40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_02690 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_02690  hypothetical protein  100 
 
 		 224 aa  438  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.1579  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1919  hypothetical protein  49.46 
 
 		 221 aa  150  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.90171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3428  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.24 
 
 		 296 aa  115  6e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1038  hypothetical protein  45.16 
 
 		 180 aa  103  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4812  Rieske (2Fe-2S) domain protein  48.43 
 
 		 304 aa  102  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0895  hypothetical protein  36.54 
 
 		 315 aa  100  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0773726  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1196  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.48 
 
 		 289 aa  99.4  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1112  hypothetical protein  44.44 
 
 		 195 aa  96.3  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.900973  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2739  hypothetical protein  36.6 
 
 		 189 aa  95.9  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.504849 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0232  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.96 
 
 		 303 aa  92.8  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0260  hypothetical protein  37.01 
 
 		 189 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.075822  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0270  hypothetical protein  37.01 
 
 		 189 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0250  hypothetical protein  37.01 
 
 		 189 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.960554 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4533  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.52 
 
 		 294 aa  90.9  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441672  normal  0.86514 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4736  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  37.89 
 
 		 293 aa  90.5  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4000  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.85 
 
 		 322 aa  85.9  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4823  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  37.78 
 
 		 285 aa  85.5  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0333  Rieske (2Fe-2S) protein  40.49 
 
 		 298 aa  77.4  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1008  hypothetical protein  33.87 
 
 		 189 aa  75.1  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0819  Rieske (2Fe-2S) domain protein  44.35 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20170  hypothetical protein  33.09 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0976183  normal  0.0396109 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2871  Rieske (2Fe-2S) region  38.93 
 
 		 292 aa  62.4  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0513  Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase-like protein  40.19 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0736  hypothetical protein  30.53 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.141568 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0722  hypothetical protein  30.53 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0716  hypothetical protein  30.53 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.158068  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2790  hypothetical protein  31.75 
 
 		 173 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.49529 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6294  hypothetical protein  33.67 
 
 		 162 aa  51.6  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.47453  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2820  membrane protein-like protein  28.68 
 
 		 175 aa  50.8  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2153  hypothetical protein  29.27 
 
 		 153 aa  49.7  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00540  hypothetical protein  46.15 
 
 		 111 aa  50.1  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2118  hypothetical protein  31.43 
 
 		 173 aa  48.5  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0124  hypothetical protein  30.15 
 
 		 171 aa  47.8  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.658752  normal  0.409828 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4209  major facilitator superfamily MFS_1  31.67 
 
 		 435 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2708  hypothetical protein  25.98 
 
 		 173 aa  45.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4131  Protein of unknown function DUF2231, transmembrane  26.56 
 
 		 165 aa  45.1  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.159201 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3979  hypothetical protein  29.46 
 
 		 162 aa  44.3  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2570  membrane protein-like  29.27 
 
 		 185 aa  44.7  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1387  membrane protein  30.23 
 
 		 195 aa  42.7  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3478  hypothetical protein  29.13 
 
 		 175 aa  42.4  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>