51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2118 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2118  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  334  2.9999999999999997e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0716  hypothetical protein  60.49 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.158068  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0736  hypothetical protein  59.88 
 
 		 185 aa  174  6e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.141568 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0722  hypothetical protein  59.88 
 
 		 185 aa  174  6e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2153  hypothetical protein  46.26 
 
 		 153 aa  104  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2820  membrane protein-like protein  41.96 
 
 		 175 aa  95.5  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3979  hypothetical protein  42.25 
 
 		 162 aa  93.2  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3478  hypothetical protein  36.02 
 
 		 175 aa  88.2  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4131  Protein of unknown function DUF2231, transmembrane  38.73 
 
 		 165 aa  87.4  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.159201 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0125  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.29 
 
 		 277 aa  87  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249783 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1428  hypothetical protein  37.93 
 
 		 170 aa  84.7  6e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.536406 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2790  hypothetical protein  35.62 
 
 		 173 aa  83.6  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.49529 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6294  hypothetical protein  40.14 
 
 		 162 aa  81.6  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.47453  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2708  hypothetical protein  37.86 
 
 		 173 aa  79.7  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4364  hypothetical protein  42.25 
 
 		 168 aa  79.7  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.801295  normal  0.025652 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1447  hypothetical protein  36.3 
 
 		 159 aa  75.5  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2673  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  36.96 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0258  hypothetical protein  37.24 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0124  hypothetical protein  33.1 
 
 		 171 aa  71.2  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.658752  normal  0.409828 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2915  hypothetical protein  29.81 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.39688 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1196  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.67 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1488  hypothetical protein  28.77 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3428  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.68 
 
 		 296 aa  64.7  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0895  hypothetical protein  31.29 
 
 		 315 aa  64.3  0.0000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0773726  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1387  membrane protein  32.37 
 
 		 195 aa  63.9  0.0000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1919  hypothetical protein  32.85 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.90171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2739  hypothetical protein  32.17 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.504849 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1008  hypothetical protein  28.75 
 
 		 189 aa  61.6  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20170  hypothetical protein  35.35 
 
 		 176 aa  57.4  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0976183  normal  0.0396109 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11160  hypothetical protein  30.19 
 
 		 165 aa  57  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01474  membrane protein-like protein  27.21 
 
 		 156 aa  51.6  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3826  hypothetical protein  28.39 
 
 		 171 aa  50.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.492638 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0232  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.57 
 
 		 303 aa  50.4  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0429  hypothetical protein  30.26 
 
 		 151 aa  49.3  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.055069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0250  hypothetical protein  31.85 
 
 		 189 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.960554 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0270  hypothetical protein  31.85 
 
 		 189 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0260  hypothetical protein  31.85 
 
 		 189 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.075822  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1782  hypothetical protein  29.87 
 
 		 151 aa  48.1  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.811236  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02690  hypothetical protein  31.43 
 
 		 224 aa  47.4  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.1579  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4823  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  32.14 
 
 		 285 aa  47  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2570  membrane protein-like  29.73 
 
 		 185 aa  47.4  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0513  Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase-like protein  36.26 
 
 		 303 aa  45.1  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2059  hypothetical protein  32.62 
 
 		 147 aa  45.1  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000000123784  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2265  membrane protein-like protein  30.14 
 
 		 152 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.560629  normal  0.0217418 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2316  hypothetical protein  24.32 
 
 		 164 aa  43.9  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.614466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4812  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.9 
 
 		 304 aa  43.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3895  hypothetical protein  32.19 
 
 		 186 aa  42.4  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1825  hypothetical protein  30 
 
 		 217 aa  41.2  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4736  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  27.66 
 
 		 293 aa  40.8  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4533  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.1 
 
 		 294 aa  40.8  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441672  normal  0.86514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4000  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.2 
 
 		 322 aa  40.8  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.649548 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>