533  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.8 
 
 
294 aa  162  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441672  normal  0.86514 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1196  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.33 
 
 
289 aa  151  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4000  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.97 
 
 
322 aa  130  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2871  Rieske (2Fe-2S) region  33.33 
 
 
292 aa  105  7e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0260  hypothetical protein  38.51 
 
 
189 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.075822  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0270  hypothetical protein  38.51 
 
 
189 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0250  hypothetical protein  38.51 
 
 
189 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.960554 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2739  hypothetical protein  36.05 
 
 
189 aa  100  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.504849 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1008  hypothetical protein  35.58 
 
 
189 aa  97.1  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1919  hypothetical protein  40.3 
 
 
221 aa  91.3  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.90171  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0125  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.91 
 
 
277 aa  89.4  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.249783 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2673  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  28.69 
 
 
270 aa  88.2  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02690  hypothetical protein  38.96 
 
 
224 aa  73.6  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.1579  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20170  hypothetical protein  36.69 
 
 
176 aa  69.7  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0976183  normal  0.0396109 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1038  hypothetical protein  36.48 
 
 
180 aa  67.4  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2066  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  32.35 
 
 
121 aa  65.1  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1112  hypothetical protein  34.18 
 
 
195 aa  63.9  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.900973  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2675  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.66 
 
 
506 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.148641  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3175  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.42 
 
 
506 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0759164  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2541  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.38 
 
 
506 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1258  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.46 
 
 
119 aa  60.8  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0240354  hitchhiker  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0124  hypothetical protein  34.75 
 
 
171 aa  60.8  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.658752  normal  0.409828 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5941  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.29 
 
 
526 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2820  membrane protein-like protein  30.71 
 
 
175 aa  58.5  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2821  Rieske (2Fe-2S) region  32.61 
 
 
102 aa  58.5  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0716  hypothetical protein  31.11 
 
 
185 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.158068  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5152  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.49 
 
 
108 aa  58.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0722  hypothetical protein  31.11 
 
 
185 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0736  hypothetical protein  31.11 
 
 
185 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.141568 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0987  Rieske 2Fe-2S family protein  33.33 
 
 
106 aa  57  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1970  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.04 
 
 
109 aa  57  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.311023 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0469  putative nitrogen-fixing NifU, Rieske (2Fe-2S) region  29.57 
 
 
289 aa  56.6  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.483541  normal  0.014762 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5415  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.91 
 
 
521 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.792379  normal  0.597511 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0490  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  33.96 
 
 
109 aa  55.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0205  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  33.96 
 
 
109 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0981  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  33.96 
 
 
109 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1380  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, ferredoxin subunit  33.96 
 
 
109 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.186781  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1577  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, ferredoxin subunit  33.96 
 
 
109 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.869936  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2705  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, ferredoxin subunit  33.96 
 
 
109 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2561  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, ferredoxin subunit  33.96 
 
 
109 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0236  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, ferredoxin subunit  33.96 
 
 
109 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3214  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.72 
 
 
137 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.18886 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1662  Rieske (2Fe-2S) protein  32 
 
 
125 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.282248  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3123  Rieske (2Fe-2S) protein  29.9 
 
 
349 aa  54.3  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00337014  normal  0.164048 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5985  Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase-like protein  31.37 
 
 
105 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  0.294982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2526  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  29.73 
 
 
350 aa  54.3  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.672374  normal  0.0193911 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1987  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.37 
 
 
108 aa  53.9  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2392  protein of unknown function DUF59  29.63 
 
 
238 aa  53.1  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09103  apoptosis-inducing factor (Eurofung)  34.18 
 
 
561 aa  53.1  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0266985  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2708  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.6 
 
 
107 aa  53.1  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0181  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.72 
 
 
509 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.529445  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4955  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.71 
 
 
108 aa  52.8  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.519732  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0566  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.29 
 
 
523 aa  52.4  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1110  anthranilate dioxygenase ferredoxin reductase(AndAb)  35.71 
 
 
107 aa  52.4  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.662253  normal  0.22099 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2118  hypothetical protein  31.51 
 
 
173 aa  52  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0562  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.08 
 
 
106 aa  51.2  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0914  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.85 
 
 
518 aa  51.2  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0653376  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5504  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.78 
 
 
108 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.124598  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0716  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.96 
 
 
105 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.025133  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3669  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.78 
 
 
108 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.738821 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0994  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.67 
 
 
110 aa  51.2  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.244835  normal  0.309285 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0893  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.98 
 
 
504 aa  51.6  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.6615 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1143  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  35 
 
 
103 aa  51.6  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1329  putative dioxygenase, ferredoxin reductase component  41.94 
 
 
521 aa  50.4  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0248077 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3205  nitrogen-fixing NifU-like  30 
 
 
311 aa  50.8  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4586  Rieske (2Fe-2S) region  30.84 
 
 
108 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.312616  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3777  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.84 
 
 
108 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.872692  normal  0.412492 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3746  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.84 
 
 
108 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.108566  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2226  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.41 
 
 
114 aa  50.4  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000457155  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4131  Protein of unknown function DUF2231, transmembrane  27.21 
 
 
165 aa  50.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.159201 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01479  dioxygenase, ferredoxin reductase component, putative  30.61 
 
 
559 aa  50.1  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2825  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  29.63 
 
 
358 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000971916  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1813  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.34 
 
 
309 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6022  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.35 
 
 
509 aa  49.3  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0194312 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5285  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.25 
 
 
521 aa  48.9  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2323  Rieske (2Fe-2S) protein  29.59 
 
 
108 aa  48.9  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1119  anthranilate dioxygenase ferredoxin subunit(AndAb)  33.67 
 
 
107 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3228  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  32.95 
 
 
289 aa  48.5  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.769303  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00540  hypothetical protein  48.24 
 
 
111 aa  48.5  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2693  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.71 
 
 
506 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.563055  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0296  Rieske (2Fe-2S) region  35.78 
 
 
378 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.317274  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0306  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.78 
 
 
378 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.20897 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1405  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  33.33 
 
 
140 aa  47.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0287  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.78 
 
 
378 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.831286  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3799  NifU domain-containing protein  29.57 
 
 
291 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3308  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.26 
 
 
513 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.705785 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3156  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.05 
 
 
158 aa  47  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2135  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.28 
 
 
116 aa  47  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4346  pheophorbide a oxygenase  34.25 
 
 
465 aa  46.6  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18517  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4769  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  33.33 
 
 
367 aa  46.6  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.289545  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0955  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.61 
 
 
112 aa  46.6  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>