29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2059 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2059  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  286  6e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000000123784  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2820  membrane protein-like protein  35.29 
 
 		 175 aa  57.4  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2153  hypothetical protein  30.83 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3478  hypothetical protein  30.71 
 
 		 175 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2790  hypothetical protein  31.88 
 
 		 173 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.49529 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11160  hypothetical protein  31.39 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3979  hypothetical protein  31.69 
 
 		 162 aa  48.9  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4131  Protein of unknown function DUF2231, transmembrane  37.18 
 
 		 165 aa  48.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.159201 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1387  membrane protein  32.79 
 
 		 195 aa  48.5  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0125  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.22 
 
 		 277 aa  48.5  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249783 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2265  membrane protein-like protein  31.39 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.560629  normal  0.0217418 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2316  hypothetical protein  32.37 
 
 		 164 aa  48.1  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.614466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2739  hypothetical protein  30.66 
 
 		 189 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.504849 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2570  membrane protein-like  32.62 
 
 		 185 aa  47.8  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1447  hypothetical protein  33.33 
 
 		 159 aa  47.4  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0895  hypothetical protein  29.93 
 
 		 315 aa  47  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0773726  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01474  membrane protein-like protein  29.08 
 
 		 156 aa  47  0.00009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2915  hypothetical protein  29.86 
 
 		 154 aa  46.2  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.39688 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0124  hypothetical protein  30.94 
 
 		 171 aa  46.2  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.658752  normal  0.409828 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0716  hypothetical protein  29.08 
 
 		 185 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.158068  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0258  hypothetical protein  30.99 
 
 		 153 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1428  hypothetical protein  31.11 
 
 		 170 aa  44.7  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.536406 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0736  hypothetical protein  29.08 
 
 		 185 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.141568 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2708  hypothetical protein  30.66 
 
 		 173 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0722  hypothetical protein  29.08 
 
 		 185 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1488  hypothetical protein  29.2 
 
 		 180 aa  43.9  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2871  Rieske (2Fe-2S) region  33.58 
 
 		 292 aa  43.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2118  hypothetical protein  32.62 
 
 		 173 aa  40.4  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3848  hypothetical protein  31.47 
 
 		 160 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>