47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4364 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4364  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  320  5e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.801295  normal  0.025652 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3979  hypothetical protein  91.36 
 
 		 162 aa  288  3e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4131  Protein of unknown function DUF2231, transmembrane  47.88 
 
 		 165 aa  147  9e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.159201 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6294  hypothetical protein  46.95 
 
 		 162 aa  133  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.47453  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2820  membrane protein-like protein  44.59 
 
 		 175 aa  117  7.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0716  hypothetical protein  40.56 
 
 		 185 aa  92  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.158068  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0722  hypothetical protein  39.86 
 
 		 185 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0736  hypothetical protein  39.86 
 
 		 185 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.141568 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1428  hypothetical protein  38.22 
 
 		 170 aa  87.4  9e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.536406 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2153  hypothetical protein  37.34 
 
 		 153 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1447  hypothetical protein  36.11 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2118  hypothetical protein  42.25 
 
 		 173 aa  76.3  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2673  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  28.77 
 
 		 270 aa  75.1  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2790  hypothetical protein  33.57 
 
 		 173 aa  73.9  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.49529 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3478  hypothetical protein  32.47 
 
 		 175 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3826  hypothetical protein  33.33 
 
 		 171 aa  72.8  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.492638 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1387  membrane protein  33.53 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2915  hypothetical protein  29.17 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.39688 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2708  hypothetical protein  31.21 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0125  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.66 
 
 		 277 aa  66.6  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249783 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2570  membrane protein-like  35.42 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3848  hypothetical protein  34.31 
 
 		 160 aa  64.3  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0157  hypothetical protein  29.58 
 
 		 160 aa  63.9  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.486831  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11160  hypothetical protein  34.23 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01474  membrane protein-like protein  30.72 
 
 		 156 aa  62  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0258  hypothetical protein  36.3 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2265  membrane protein-like protein  35.21 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.560629  normal  0.0217418 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2739  hypothetical protein  36.96 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.504849 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1008  hypothetical protein  30.14 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1488  hypothetical protein  26.24 
 
 		 180 aa  58.5  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2316  hypothetical protein  29.79 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.614466  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1919  hypothetical protein  29.17 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.90171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0895  hypothetical protein  34.06 
 
 		 315 aa  55.1  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0773726  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3428  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.99 
 
 		 296 aa  54.7  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1196  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.75 
 
 		 289 aa  52.8  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0799  hypothetical protein  24.83 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0124  hypothetical protein  26.76 
 
 		 171 aa  47.8  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.658752  normal  0.409828 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4823  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  36.67 
 
 		 285 aa  46.2  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4000  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.08 
 
 		 322 aa  45.4  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4533  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.43 
 
 		 294 aa  45.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441672  normal  0.86514 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0593  hypothetical protein  27.41 
 
 		 143 aa  43.9  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.650029 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3662  hypothetical protein  31.11 
 
 		 166 aa  43.1  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0270  hypothetical protein  31.33 
 
 		 189 aa  42  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0260  hypothetical protein  31.33 
 
 		 189 aa  42  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.075822  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2059  hypothetical protein  30.99 
 
 		 147 aa  42  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000000123784  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4736  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  35.23 
 
 		 293 aa  41.6  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0250  hypothetical protein  32.61 
 
 		 189 aa  41.6  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.960554 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>