45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0124 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0124  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  336  9.999999999999999e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.658752  normal  0.409828 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0125  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.51 
 
 		 277 aa  102  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249783 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0716  hypothetical protein  33.33 
 
 		 185 aa  68.6  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.158068  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0736  hypothetical protein  32.65 
 
 		 185 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.141568 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0722  hypothetical protein  32.65 
 
 		 185 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2790  hypothetical protein  33.1 
 
 		 173 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.49529 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1008  hypothetical protein  29.68 
 
 		 189 aa  64.3  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2153  hypothetical protein  31.79 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3478  hypothetical protein  28.3 
 
 		 175 aa  61.6  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2118  hypothetical protein  33.1 
 
 		 173 aa  60.8  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1196  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.24 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1488  hypothetical protein  32.65 
 
 		 180 aa  58.9  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3848  hypothetical protein  34.44 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4823  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  35.64 
 
 		 285 aa  58.5  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2708  hypothetical protein  27.21 
 
 		 173 aa  57.4  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2820  membrane protein-like protein  28.41 
 
 		 175 aa  57.4  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4000  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.86 
 
 		 322 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2673  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  28.95 
 
 		 270 aa  55.1  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0895  hypothetical protein  36.79 
 
 		 315 aa  54.3  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0773726  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0232  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.75 
 
 		 303 aa  53.9  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0157  hypothetical protein  32.45 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.486831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4131  Protein of unknown function DUF2231, transmembrane  25.53 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.159201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4533  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.55 
 
 		 294 aa  52  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441672  normal  0.86514 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6294  hypothetical protein  29.29 
 
 		 162 aa  52  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.47453  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0513  Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase-like protein  37.04 
 
 		 303 aa  51.6  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2739  hypothetical protein  29.45 
 
 		 189 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.504849 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20170  hypothetical protein  28.57 
 
 		 176 aa  50.8  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0976183  normal  0.0396109 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3428  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.29 
 
 		 296 aa  49.7  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4736  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  37.11 
 
 		 293 aa  49.7  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3979  hypothetical protein  28.87 
 
 		 162 aa  49.3  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0333  Rieske (2Fe-2S) protein  38.1 
 
 		 298 aa  48.1  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1428  hypothetical protein  31.68 
 
 		 170 aa  47.4  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.536406 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1447  hypothetical protein  30.67 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0260  hypothetical protein  29.14 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.075822  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0270  hypothetical protein  29.14 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2915  hypothetical protein  25.87 
 
 		 154 aa  47  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.39688 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0250  hypothetical protein  29.93 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.960554 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2316  hypothetical protein  31.17 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.614466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01474  membrane protein-like protein  28.19 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1919  hypothetical protein  31.51 
 
 		 221 aa  45.4  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.90171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3826  hypothetical protein  29.5 
 
 		 171 aa  43.9  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.492638 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02690  hypothetical protein  36.14 
 
 		 224 aa  44.3  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.1579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0258  hypothetical protein  25.69 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0819  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.33 
 
 		 294 aa  41.6  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1387  membrane protein  25.79 
 
 		 195 aa  40.8  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>